微生物菊粉酶C末端结构域的功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31400047
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Inulinases are members of glycosidase hydrolase family 32,which comprise a β-propeller N-terminal catalytic domain and a C-terminal β-sandwich domain. They catalyze the hydrolysis of inulin, a plant storage polymer with linear chains of β-(2,1)-linked D-fructofuranose molecules attached to a sucrose moiety at the reducing end. Inulinases can be divided into two exo-inulinases and endo-inulinases according to hydrolysis pattern. Currently, microbial inulinases with high enzyme activity is of particular industrial interest and has received attention as a renewable raw material for biofuel and bio-chemical products production, so they play an increasingly important role in inulin application. But catalysis mechanisms of inulinases are not clear completely. Especially, the function of C-terminal domain is unknown yet. In this study, the N-terminal domain, C-terminal domain and fusion protein from exo-inulinases and endo-inulinases will be expressed, purified and characterized. By analyzing the enzymatic property, the effect of C-terminal domain on inulinase activity and the action of inulin hydrolysis will be studied. Besides, the C-terminal domain CBM function will be examined by the method of differential scanning fluorimetry. The function of microbial inulinases C-terminal domain will be ascertained in this study, and the catalysis mechanisms which focus on the C-terminal domain will be elucidated. These findings will have significance for inulinases rational designing and inulin exploitation.
菊粉酶属于糖苷水解酶GH32家族,由五叶片螺旋桨状的N末端催化结构域和β三明治状的C末端结构域组成,其作用位点为菊粉的β-2,1糖苷键,根据底物水解方式不同分为外切菊粉酶和内切菊粉酶。随着菊粉逐渐成为发酵化工产品和生物能源的重要生物质原料,菊粉酶尤其是高活力的微生物菊粉酶的研究应用日益重要。但其催化机理还不完全清楚,特别是C末端结构域的功能至今未知。本基金项目针对该科学问题,结合最新研究进展和相关工作基础,认为C末端结构域具有重要功能,然后通过缺失、置换结构域的表达策略及酶性质分析、产物层析质朴分析和差示荧光扫描技术等分析手段,研究其对酶活力、酶稳定性、水解底物特异性的影响,并研究其CBM功能,从而全面揭示C末端结构域的功能,并分析其在内切酶和外切酶的功能差异。本项目从C末端结构域功能的角度深入探究菊粉酶的催化机理,为菊粉酶的理性设计和菊芋生物质资源的开发利用提供理论依据和技术支持。

