固有无序蛋白模块在大豆疫霉效应子转运和功能中的作用解析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31501589
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1401.植物病理学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Intrinsically disordered proteins (IDPs) are flexible proteins which lack a stable tertiary structrue under native conditions while possessing essential biological function and unique mechanism. Phytophthora sojae produces large number of effectors to manipulate plant immunity. We found abundant disordered protein modules with unusual distribution pattern and conservation in these effectors, suggesting potential important functions. Here, two P. sojae effectors, Avr1b and Avr1k, will be studied. The mutants of N-terminal disordered modules will be constructed to investigated the influence on the translocation and binding with phosphatidylinositol. The role of disordered modules in the process of inducing ETI and ETS will be studied by constructing C-terminal disordered modules. Combined with obtained target proteins of Avr1b and Avr1k by yeast two-hybrid system, we aim to explore the influence and mechanism of disordered modules in the interaction between effectors and targets. These results will aid the understanding of function and possible mechanism of disordered modules in Phytophthora effectors, and open new avenues to explore effector mechanisms, and provide important thenretical significance to explain the molecular basis of interaction between Phytophthora and plants.
固有无序蛋白质在自然条件下呈“柔性”状态,不能独自形成稳定的三维结构,具有重要的生物学功能和独特的工作机制。疫霉菌产生大量效应子来调控植物的免疫反应,我们前期发现这些效应子中存在丰富的无序蛋白模块,其分布方式和保守性说明它们可能具有未知的重要功能。本研究拟选择大豆疫霉两个重要效应子(Avr1b和Avr1k)为对象,首先构建其N端转运区中的无序模块突变体,分析其对效应子转运和与磷脂酰肌醇结合的影响;然后构建C端功能域中无序模块突变体,分析其对诱导植物ETI和ETS发生的作用;最后结合酵母双杂交技术获得的Avr1b和Avr1k靶标蛋白,研究无序模块对其与靶标互作的影响及机制。本研究将明确这类无序模块在疫霉效应子中的功能与可能机制,在研究方法上为疫霉效应子研究提供新思路,在理论上有助于解释疫霉与寄主的分子互作基础。

结项摘要

疫霉菌是一类重要的植物病原菌,能引起农业上多种重要作物的毁灭性病害。疫霉菌能分泌大量效应子来抑制寄主植物的防卫反应,因此研究疫霉菌效应子在其与寄主互作中的功能与机制是解析该病害发生和开发病害控制措施的重要手段。本项目以无序蛋白模块为切入点,研究发现RxLR效应子含有丰富的无序蛋白,显著高于其他效应子家族。无序蛋白模块显著富集在效应子的RxLR-dEER区域,可能与效应子的转运相关;无序蛋白模块在效应子的C端功能域尤其是W/Y/L基序的含量较少。构建了PsAvh18和PcAvh207效应子C端功能域的无序蛋白模块突变体,该突变体丧失了在植物上诱导细胞死亡的能力,说明无序蛋白可能参与效应子的毒性功能。本研究在方法上为卵菌效应子研究提供新思路,在理论上有助于解释卵菌与寄主的分子互作基础。我们又研究了辣椒疫霉侵染拟南芥不同时期的转录组,发现富含无序蛋白模块的效应子在侵染阶段显著上调表达,可能参与了疫霉的致病过程。我们还研究了寄生疫霉侵染本氏烟早期的转录组,发现本氏烟的自身代谢和防卫反应相关的基因大量被激活,用来应对疫霉的侵染。以上研究成果将为效应子的机理研究提供新的思路。受本项目资助,项目负责人以第一作者或并列第一作者在《Current Genetics》、《Plant Growth Regulation》和《Fungal Biology》等国际期刊上发表SCI论文6篇。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Comparative RNA-Seq analysis of Nicotiana benthamiana in response to Phytophthora parasitica infection
本氏烟草对寄生疫霉感染的比较 RNA-Seq 分析
  • DOI:
    10.1007/s10725-016-0163-1
  • 发表时间:
    2016-03
  • 期刊:
    Plant Growth Regulation
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Shen Danyu;Chai Chunyue;Ma Lina;Zhang Meixiang;Dou Daolong
  • 通讯作者:
    Dou Daolong
Sigma factor RpoN employs a dual transcriptional regulation for controlling twitching motility and biofilm formation in Lysobacter enzymogenes OH11
Sigma 因子 RpoN 采用双重转录调控来控制溶杆菌 OH11 的抽搐运动和生物膜形成
  • DOI:
    10.1007/s00294-017-0770-z
  • 发表时间:
    2018-04-01
  • 期刊:
    CURRENT GENETICS
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Han, Sen;Shen, Danyu;Qian, Guoliang
  • 通讯作者:
    Qian, Guoliang
Development of a loop-mediated isothermal amplification method for the rapid detection of Pythium ultimum
开发用于快速检测终极腐霉的环介导等温扩增方法
  • DOI:
    10.1007/s13313-017-0517-9
  • 发表时间:
    2017-09
  • 期刊:
    Australasian Plant Pathology
  • 影响因子:
    1.4
  • 作者:
    Shen Danyu;Li Qingling;Yu Jia;Zhao Yuanyuan;Zhu Ye;Xu Heng;Dou Daolong
  • 通讯作者:
    Dou Daolong
Intrinsic disorder is a common structural characteristic of RxLR effectors in oomycete pathogens
内在紊乱是卵菌病原体中 RxLR 效应子的常见结构特征
  • DOI:
    10.1016/j.funbio.2017.07.005
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Fungal Biology
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Shen Danyu;Li Qingling;Sun Peng;Zhang Meixiang;Dou Daolong
  • 通讯作者:
    Dou Daolong
RNA-seq for comparative transcript profiling of Phytophthora capsici during its interaction with Arabidopsis thaliana
RNA-seq 用于辣椒疫霉与拟南芥相互作用过程中的比较转录谱分析
  • DOI:
    10.1016/j.pmpp.2018.03.005
  • 发表时间:
    2018-04-01
  • 期刊:
    PHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR PLANT PATHOLOGY
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Ma, Huifei;Shen, Danyu;Dou, Daolong
  • 通讯作者:
    Dou, Daolong

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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙迪;贺依琳;沈丹宇;窦道龙;田月娥
  • 通讯作者:
    田月娥
大豆中疫霉诱导性GmDRRP基因启动子的克隆与功能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林艳玲;吴育人;沈丹宇;窦道龙
  • 通讯作者:
    窦道龙

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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