视网膜细胞多样性发生的细胞谱系机制研究

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基本信息

项目摘要

In the central nerve systems (CNS), functional neural circuits are assembled by properly connected neural cells of extremely diverse types. How such CNS cellular diversity are produced is one of the major questions in brain development. Vertebrate retinas, a CNS tissue with best characterized cell types and cellular organization, are highly conserved across species. In the meanwhile, zebrafish embryos are characterized by in-vitro fertilization, rapid embryonic development, optic transparency. Therefore, developing zebrafish retinas offer an outstanding system to examine cellular diversity generation in-vivo. In this proposal, by the development of new methods including cell-lineage tracing, single-cell sequencing, lineage-specific gene manipulation and mathematical modeling, we set to explore the following questions: 1. Lineage signatures of the production of retinal cell types; 2. Principles governing distinct retinal cell lineages that comprise cell types of different combinations; 3. Molecular mechanisms of the selection of distinct retinal cell lineages. All these efforts expect new insights into the issue as to cellular diversity generation of vertebrate CNS tissues.
多样的神经细胞是神经系统功能的结构基础。中枢神经系统细胞多样性及其发生机制是发育神经生物学领域的核心命题之一。脊椎动物视网膜是目前细胞类型及其组织结构最为清晰且高度进化保守的中枢神经组织;斑马鱼模型具有体外受精,发育快,胚胎透明等特点,适于开展神经细胞多样性发育的在体研究。本项目将以斑马鱼视网膜为模型,采用细胞谱系追踪,单细胞测序,细胞谱系特异基因操作和数学建模等手段,解析视网膜不同类型神经元和胶质细胞产生的细胞谱系模式;揭示不同视网膜细胞类型产生的细胞谱系选择原则;揭示不同视网膜细胞谱系间选择的分子机制;以期对“脊椎动物中枢神经细胞多样性的发生及其机制”这一关键性科学问题有更深的机制认识。

结项摘要

多样的神经细胞是神经系统功能的结构基础。中枢神经系统细胞多样性及其发生机制是发育神经生物学领域的核心命题之一。本项目致力于以斑马鱼视网膜为模型,解析视网膜不同类型神经元和胶质细胞产生的细胞谱系模式;揭示不同视网膜细胞类型产生的细胞谱系选择原则;揭示不同视网膜细胞谱系间选择的分子机制;以期对“脊椎动物中枢神经细胞多样性的发生及其机制”这一关键性科学问题有更深的机制认识。在项目执行期中,研究团队采用细胞谱系追踪,单细胞测序,细胞谱系特异基因操作和数学建模等手段,系统地揭示了斑马鱼视网膜胚胎神经发生过程中神经元产生的谱系基础,证明了神经发生过程中谱系依赖的特性,为再生医学中神经元的定向分化提供了重要的理论基础。相关工作已经发表于 Journal of Cell Biology (Wang et al, 2020)。通过视网膜细胞谱系特异性基因敲除和过表达,揭示了Müller 细胞谱系特征和谱系发育的分子机制,相关工作已经发表于 EMBO reports (Jin et al, 2022)。解析了斑马鱼视网膜神经发生的七个发育状态,并且揭示了这些发育状态对于胚胎和成体视网膜神经发生具有高度保守性。相关工作发表在Development (Xu et al.2020)。描绘了神经递质、神经调质神经元的多样性,揭示了转录因子及转录后调控因子在编码不同神经元类型的分子调控规则,为研究神经元多样性产生和进化演变提供理论基础,相关工作发表在 Elife (Zhang et al.2021)。

项目成果

期刊论文数量(4)
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专利数量(0)
The landscape of regulatory genes in brain-wide neuronal phenotypes of a vertebrate brain.
脊椎动物大脑全脑神经元表型中的调控基因景观
  • DOI:
    10.7554/elife.68224
  • 发表时间:
    2021-12-13
  • 期刊:
    eLife
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Zhang H;Wang H;Shen X;Jia X;Yu S;Qiu X;Wang Y;Du J;Yan J;He J
  • 通讯作者:
    He J
Jag2b-Notch3/1b-mediated neuron-to-glia crosstalk controls retinal gliogenesis
Jag2b-Notch3/1b介导的神经元与神经胶质细胞串扰控制视网膜胶质细胞生成
  • DOI:
    10.15252/embr.202254922
  • 发表时间:
    2022-09-01
  • 期刊:
    EMBO REPORTS
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Jin, Mengmeng;Zhang, Hui;He, Jie
  • 通讯作者:
    He, Jie
Different lineage contexts direct common pro-neural factors to specify distinct retinal cell subtypes
不同的谱系环境指导常见的前神经因子来指定不同的视网膜细胞亚型
  • DOI:
    10.1083/jcb.202003026
  • 发表时间:
    2020-09-07
  • 期刊:
    JOURNAL OF CELL BIOLOGY
  • 影响因子:
    7.8
  • 作者:
    Wang,Mei;Du,Lei;He,Jie
  • 通讯作者:
    He,Jie
Unifying developmental programs for embryonic and postembryonic neurogenesis in the zebrafish retina
统一斑马鱼视网膜胚胎和胚胎后神经发生的发育程序
  • DOI:
    10.1242/dev.185660
  • 发表时间:
    2020-06-01
  • 期刊:
    DEVELOPMENT
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Xu,Baijie;Tang,Xia;He,Jie
  • 通讯作者:
    He,Jie

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其他文献

P2PNavi: A System-Level Algorithmic Solution for Highly Accurate Direction Estimation for Infrastructure-Free Indoor Navigation
P2PNavi:用于无基础设施室内导航的高精度方向估计的系统级算法解决方案
  • DOI:
    10.1109/jsyst.2020.3030769
  • 发表时间:
    2021-06
  • 期刊:
    IEEE SYSTEMS JOURNAL
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    徐丽媛;何杰;王鹏;王沁
  • 通讯作者:
    王沁
资本结构选择、内部控制与企业并购绩效——基于A股上市公司的经验研究
  • DOI:
    10.15931/j.cnki.1006-1096.20171129.019
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    经济经纬
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    何杰
土工格栅复合夯实水泥土桩-土界面接触特性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    湖南工业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曹祚省;何杰;杨彦忠;饶迁根;孟森松
  • 通讯作者:
    孟森松
基于光学和雷达图像的土地覆被分类
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    长江科学院院报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王新云;田建;郭艺歌;何杰
  • 通讯作者:
    何杰
路面随机激励时域模型特性的仿真研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    武汉理工大学学报(交通科学与工程版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何杰;陈一锴;彭佳;毛海军;李旭宏
  • 通讯作者:
    李旭宏

其他文献

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何杰的其他基金

成体视网膜干细胞的胚胎发育机制研究
  • 批准号:
    31471042
  • 批准年份:
    2014
  • 资助金额:
    90.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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