结核分枝杆菌中转录因子介导的耐药调控机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81471996
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    72.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2206.病原生物变异与耐药
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Tuberculosis (TB) has been a menace to human health throughout the world. The drug resistance of Mycobacterium tuberculosis has become an extremely serious problem to any attempt to control TB. It is basically known that acquired resistance to the first-line antibiotics because of sequential accumulation of mutations in target genes has resulted in the emergence of drug resistant TB. However, the additional regulating mechanisms on the drug restance of M. tuberculosis are largely unclear and the involved transcription factor remains to be identified. In this proposal, we will firstly clone almost entire regulatory genes from the genome of M. tuberculosis into overexpression plasmids and screen potential regulators which can obviously affect the ability of the mycobacterial drug resistance. Then, using multiple methods, including EMSA, ChIP, transcriptomics, proteomics and gene knock-out assays, we will comprehensively characterize the interaction between the regulator and the target promoter DNA, and discover new signaling pathways in the pathogen. Finally, we will explore on the relationships betwen the regulator-involved signaling pathways and mycobacterial drug-resistance. Therefore, this study would significantly improve our understanding on the transcription regulatory mechanisms of the bacterial drug-resistance in M. tuberculosis. This also will definitely help explore new drug target and develop ideal stretgy for finally controling TB in the future.
结核病全球蔓延,细菌耐药问题十分严重。然而,尽管目前已经清楚药物靶标基因突变是导致临床菌株耐药的主要原因,但是有关结核分枝杆菌耐药性形成的其它调控机制还知之甚少,相关的调控因子也还未系统地鉴定。为此,本项目拟首先大规模克隆结核分枝杆菌的转录调控基因,构建基因超量表达文库,系统筛选对结核分枝杆菌药物抗性能力有显著影响的转录因子。在此基础上,进一步采用EMSA、ChIP、转录组学和蛋白质组学分析以及基因敲除等方法,综合鉴定这些转录因子蛋白与它们的靶启动子DNA之间的相互作用,发现和剖析相关信号通路,从而系统阐明结核分枝杆菌中转录因子介导的细菌耐药调控新机制。本项目的实施将能显著提升我们对基因转录调控导致结核分枝杆菌耐药性形成的分子机制的认识,有助于推动新药靶标的发掘,为结核病的防控提供新思路。

结项摘要

结核病全球蔓延,细菌耐药问题十分严重。但是有关结核分枝杆菌耐药性形成的调控机制还知之甚少,相关的调控因子也还未系统地鉴定。本项目通过大规模克隆结核分枝杆菌的转录调控基因,系统筛选了对结核分枝杆菌药物抗性能力有显著影响的转录因子。发现了一个新的保守的拟核结合蛋白NapM具有弯曲和桥连DNA的功能, 能调控分枝杆菌对抗结核药物的抗性; 证明了由Rv0273c基因编码的TetR家族转录因子EtbR是一种新的乙胺丁醇结合蛋白,它在两种一线抗结核药物异烟肼和乙胺丁醇的协同作用中发挥重要作用; 发现和命名了一个抗结核药物异烟肼作用的新靶标调控因子蛋白InbR,并阐明了调控机制; 阐明了c-di-GMP分子调控结核分枝杆菌生长和在宿主体内存活的新机制。这些工作显著提升了我们对基因转录调控导致结核分枝杆菌耐药性形成的分子机制的认识,有助于推动新药靶标的发掘,为结核病的防控提供新思路。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
NapM, a new nucleoid-associated protein, broadly regulates gene expression and affects mycobacterial resistance to anti-tuberculosis drugs
NapM 是一种新的类核相关蛋白,广泛调节基因表达并影响分枝杆菌对抗结核药物的耐药性
  • DOI:
    10.1111/mmi.13383
  • 发表时间:
    2016-07-01
  • 期刊:
    MOLECULAR MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Liu, Yu;Wang, Hongyang;He, Zheng-Guo
  • 通讯作者:
    He, Zheng-Guo
InbR, a TetR family regulator, binds with isoniazid and influences multidrug resistance in Mycobacterium bovis BCG.
InbR 是一种 TetR 家族调节因子,可与异烟肼结合并影响牛分枝杆菌 BCG 的多药耐药性。
  • DOI:
    10.1038/srep13969
  • 发表时间:
    2015-09-10
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Yang M;Gao CH;Hu J;Zhao L;Huang Q;He ZG
  • 通讯作者:
    He ZG
Cyclic diguanylate monophosphate directly binds to human siderocalin and inhibits its antibacterial activity.
环状二鸟苷单磷酸酯直接与人铁铁蛋白结合并抑制其抗菌活性
  • DOI:
    10.1038/ncomms9330
  • 发表时间:
    2015-09-22
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Li W;Cui T;Hu L;Wang Z;Li Z;He ZG
  • 通讯作者:
    He ZG
Novel TetR family transcriptional factor regulates expression of multiple transport-related genes and affects rifampicin resistance in Mycobacterium smegmatis.
新型 TetR 家族转录因子调节多个转运相关基因的表达并影响耻垢分枝杆菌利福平耐药性
  • DOI:
    10.1038/srep27489
  • 发表时间:
    2016-06-07
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Liu H;Yang M;He ZG
  • 通讯作者:
    He ZG
Molecular mechanism of the synergistic activity of ethambutol and isoniazid against Mycobacterium tuberculosis
乙胺丁醇与异烟肼协同抗结核杆菌的分子机制
  • DOI:
    10.1074/jbc.ra118.002693
  • 发表时间:
    2018-10-26
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Zhu, Chen;Liu, Yu;He, Zheng-Guo
  • 通讯作者:
    He, Zheng-Guo

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其他文献

数据库连接池在Web GIS开发中的
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    城市勘测,2004.4
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  • 作者:
    何正国;杜娟
  • 通讯作者:
    杜娟
Antitubercular inhibitor screened target gene Rv2498c and application thereof
抗结核抑制剂筛选靶基因Rv2498c及其应用
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    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何正国;崔涛;曾菊梅
  • 通讯作者:
    曾菊梅
中间件在GIS开发中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    测绘通报,2004.11
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄海涛;杜娟;何正国
  • 通讯作者:
    何正国
Characterization of the physical interaction between replication initiator protein DnaA and replicative helicase from Mycobacterium tuberculosis H37Rv.
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  • DOI:
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    --
  • 期刊:
    Biochemistry-Moscow
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  • 作者:
    何正国
  • 通讯作者:
    何正国

其他文献

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c-di-GMP分子驱动耻垢分枝杆菌抗氧化调控的信号通路与分子机制研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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