基于核酸适配体的RNA动态化学修饰研究新方法

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91753109
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

RNA dynamic modifications can affect the activity, localization as well as stability of RNAs, and have been linked with human diseases. So far, the research of RNA dynamic modifications has been hindered by the lack of proper molecular recognition and detection techniques. Aptamers are excellent molecular probes with advantages of easy synthesis, convenient modifications, high programmability, high chemical stability and low molecular weight. In this proposal, we plan to develop an aptamer-based detection platform for RNA dynamic modifications. Briefly, we will use the SELEX technique to select aptamers that can specifically recognize target RNA modification with high binding affinity. Then, we will study the molecular recognition mechanism between aptamers and their target cargos. We will use the optimized aptamers to develop new strategies for the enrichment and chemical crosslinking of specific RNA modifications. By combining with high-throughput sequencing, the transcriptome of target RNA modification will be studied. Meanwhile, we will develop aptamer-based fluorescence imaging techniques for monitoring RNA dynamic modifications in living cells. This project is expected develop a series of aptamer-based techniques for sensitively and selectively detection of RNA dynamic modifications, and will make great contributions to the achievement of the group objective.
对RNA动态化学修饰的研究可望为探索生命的本质与运行规律,发展重大疾病诊疗新方法带来新理论和新思路。本项目针对RNA化学修饰研究中缺乏有效的分子识别技术和分子检测探针的现状,拟将核酸适配体技术引入到RNA动态化学修饰研究中,通过构建高效率的核酸适配体筛选平台,筛选针对靶标RNA化学修饰高特异性、高亲和力的核酸适配体;利用筛选得到的核酸适配体,发展靶标化学修饰RNA分子的高特异性富集与高分辨率共价标记新方法,结合高通量测序技术,实现靶标化学修饰RNA图谱的精准测定;同时,发展基于核酸适配体的RNA动态化学修饰的成像新原理和新方法,以实时监测靶标化学修饰RNA分子在细胞水平上的动态分布。本项目的完成可望为RNA动态化学修饰的研究提供新的分子识别和检测技术。同时,RNA动态化学修饰研究作为生物大分子动态修饰研究的核心板块之一,本项目的顺利开展将有力地推动重大研究计划中总体目标的实现。

结项摘要

近年来,RNA化学修饰作为一种新发现的RNA参与生物调控的重要手段,在生命科学领域掀起了一股“淘金热”。对RNA动态化学修饰的研究可望为探索生命的本质与运行规律,发展重大疾病诊疗新方法带来新理论和新思路。本项目以m6A为研究切入点,构建了快速、高效的核酸适配体筛选技术平台,筛选针对m6A高特异性、高亲和力的核酸适配体;对筛选得到的核酸适配体分子组进行测序分析,获得了特异性富集的核酸适配体分子组;建立了核酸适配体与靶标分子相互作用的谱学研究方法,探讨核酸适配体的靶标识别机制;建立了核酸化学修饰新方法,设计合成了多种新型功能核酸分子,为生化分析提供了新工具;结合分子工程技术和生物纳米技术,发展了基于功能核酸的靶标动态成像新原理和新方法;获取相关生物信息,为探索靶标在病理变化中的生物功能与分子机制以及癌症等重大疾病的早期诊断和个性化治疗提供重要的技术支持。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
In Vivo Monocyte/Macrophage-Hitchhiked Intratumoral Accumulation of Nanomedicines for Enhanced Tumor Therapy
体内单核细胞/巨噬细胞搭便车在瘤内积累纳米药物以增强肿瘤治疗
  • DOI:
    10.1021/jacs.9b11046
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Journal of the American Chemical Society
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    Zheng Liyan;Hu Xiaoxiao;Wu Hui;Mo Liuting;Xie Sitao;Li Jin;Peng Cheng;Xu Shujuan;Qiu Liping;Tan Weihong
  • 通讯作者:
    Tan Weihong
Cell-Membrane-Anchored DNA Nanoplatform for Programming Cellular Interactions
用于编程细胞相互作用的细胞膜锚定 DNA 纳米平台
  • DOI:
    10.1021/jacs.9b04725
  • 发表时间:
    2019-11-13
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    Xun, Kanyu;Pei, Ke;Tan, Weihong
  • 通讯作者:
    Tan, Weihong
A molecular recognition-activatable DNA nanofirecracker enables signal-enhanced imaging in living cells
分子识别激活的 DNA 纳米爆竹能够在活细胞中实现信号增强成像
  • DOI:
    10.1039/c9cc09682e
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Xing Xiaojing;Li Jin;Qiu Liping;Tan Weihong
  • 通讯作者:
    Tan Weihong
Aptamer-Functionalized Exosomes: Elucidating the Cellular Uptake Mechanism and the Potential for Cancer-Targeted Chemotherapy
适体功能化外泌体:阐明细胞摄取机制和癌症靶向化疗的潜力
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.8b05204
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zou Jianmei;Shi Muling;Liu Xiaojing;Jin Cheng;Xing Xiaojing;Qiu Liping;Tan Weihong
  • 通讯作者:
    Tan Weihong

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融资融券交易能否降低股票市场波动性?
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    2017
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    邱丽萍
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    邱丽萍;叶阿忠
  • 通讯作者:
    叶阿忠

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邱丽萍的其他基金

基于核酸适体细胞免疫相关蛋白功能行为的动态检测与调控
  • 批准号:
  • 批准年份:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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