青藏高原湿地不同微地形土壤甲烷氧化菌的群落结构与活性特征研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41401075
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0106.冰冻圈科学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Hummock-and-hollow microtopography is common in wetlands of the Qinghai-Tibetan Plateau. The methane emission fluxes of the hollows are significantly higher than those of the hummocks. About 90% of the methane formed in wetlands is consumed by methanotrophs and never reaches the atmosphere. Therefore, in order to understand the distinction of methane emission fluxes, it is important to know the characteristics of methanotrophs in hummocks and hollows. Few researches have focus on the effects of microtopography on the community structure and activity of methanotrophs in lake wetland and river wetland on the Qinghai-Tibetan Plateau. The Namco lake wetland and Nagqu river wetland are selected as the study sites. The methanotroph community will be analyzed by qPCR. The pmoA genes will be analyzed by amplicon pyrosequencing and the mmoX genes by cloning and sequencing. Canonical correspondence analysis will be used to analyze the methanotrophs community data and environmental data to find the main environmental factors controlling the distribution of methanotrophs. In order to detect the active methanotrophs involved in the methane oxidation, stable isotope-labeled DNA technology will be used to detect 16S rRNA gene and mmoX gene. This project aims to provide the microbiological mechanism for understanding the differences of methane emission fluxes in different microtopography, and provide the theory and data support for more accurate simulation and evaluation of methane and carbon cycles on the Qinghai-Tibetan Plateau.
踏头和踏间是青藏高原湿地普遍存在的微地形,有研究表明踏间土壤甲烷排放显著高于踏头土壤。甲烷氧化菌可消耗湿地产生甲烷的约90%,是影响甲烷排放的重要因素。阐明甲烷氧化菌在不同微地形土壤的特征是理解踏头踏间甲烷排放差异的基础。目前对青藏高原重要的湿地类型——湖泊湿地和河流湿地尚未有微地形影响甲烷氧化菌群落结构和活性的研究报道。本项目拟以青藏高原上具有代表性的纳木错湖泊湿地和那曲河流湿地为研究地点,用pmoA实时定量PCR、焦磷酸测序及mmoX克隆测序等技术分析不同微地形土壤甲烷氧化菌数量和群落结构差异,并结合环境数据分析控制群落结构的主要环境因子;通过稳定性同位素标记DNA的技术,检测16S rRNA基因和mmoX基因,分析不同微地形土壤活跃参与甲烷氧化的甲烷氧化菌类群。从而阐明不同微地形土壤之间甲烷排放差异的微生物机理,为更准确地模拟和评估青藏高原地区甲烷循环和碳循环提供理论和数据支持。

结项摘要

本项目使用稳定性同位素结合分子生物学手段研究了青藏高原湿地踏头和踏间土壤中的活性甲烷氧化菌类群。研究结果表明不同湿地土壤存在不同的甲烷氧化潜势和活性甲烷氧化菌类群。在那曲湿地,踏间土壤和踏头土壤氧化甲烷的速率并没有显著差别,但踏间土壤中被标记上的甲烷氧化菌的相对比例较高。Methylobacter和Crenothrix是那曲湿地踏头和踏间土壤中主要的活性甲烷氧化菌。Methylobacter和Methylocysits是当雄湿地踏头土壤中主要的活性甲烷氧化菌。红原日干乔湿地活跃的甲烷氧化菌属于Methylocysits。结合青藏高原湖泊沉积物的pmoA测序数据和全球其他地区已发表的湖泊沉积物pmoA测序数据,我们发现Methylomicrobium只在盐湖中占优势(高达100%),在淡水湖泊中,甲烷氧化菌组成相对多样,包括Methylobacter,Methylocystis和未培养的Ib型甲烷氧化菌,湖泊盐度解释了~25%的甲烷氧化菌群落的变异性。本项目为认识青藏高原湿地活性甲烷氧化菌的分异及微地形对其类群的影响提供了数据支持,并提供了高海拔湖泊沉积物(> 4000米)中甲烷氧化菌的数据,对阐明青藏高原湿地和湖泊甲烷循环提供了理论支持。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification of active aerobic methanotrophs in plateau wetlands using DNA stable isotope probing
DNA稳定同位素探测鉴定高原湿地活性需氧甲烷氧化菌
  • DOI:
    10.1093/femsle/fnw168
  • 发表时间:
    2016-08-01
  • 期刊:
    FEMS MICROBIOLOGY LETTERS
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Deng, Yongcui;Cui, Xiaoyong;Dumont, Marc G.
  • 通讯作者:
    Dumont, Marc G.
Anthropogenic protection alters the microbiome in intertidal mangrove wetlands in Hainan Island
人为保护改变了海南岛潮间带红树林湿地的微生物组
  • DOI:
    10.1007/s00253-017-8342-1
  • 发表时间:
    2017-05
  • 期刊:
    Appl Microbiol Biotechnol
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Juanli Yun;Yongcui Deng;Hongxun Zhang
  • 通讯作者:
    Hongxun Zhang
Long-term warming rather than grazing significantly changed total and active soil procaryotic community structures
长期变暖而不是放牧显着改变了土壤原核生物群落结构的总量和活性
  • DOI:
    10.1016/j.geoderma.2017.12.005
  • 发表时间:
    2018-04-15
  • 期刊:
    GEODERMA
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Che, Rongxiao;Deng, Yongcui;Cui, Xiaoyong
  • 通讯作者:
    Cui, Xiaoyong
Salinity Affects the Composition of the Aerobic Methanotroph Community in Alkaline Lake Sediments from the Tibetan Plateau
盐度影响青藏高原碱性湖泊沉积物中好氧甲烷氧化菌群落的组成。
  • DOI:
    10.1007/s00248-016-0879-5
  • 发表时间:
    2017-01-01
  • 期刊:
    MICROBIAL ECOLOGY
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Deng, Yongcui;Liu, Yongqin;Conrad, Ralf
  • 通讯作者:
    Conrad, Ralf

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    车荣晓;王芳;王艳芬;邓永翠;张静;马双;崔骁勇
  • 通讯作者:
    崔骁勇

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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