结项摘要

菊粉酶属于糖苷水解酶GH32家族,由五叶片螺旋桨状的N末端催化结构域和β三明治状的C末端结构域组成,根据底物水解方式不同分为外切菊粉酶和内切菊粉酶。近年来,菊粉逐渐成为发酵化工产品和生物能源的潜在生物质原料,菊粉酶的相关研究的研究应用日益重要。本基金项目针对功能未知的菊粉酶C末端结构域展开研究,发现其具有以下功能:(1)C末端结构域对β桶状的N末端结构域有重要的支撑作用,失去或部分C末端氨基酸后,酶活力基本丧失。(2)仅失去C末端结构域最末端的β折叠片Y544-Q556的突变酶仍具有24.8%的活力,但蛋白温度性显著下降,说明C末端结构域同时具有维持整个酶热稳定性的功能。(3)通过C末端结构的表达纯化,发现其虽然没有底物催化能力,但具有菊粉结合能力,并能影响酶的底物特异性。(4)游离C末端结构的添加可以提高菊粉外切酶的活力,推测C末端结构具有一定的底物破坏作用。此外,本项目还探究了究菊粉外切酶和内切酶的协同作用机制,并通过在产油脂酵母共表达菊粉外切酶和内切酶基因来增强菌株利用菊粉产胞内油脂的能力。研究菊粉结合结构域在融合菊粉外切酶催化过程中,通过底物临近效应,提高酶的温度性和一定的底物破坏作用来提高融合酶的催化性能。并利用项目中获得的菊粉酶内切酶基因构建可以高效生产果寡糖的Y. lipolytica工程菌株。本项目从C末端结构域功能的角度重新探究菊粉酶的催化机理,为菊粉酶的理性设计提供理论依据,同时本项目也开展了利用菊粉生产单细胞油脂和益生果寡糖的研究,为菊芋生物质资源的开发利用提供技术支持。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Enhanced expression of the codon-optimized exo-inulinase gene from the yeast Meyerozyma guilliermondii in Saccharomyces sp W0 and bioethanol production from inulin
增强来自酵母菌 Meyerozyma guilliermondii 的密码子优化外切菊粉酶基因在 Saccharomyces sp W0 中的表达以及从菊粉生产生物乙醇
  • DOI:
    10.1007/s00253-014-6079-7
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Liu Guang-Lei;Fu Ge-Yi;Chi Zhe;Chi Zhen-Ming
  • 通讯作者:
    Chi Zhen-Ming
Synergistic effect between the recombinant exo-inulinase and endo-inulinase on inulin hydrolysis
重组外切菊粉酶和内切菊粉酶对菊粉水解的协同作用
  • DOI:
    10.1016/j.molcatb.2016.03.005
  • 发表时间:
    2016-06
  • 期刊:
    Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu Yuan;Zhou Shun-Hua;Cheng Yu-Rong;Chi Zhe;Chi Zhen-Ming;Liu Guang-Lei
  • 通讯作者:
    Liu Guang-Lei
Enhanced exo-inulinase activity and stability by fusion of an inulin-binding module
通过融合菊粉结合模块增强外切菊粉酶活性和稳定性
  • DOI:
    10.1007/s00253-016-7587-4
  • 发表时间:
    2016-05
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Zhou Shun-Hua;Liu Yuan;Zhao Yu-Juan;Chi Zhe;Chi Zhen-Ming;Liu Guang-Lei
  • 通讯作者:
    Liu Guang-Lei
Co-expression of Exo-inulinase and Endo-inulinase Genes in the Oleaginous Yeast Yarrowia lipolytica for Efficient Single Cell Oil Production from Inulin
外切菊粉酶和内切菊粉酶基因在产油酵母解脂耶氏酵母中的共表达,用于高效单细胞菊粉生产油。
  • DOI:
    10.1007/s12010-017-2659-1
  • 发表时间:
    2018-05-01
  • 期刊:
    APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Shi, Nianci;Mao, Weian;Liu, Guanglei
  • 通讯作者:
    Liu, Guanglei
High-efficient production of fructo-oligosaccharides from inulin by a two-stage bioprocess using an engineered Yarrowia lipolytica strain
使用工程化解脂耶氏酵母菌株,通过两阶段生物过程高效生产菊粉低聚果糖。
  • DOI:
    10.1016/j.carbpol.2017.06.043
  • 发表时间:
    2017-10-01
  • 期刊:
    CARBOHYDRATE POLYMERS
  • 影响因子:
    11.2
  • 作者:
    Han, Yao-Zu;Zhou, Chao-Chao;Liu, Guang-Lei
  • 通讯作者:
    Liu, Guang-Lei

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其他文献

Canonical correlation of milk immunoglobulins, lactoferrin concentration and Dairy Herd Improvement data of Chinese Holstein cows
中国荷斯坦奶牛乳免疫球蛋白、乳铁蛋白浓度与奶牛群改良数据的典型相关性
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  • 发表时间:
    2010-03
  • 期刊:
    Livestock Science
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    张春林;王加启;刘光磊;赵圣国
  • 通讯作者:
    赵圣国
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  • DOI:
    10.11868/j.issn.1001-4381.2018.001042
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    材料工程
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵玲;刘光磊;张思源;李茂军;刘简宁;李明辉
  • 通讯作者:
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β-2-微球蛋白基因多态性的关联(
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Livestock Science
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    刘光磊;王加启;赵圣国
  • 通讯作者:
    赵圣国
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    基因组学与应用生物学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘光磊;王加启;张春林
  • 通讯作者:
    张春林
深冷+固溶+时效复合处理对A356合金微观组织和力学性能的影响
  • DOI:
    10.13373/j.cnki.cjrm.xy18080042
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    稀有金属
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李茂军;刘光磊;蒋文辉;赵玲;朱浪杰;顾力
  • 通讯作者:
    顾力

其他文献

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刘光磊的其他基金

κ-卡拉胶酶中碳水化合物结合模块在酶催化中的作用及其底物识别的分子机制
  • 批准号:
    31770073
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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