海南地区哈维氏弧菌病原分子血清型特征及毒力相关基因鉴定研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31660744
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1908.水产生物病原学与病害控制
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The most important bases of mariculture and hatchery in China are located in Hainan. In recent years, a novel pathogenic strain of Vibrio harveyi was the most serious bacterial pathogen of the mariculture system and hatchery factory in Hainan. However, its pathogenic mechanism are still unclear, and no measure can effectively control the epidemic caused by this pathogen. Therefore, it is necessary to identify the molecular epidemiological characteristics, virulence-related genes and the molecular biomarker for controlling the disease. In this study, RAPD, REP-PCR and ERIC-PCR will introduced to determine the molecular epidemiological characteristics of the V. harveyi strains isolated from the mariculture system and hatchery factory in Hainan. One of the typic wild virulent strain (WV) will be mutated by Ultraviolet and both of the mutant virulent strains (MV) and nonvirulent strains (MNV) will be selected by artificial tests. The genomes of WV, MV and MNV will be sequenced by Pacbio and Hiseq sequencing, respectively and the virulence-related genes of WV will be obtained thereafter. Finally, the molecular biomarker, the specific nucleic acid fragment among the virulence strains which presented the similar molecular epidemiological characteristics with WV, will be determined by Southern hybridization and a specific PCR detection method for the pathogen will be developed. The results of this study will be very helpful for revealing pathogenic mechanism, epidemiological investigation, pathogen tracking, diagnosis, discovering the transmission mechanism and formulating the prevention and control measures of the disease caused by V. harveyi in China.
海南是我国南方重要的海水动物苗种繁育和养成基地,哈维氏弧菌是该地区海水养殖和苗种繁育中最常见和危害最大的细菌性病原之一,且这些菌株可能是一类新的、致病机理不清的分子血清型毒力菌株。当前,对哈维氏弧菌病还缺少安全有效的防控方法。为此,本项目将采用RAPD、ERIC-PCR和REP-PCR技术相结合,确定申请人近年来从海南地区分离的哈维氏弧菌病原分子血清型特征;采用紫外突变技术诱发哈维氏弧菌病原典型菌株(WT)产生突变,比较WT、突变毒力株和突变非毒株的基因组差异,确定该地区典型菌株的毒力相关基因;采用Southern技术,确定该地区哈维氏弧菌病原的特异性分子标志并建立相应的PCR快速检测技术。本项目研究结果将为开展哈维氏弧菌分子致病机理研究,和海南乃至我国哈维氏弧菌病的流行病学调查、病原追踪、快速诊断以及探寻其传播机制和制订安全高效的哈维氏弧菌病控制措施奠定良好基础。

结项摘要

针对哈维氏弧菌为海南地区海水养殖和苗种繁育中最常见和危害最大的细菌性病原之一且分子血清型不清的问题,本课题采用RAPD和ERIC-PCR技术相结合,确定了项目组近年来从海南地区分离的哈维氏弧菌病原分子血清型特征;采用紫外突变技术诱发哈维氏弧菌病原典型菌株GDH11385产生突变,通过比较WT、突变毒力株(含毒力不变株和毒力增强株)和突变非毒株的基因组差异,基本确定了与运动、胞外结构、细胞膜形成、抵抗机制、次生代谢物合成和转运与催化活性相关的约40个基因为该地区典型菌株的毒力相关基因;采用基因序列分析技术,确定了该地区哈维氏弧菌主要的特异性分子标志,进一步建立相应的PCR快速检测技术。本项目研究结果为海南乃至我国哈维氏弧菌病的流行病学调查、病原追踪、快速诊断以及探寻其传播机制和制订安全高效的哈维氏弧菌病控制措施,和今后开展哈维氏弧菌分子致病机理研究奠定了良好基础。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification of pathogenicity, investigation of virulent gene distribution and development of a virulent strain-specific detection PCR method for Vibrio harveyi isolated from Hainan Province and Guangdong Province, China
海南省和广东省哈维氏弧菌致病性鉴定、毒力基因分布调查及毒力菌株特异性检测PCR方法的建立
  • DOI:
    10.1016/j.aquaculture.2016.10.015
  • 发表时间:
    2017-02
  • 期刊:
    Aquaculture
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Xu Xi;ong;Liu Kaifang;Wang Shifeng;Guo Weiliang;Xie Zhenyu;Zhou Yongcan
  • 通讯作者:
    Zhou Yongcan
Identification of Vibrio alginolyticus virulent strain‐specific DNA regions by suppression subtractive hybridization and PCR
通过抑制消减杂交和 PCR 鉴定溶藻弧菌强毒株特定 DNA 区域
  • DOI:
    10.1111/jam.14739
  • 发表时间:
    2020-06
  • 期刊:
    Journal of Applied Microbiology
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Z.‐Y. Xie;X.‐X. Gong;X.‐D. Xu;B. Mei;X.‐Z. Xuan;H. Long;X. Zhang;X.‐N. Cai
  • 通讯作者:
    X.‐N. Cai
Characterization of a pathogenic Vibrio harveyi strain from diseased Epinephelus coioides and evaluation of different methods to control its infection
患病斜带石斑鱼致病性哈维氏弧菌菌株的鉴定及控制其感染的不同方法的评价
  • DOI:
    10.1016/j.aquaculture.2020.735371
  • 发表时间:
    2020-09-15
  • 期刊:
    AQUACULTURE
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Bai, Jing-Yuan;Long, Hao;Xie, Zhen-Yu
  • 通讯作者:
    Xie, Zhen-Yu
华南地区海水养殖水域中哈维氏弧菌的抗药性分析
  • DOI:
    10.15886/j.cnki.hdxbzkb.2017.0023
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    海南大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘开放;步君;章翔;谢珍玉
  • 通讯作者:
    谢珍玉
珊瑚病原菌株XSBZ03和XSBZ14双重PCR检测方法的建立
  • DOI:
    10.13343/j.cnki.wsxb.20180373
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨思悦;符亚楠;龙昊;章翔;谢珍玉
  • 通讯作者:
    谢珍玉

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其他文献

海南地区溶藻弧菌遗传多样性的RAPD分析
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    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    热带生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周永灿;谢珍玉;于文媛;陈诏;王世锋
  • 通讯作者:
    王世锋

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基于病原与宿主互作的哈维氏弧菌关键毒力(相关)基因鉴定
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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