十字花科黑腐病菌一对假定双组分系统基因的功能鉴定

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31260261
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    50.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

The Gram-negative bacterium Xanthomonas campestris pv. campestris (hereafter Xcc) is the causal agent of black rot disease of cruciferous plants. The pathosystem of Xcc infecting cruciferous plants is one of the model system in studying microbe-plant interaction. The genome of Xcc 8004 harbors 110 two-component signal transduction systems (TCSs) genes, which encode histidine kinases(HKs) and response regulators (RRs) to monitor and respond to environmental stimuli. The significant similarity at both the primary sequence level and the sructure level raises the possibility of cross-talk between different TCSs, so the mechanism of signal transduction and downstream regulation is still unclear. This project will focus on in-depth study on TCSs genes XC3067/XC3068 in Xcc 8004 by using molecular and genomics approaches to elucidate the gene functions, signal transduction and regulatory networks of XC3067/XC3068. The results will not only reveal the stimuli sensing by XC3067/XC3068 but also unveil the mechanism of XC3067/XC3068 in influencing the pathogenicity of Xcc 8004. The research on XC3067/XC3068 in this study will facilitate greatly the future studies on signaling and regulatory networks of this important phytopathogenic bacterium.
十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris, Xcc)是引起十字花科植物黑腐病的病原菌,Xcc对十字花科植物的病理系统也是研究微生物与植物相互作用机理的重要模型系统之一。基因组注释表明Xcc 8004拥有110个双组份系统基因,其编码的感受子和调控子分别感受和响应外界环境的变化。由于双组份系统之间存在信号的交叉转导,因而目前对Xcc双组份系统信号转导及下游调控机制还不清晰。本项目将以Xcc 8004为实验材料,通过分子生物学及基因组学等手段,系统研究双组份系统基因XC3067/XC3068的基因功能、信号转导及调控网络。本项目研究的结果将阐明XC3067/XC3068调控Xcc致病的分子机制并明确XC3067/XC3068在Xcc致病及感受外界信号中的具体作用。该研究将为我们更进一步的研究Xcc的信号转导及调控网络提供基础。

结项摘要

十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris, Xcc)目前仍是世界上最重要的植物病原菌之一,其对十字花科植物的病理系统也是研究微生物与植物相互作用机理的重要模型系统。作为微生物最重要的信号转导系统双组分信号转导系统(Two-component signal transduction systems, TCSs),Xcc 8004中虽然有110个基因属于该系统,但仅有少数基因的功能得到鉴定。本项目系统的研究了XC3067/XC3068这一对预测的TCSs基因的功能。细菌双杂交和共转录实验结果表明XC3067/XC3068构成一对TCSs;突变研究表明该对基因与Xcc 的在寄主中的致病力、非寄主中的HR反应和游动性相关,但编码蛋白中的功能片段的缺失对表型的影响不明显;转录组分析表明XC3067/XC3068的突变体中编码鞭毛装配相关的基因在转录水平上都同时受到影响,调控子XC3067的预测的结合位点序列为[T/A]TCCC[G/C]A[T/A]TCCC[G/C]A,其中13个受其调控的鞭毛相关基因的编码区前250 bp存在该调控位点;在项目的研究中还发现另一对预测的TCSs基因XC1149/XC1150在致病和HR上有重要贡献,且该对基因的表达受hrpG和hrpX这两个三型分泌系统最重要的上游调控基因的调控。综上所述,本研究将为我们更进一步的研究Xcc的信号转导及调控网络提供基础。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
水稻细菌性条斑病菌一个新基因与致病相关
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    广西师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄胜;卢烨;朱晓琳;潘俊霞;何勇强;姜伟
  • 通讯作者:
    姜伟
野油菜黄单胞菌Xcc 8004双组分信号转导系统基因及其蛋白架构分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姚任之;唐学慧;何勇强;姜伟
  • 通讯作者:
    姜伟
水稻细菌性条斑病菌一个假定的udgH基因的功能研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    广西师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蔡文侠;黄光辉;王婷婷;付珊;何勇强;姜伟
  • 通讯作者:
    姜伟

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南海北部岸礁区海底地下水排泄的高分辨率珊瑚记录
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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