吸附-解吸附作用影响蛋白质结晶过程机理研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31170816
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0509.生物学过程与代谢
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

制备高质量蛋白质晶体是利用X射线单晶衍射技术解析蛋白质分子三维结构的重要环节,提高蛋白质结晶成功率及晶体质量是该环节的两个重要任务,但是二者所需的结晶条件通常是矛盾的:前者需要较高的过饱和度条件,后者则需较低的过饱和度条件。长期以来,这对矛盾一直未能得到有效解决。.申请者在前期研究中发现,将对蛋白质有吸附-解吸附作用的聚苯乙烯/二乙烯基苯(SDB)多孔微球置于蛋白质溶液中,能在溶液中形成两个浓度区间:微球表面因吸附形成的高过饱和度区间及远离微球的低过饱和度区间。该研究表明吸附-解吸附作用可解决上述过饱和度需求矛盾问题,有望实现在提高结晶成功率的同时提高晶体质量。基于此,本项目将开展如下研究:以SDB微球为切入点,研究有吸附-解吸附作用的材料影响蛋白质结晶的规律与机理,并利用该规律与机理发展新的结晶方法学途径。本项目的实施,将为寻找获取高质量蛋白质晶体的途径提供有科学意义和实际价值的参考。

结项摘要

长期以来,蛋白质结晶方法学均在为提高蛋白质结晶成功率和改善晶体质量而努力。然而,这两个目标通常不能同时实现。为了提高结晶成功率,常需较高的过饱和度以保证晶体形核成功从而得到晶体;而为了改善晶体质量,则常需晶体在较低过饱和度条件下生长,以确保蛋白质分子的高度有序堆积。.本项目针对此问题,提出的解决方案是利用对蛋白质分子有吸附-解吸附作用的材料,放置于结晶溶液中,通过吸附作用,在材料表面形成一个浓度较高的局域区间,而同时在远离材料的区域,将因吸附而出现浓度较低的局域区间。这样,就能解决通常一个溶液中难以出现两种溶液浓度的问题。在此方案基础上,项目组开展了如下研究:1)SDB微球的制备及其性能表征;2)SDB微球影响蛋白质结晶溶液浓度的规律研究;3)SDB微球影响蛋白质结晶过程的研究;4)吸附-解吸附材料影响蛋白质结晶过程的机理研究;5)利用本项目的发现提出新的结晶方法并进行验证。.通过上述工作,项目组获得了如下主要研究结果:1)SDB微球具备对蛋白质分子的吸附-解吸附功能,在向蛋白质结晶溶液添加SDB微球后,能够在SDB微球附近形成较大的浓度梯度,表明利用SDB微球能够在蛋白质结晶溶液中形成两个局域的浓度区间;2)多孔SDB微球能够显著提升蛋白质结晶的成功率,其筛选结晶条件数可达对照条件下的3.11倍,表明该材料能够有效促进蛋白质晶体的形核;3)SDB微球可影响蛋白质晶体的外观形貌,通过添加该微球,可使蛋白质晶体的光学完美度得到明显改善;4)添加SDB微球能够有效改善蛋白质晶体的质量,在研究的样品中,衍射分辨率提升幅度最大可达1.22Å;5)添加SDB微球促进形核和改善晶体质量的主要机理是SDB微球的吸附-解吸附现象导致溶液出现两个浓度区间,晶体在其中较高浓度区间形核后,将沉降到较低浓度区间长大,从而实现同时促进形核和改善晶体质量的目的;6)通过本项目研究,发展了通孔板结晶方法,可以利用相同机理实现同时促进形核和改善晶体质量的目的。.本项目的研究成果指出,利用吸附-解吸附原理可帮助在溶液中形成两个局域浓度区间,从而解决蛋白质晶体形核和生长所需浓度条件的矛盾。此发现不仅有助于人们直接利用吸附-解吸附现象发展新的蛋白质结晶方法,也有助于人们通过其他方法在溶液中营造两个浓度区间从而发展新的蛋白质结晶方法,因此本项目研究成果对发展新的结晶方法学途径有着重要的指导意义。

项目成果

期刊论文数量(36)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(20)
专利数量(12)
Progresses on crystallization methodology of membrane proteins
膜蛋白结晶方法学研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Progress in Biochemistry and Biophysics
  • 影响因子:
    0.3
  • 作者:
    Huyan T.;Zhang C. Y.;Ma X. L.;Yin D. C.
  • 通讯作者:
    Yin D. C.
强迫流动环境对蛋白质结晶的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    材料导报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    鹿芹芹;陈瑞卿;解旭卓;尹大川
  • 通讯作者:
    尹大川
A comparative study on the quality of protein crystals obtained using the cross-diffusion microbatch and sitting-drop vapor diffusion methods
交叉扩散微批量法与坐滴蒸气扩散法获得的蛋白质晶体质量的比较研究
  • DOI:
    10.1039/c5ce00551e
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    CRYSTENGCOMM
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Hou, Hai;Wang, Bo;Yin, Da-Chuan
  • 通讯作者:
    Yin, Da-Chuan
乙酰胆碱酯酶分子研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    生物技术通讯
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张辰艳;解旭卓;刘悦;尹大川
  • 通讯作者:
    尹大川
Promoting protein crystallization using a plate with simple geometry
使用具有简单几何形状的板促进蛋白质结晶
  • DOI:
    10.1107/s1399004713032100
  • 发表时间:
    2014-03-01
  • 期刊:
    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Chen, Rui-Qing;Yin, Da-Chuan;Liu, Yue
  • 通讯作者:
    Liu, Yue

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其他文献

人类天冬胺酰基β-羟化酶的表达及其单克隆抗体的制备
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    呼延霆;尹大川;王伟;宋凯;王燕;卢慧甍;杨慧;薛小平;Ting Huyan,Dachuan Yin,Wei Wang,Kai Song,Yan Wang,
  • 通讯作者:
    Ting Huyan,Dachuan Yin,Wei Wang,Kai Song,Yan Wang,
盐碱胁迫对哈茨木霉T28的生长及营养代谢的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    北京林业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尹大川;邓勋;郑宇;宋瑞清
  • 通讯作者:
    宋瑞清
梯度磁场在生物大分子研究中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘悦;吴子庆;刘雅丽;周雅青;商澎;尹大川
  • 通讯作者:
    尹大川
磁场促进生物体内氧气利用的机制及其医学应用
  • DOI:
    10.19595/j.cnki.1000-6753.tces.201254
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    电工技术学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    苑曦宸;张彬;孟智悦;王建萍;尹大川;商澎
  • 通讯作者:
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Cd胁迫下外生菌根菌对樟子松生理指标和根际土壤酶的影响
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    10.13292/j.1000-4890.201711.031
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    生态学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尹大川;邓勋;宋小双;祁金玉
  • 通讯作者:
    祁金玉

其他文献

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尹大川的其他基金

FUS蛋白液-液相分离视角下的磁物理治疗效应机制研究
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    82172063
  • 批准年份:
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面向同步辐射串行晶体学的电纺丝样品束流稳定性研究
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  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    56.0 万元
  • 项目类别:
    联合基金项目
模拟失重条件无容器蛋白质结晶过程及机理研究
  • 批准号:
    10772150
  • 批准年份:
    2007
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    面上项目
大梯度强磁场中生物大分子结晶过程研究
  • 批准号:
    30570384
  • 批准年份:
    2005
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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