同位素标记定量代谢组学方法研究及在慢乙肝患者血清肝纤维化标志物筛选中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21804118
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0401.分离与分析
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Patients with chronic hepatitis B virus (HBV) infection with persistently normal or mildly elevated ALT, frequently have significant liver fibrosis or cirrhosis. Currently, liver biopsy needs be performed in these patients to determine the stage of liver fibrosis and treatment regimens. However, this invasive surgery is of high risk and not acceptable for many patients. Therefore, there is a great need to discover new biochemical biomarkers in order to diagnose liver fibrosis at early stage, determine the extent of fibrosis. In this study, we plan to develop workflow to apply chemical isotope labeling liquid chromatography mass spectrometry (CIL LC-MS) for biological studies and discovery a panel of serum metabolites as potential specific and sensitive biomarkers of liver fibrosis. We will perform large-scale metabolomic profiling work of all the serum samples collected from patients with chronic hepatitis B using of 12C-/13C-dansyl chloride (DnsCl) labeling for profiling the amine/phenol submetabolome, 12C-/13C-dimethylaminophenacyl (DmPA) bromide labeling for profiling the carboxylic acid submetabolome and 12C-/13C-dansyl hydrazine labeling for profiling the ketone/aldehyde submetabolome including many sugars. These metabolic information may be used not only for develop a noninvasive model for prediction of liver fibrosis, but also for investigating the possible mechanism on the process of disease development and providing the theoretical and experimental basis on the characteristics of histological abnormalities in a large population of patients with chronic HBV infection.
ALT持续正常或轻度异常的慢乙肝患者存在较高比例显著肝组织损害,肝活检仍是衡量炎症活动度及判定抗病毒指征的重要依据,但因其创伤性难以被多数患者接受。因此,临床上迫切需要无创性指标评估肝组织纤维化程度。本项目拟以慢乙肝肝纤维化预警及早期治疗为突破口,建立基于同位素标记定量代谢组学方法进行生物学研究的标准化流程,并将其应用于慢乙肝患者血清肝纤维化标志物筛选中,获得含“化学标签”(12C/13C-DnsCl、12C/13C-DMPA、12C/13C-DnsHz)的慢乙肝患者血清代谢组,分析其在慢乙肝肝纤维化发生发展中的作用及机制,构建高效的与慢性乙肝患者肝脏炎症分级相关的预测模型并验证,明确其在临床诊断中的作用及价值,为改善该类疾病的诊疗效果提供理论和实验基础。

结项摘要

ALT持续正常或轻度异常的慢乙肝患者存在较高比例显著肝组织损害,肝活检仍是衡量炎症活动度及判定抗病毒指征的重要依据,但因其创伤性难以被多数患者接受。因此,临床上迫切需要无创指标评估肝组织纤维化程度。本项目以慢性乙肝肝纤维化预警及早期治疗为突破口,建立基于同位素标记定量代谢组学技术进行生物医学领域研究的标准化流程。课题首先研究分析前变异因素血清冻融循环、血清存储时间对血清代谢谱的影响,总结一套适用于临床研究的定量代谢组学标准化工作流程;其次,将此技术平台用于慢乙肝患者血清肝纤维化标志物的筛选中,获得含同位素“化学标签”的慢乙肝患者血清定量代谢谱,分析其在慢乙肝患者肝纤维化发生发展中的作用及机制,构建肝脏炎症分级预测模型并验证。基于生信分析表明,慢乙肝患者体内赖氨酸降解通路受到显著影响,其在肝细胞内降解过程中累积产生一系列具有线粒体毒性的代谢物,推测其破坏肝细胞氧化还原稳态,增加肝细胞的氧化压力,激活肝星状细胞转型成纤维细胞,导致胶原蛋白的沉积和纤维组织的生成,继而导致肝纤维化和肝硬化。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
High tolerance to instrument drifts by differential chemical isotope labeling LC-MS: A case study of the effect of LC leak in long-term sample runs on quantitative metabolome analysis
差异化学同位素标记 LC-MS 对仪器漂移的高耐受性:长期样品运行中 LC 泄漏对定量代谢组分析影响的案例研究
  • DOI:
    10.1002/jms.4589
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Mass Spectrometry
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Chen Deying;Zhao Shuang;Han Wei;Lo Elvis;Su Xiaoling;Li Liang;Li Lanjuan
  • 通讯作者:
    Li Lanjuan
Effects of Freeze-Thaw Cycles of Blood Samples on High-Coverage Quantitative Metabolomics
血液样本冻融循环对高覆盖定量代谢组学的影响
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.0c01610
  • 发表时间:
    2020-07-07
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Chen, Deying;Han, Wei;Li, Lanjuan
  • 通讯作者:
    Li, Lanjuan
Controlling Preanalytical Process in High-Coverage Quantitative Metabolomics: Spot-Sample Collection for Mouse Urine and Fecal Metabolome Profiling
控制高覆盖率定量代谢组学中的分析前过程:小鼠尿液和粪便代谢组分析的点样采集
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.9b00310
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Chen Deying;Yu Jiong;Zhang Zhehua;Su Xiaoling;Li Liang;Li Lanjuan
  • 通讯作者:
    Li Lanjuan

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其他文献

-卡拉胶寡糖的反相离子对-超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    分析化学
  • 影响因子:
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  • 作者:
    陈德莹;高洋;陈海敏;严小军;徐继林
  • 通讯作者:
    徐继林

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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