变异链球菌LuxS密度感应与代谢流相关性研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81570964
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1503.牙体牙髓及根尖周组织疾病
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

LuxS system mediated most bacteria’s quorum sensing. However the LuxS enzyme is also the key factor of Active Methyl Circulation, there existed the dispute of whether the luxS mutation caused quorum sensing disabilities or just metabolism distortion. This study aims to study the role of LuxS sytem. During the earlier study, the luxS mutation strain and different methyl metabolism recovery strains are constructed. This study plans to detect the intra and intercellular principal metabolic components with NMR and HPLC respectively. With the bioinformatics methods, the metabolism networks will be simulated on the basis of various metabolic databases. Mathematic modeling will be used to calculate the metabolic flow control with the method of FBA and MOMA. This study may bring a further step to the quorum sensing eco-control of caries.
LuxS系统调控着多数细菌的密度感应行为,但由于LuxS酶本身也是甲基化代谢循环的关键酶,因此学术界有质疑通过luxS缺陷所获得的生理表型的改变是否为代谢障碍而非密度感应缺陷所致。本研究为进一步探索LuxS系统在密度感应与代谢流控制中的作用与地位而提出,在前期自然科学基金项目的基础上,已构建出了变异链球菌luxS基因的缺陷株,及不同层次恢复其甲基代谢的基因工程改造菌株。为解释在前期实验中发现的问题,本研究计划针对不同代谢水平的改造菌株利用核磁共振和高效液相色谱技术分析其胞内外主代谢成分,采用生物信息学的方法在数据库的支持下重建代谢网络,并利用数学建模分析的方法计算代谢流的控制,以及通过流平衡分析法计算与基因敲除前的最佳流分布状况最接近的可行的解。并按照代谢调节最小化法通过参数的调整控制对luxS基因在信息与代谢中的作用与地位进行模拟与分析。本研究将从理论上进一步丰富密度感应生态防治的研究。

结项摘要

变异链球菌在龋病的发生发展中有重要作用,其在口腔中主要以生物膜的形式与其他细菌共生。密度感应在生物膜细菌间的信息交流中发挥了重要的作用。LuxS系统调控着多数细菌的密度感应行为,但由于LuxS酶本身也是甲基化代谢循环的关键酶,因此学术界有质疑通过luxS缺陷所获得的生理表型的改变是否为代谢障碍而非密度感应缺陷所致。本研究探索了LuxS系统在密度感应与代谢流控制中的作用与地位。我们利用前期构建的变链球菌luxS基因的缺陷株,及不同层次恢复其甲基代谢的基因工程改造菌株,利用高通量测序和高效液相色谱技术分析针对基因转录、翻译,代谢等不同水平对改造菌株代谢活动进行分析,采用生物信息学的方法在数据库的支持下重建luxS影响的代谢网络,并利用数学建模分析的方法计算代谢流的控制,以及通过流平衡分析法计算与基因敲除前的最佳流分布状况最接近的可行的解。并按照代谢调节最小化法通过参数的调整控制对luxS基因在信息与代谢中的作用与地位进行模拟与分析。研究发现luxS可通过密度感应和甲基循环通路影响生物膜的形成。通过密度信号分子AI-2的合成和摄取影响生物膜的形成;通过甲基循环主要影响细菌胞外多糖的形成从而影响生物膜的形成。变异链球菌内存novelgene21、22、25、27、30等sRNA参与luxS的调控。luxS主要影响PTS系统,并可能通过PTS系统感受外界环境AI-2信号以及影响果糖、甘露糖、丙酮酸代谢、糖酵解和糖合成。本项目从代谢网络机制上探讨了luxS 基因在信号调控与代谢调控中的作用,进一步阐明了密度感应信号系统对生物膜致病的作用机制,从理论上丰富了密度感应生态防治的研究,为将来通过干扰口腔生物膜信息传递防龋提供潜了在的作用靶点,为龋病的预防奠定理论基础。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Nardosinone Suppresses RANKL-Induced Osteoclastogenesis and Attenuates Lipopolysaccharide-Induced Alveolar Bone Resorption.
Nardosinone 抑制 RANKL 诱导的破骨细胞生成并减弱脂多糖诱导的牙槽骨吸收
  • DOI:
    10.3389/fphar.2017.00626
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Frontiers in pharmacology
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Niu C;Xiao F;Yuan K;Hu X;Lin W;Ma R;Zhang X;Huang Z
  • 通讯作者:
    Huang Z
The Impairment of Methyl Metabolism From luxS Mutation of Streptococcus mutans.
变形链球菌luxS突变对甲基代谢的损害
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.00404
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Hu X;Wang Y;Gao L;Jiang W;Lin W;Niu C;Yuan K;Ma R;Huang Z
  • 通讯作者:
    Huang Z
The role of osteomodulin on osteo/odontogenic differentiation in human dental pulp stem cells
骨调节蛋白对人牙髓干细胞成骨/牙源分化的作用
  • DOI:
    10.1186/s12903-018-0680-6
  • 发表时间:
    2019-01-22
  • 期刊:
    BMC ORAL HEALTH
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Lin, Wenzhen;Gao, Li;Huang, Zhengwei
  • 通讯作者:
    Huang, Zhengwei
Comparative characterization of mesenchymal stem cells from human dental pulp and adipose tissue for bone regeneration potential
人牙髓和脂肪组织间充质干细胞骨再生潜力的比较表征
  • DOI:
    10.1080/21691401.2019.1594861
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    ARTIFICIAL CELLS NANOMEDICINE AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Jin, Qiaoqiao;Yuan, Keyong;Huang, Zhengwei
  • 通讯作者:
    Huang, Zhengwei
Ecological Shifts of Supragingival Microbiota in Association with Pregnancy
与妊娠相关的龈上微生物群的生态变化
  • DOI:
    10.3389/fcimb.2018.00024
  • 发表时间:
    2018-02-15
  • 期刊:
    FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Lin, Wenzhen;Jiang, Wenxin;Huang, Zhengwei
  • 通讯作者:
    Huang, Zhengwei

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其他文献

密度感应拮抗剂C-30对变异链球菌生物膜的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    牙体牙髓牙周病学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何智妍;黄正蔚
  • 通讯作者:
    黄正蔚
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中华口腔医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王玉霞;高丽;江文欣;朱彩莲;何智妍;黄正蔚
  • 通讯作者:
    黄正蔚
变异链球菌社会欺骗行为规避模式的观察研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    口腔生物医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何智妍;黄正蔚
  • 通讯作者:
    黄正蔚
差异显示技术对变形链球菌生物膜
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中华微生物和免疫杂志. 25(9): 777-780, 2005
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄正蔚;刘正*
  • 通讯作者:
    刘正*
粪肠球菌luxS基因缺陷菌株的构建
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    上海口腔医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何智妍;程岚;王玉霞;黄正蔚
  • 通讯作者:
    黄正蔚

其他文献

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变异链球菌经磷酸转移酶系统对密度感应信号分子AI-2的转运及作用机制的研究
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  • 项目类别:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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