黄河裸裂尻鱼珠蛋白家族成员的基因结构特征及其在低氧适应中的作用

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31460094
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    49.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0301.生态学理论与方法
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Oxygen is an essential factor for organism in term of metabolism and survival. Limitation in availability of oxygen (hypoxia) would severely impact survival and development of animal. The aqueous environments have a low oxygen capacitance and poor oxygen diffusibility, and show spatial, temporal or seasonal changes of oxygen availability. Therefore, most fish species have adapted to these conditions by a variety of physiological, anatomical and behavioral mechanisms that enable them to cope with periods of hypoxia. Schizopygopsis pylzovi, one species of the subfamily Schizothoracinae, is widely distributed in the upper reaches of Yellow River and shows extreme adaptation to high altitude hypoxia of Qinghai-Tibetan Plateau. In this project, we will clone the cDNA, promoter, intron and flanking sequences of the globin superfamily members by using of RT-PCR、Smart-race PCR and conventional PCR, and then conduct the analyses of gene structure and molecular adaptive evolution. The localization of globin superfamily members will be investigated with immunohistochemical method, and the genes will be mapped on chromosomes with multicolor in situ hybridization technology. Meantime, we will investigate the gene expression and regulation of globin superfamily members responding to hypoxic environment with Real-time PCR and Western blotting. The aims of this project are to get thorough understanding for the member constitution, gene structure characteristics and molecular adaptive evolution of globin superfamily, and then clarify the function and mechanism of globin superfamily in adaptation of Schizopygopsis pylzovi to high altitude hypoxia of Qinghai-Tibetan Plateau.
氧是机体进行新陈代谢和维持生存的必要因子,环境缺氧将严重影响动物的生存与发展。水体环境以低氧为特征,并呈现出空间、时间和季节性溶氧的波动性。应对低氧环境,鱼类在漫长的进化历程中形成了一整套生理、解剖和行为等方面的适应策略。本项目以极其适应于青藏高原低氧环境的黄河裸裂尻鱼为研究对象,利用RT-PCR、Smart-race PCR和常规PCR克隆珠蛋白超家族成员cDNA、启动子、内含子和侧翼序列,分析各成员的基因结构及分子适应性进化特征;利用免疫组化和多彩荧光原位杂交技术进行珠蛋白超家族成员的组织细胞定位和基因的染色体定位;利用Real-time PCR和Western blotting方法探讨低氧条件下黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族成员的表达调控。深入了解高原土著鱼类在珠蛋白超家族成员的组成、基因结构特征及其分子适应性进化中的独特性,阐述珠蛋白超家族成员在黄河裸裂尻鱼低氧适应中的作用和机制。

结项摘要

氧是机体进行新陈代谢和维持生存的必要因子,环境缺氧将严重影响动物的生存与发展。青藏高原土著鱼类在漫长的进化中,形成了一整套生理、解剖、行为和分子方面的适应策略以应对高原低氧环境。本项目以黄河裸裂尻鱼为研究对象,探讨了珠蛋白家族成员的基因结构特征及其在低氧适应中的作用。结果表明:(1)黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族由9个成员组成,即HbA、HbB1、HbB2、Hbae、Hbbe、Cygb1、Cygb2、Ngb和Mb;(2)所有珠蛋白超家族成员二级结构均由8个α螺旋组成,各基因3个外显子均由2个内含子隔开;(3)鲤科鱼类共同祖先(裂腹鱼、斑马鱼、鲤鱼、鲫鱼)基因组经历了加倍事件,从而使鲤科鱼类拥有2个肌红蛋白同源基因(Mb1和Mb2),但是在后期的进化中Mb2在裂腹鱼亚科鱼类和斑马鱼中发生了丢失。裂腹鱼亚科鱼类拥有2个β珠蛋白基因(HbB1和HbB2),然而只有HbB1参与了血红蛋白的组装;(4)成年型HbB1和HbA基因,以及胚胎型Hbbe和Hbae均以3′-5′和5′-3′方式串联在一起;(5)除HbB2、Cygb2和Ngb外,裂腹鱼亚科其他珠蛋白成员均发生了不同程度的适应性进化,蛋白位点的适应性改变可能影响了裂腹鱼亚科鱼类的血氧亲和力,从而提高低氧耐受;(6)成年鱼中同时表达有胚胎型和成年型血红蛋白,头肾不仅是合成血红蛋白的主要场所,而且具有储存血红蛋白的功能。应对低氧,引发Hb转录机器的关闭,启动节能机制,但是通过快速释放头肾中储存的血红蛋白来增强机体的摄氧量,提高循环中的血红蛋白含量,增强机体的存活率;(7)Cygb1和Cygb2均为氧敏感基因,低氧可诱导黄河裸裂尻鱼不同组织Cygb1和Cygb2的特异性表达,在低氧条件下Cygb1和Cygb2为体细胞供氧发挥了重要作用;(8)Mb主要表达在肌肉组织中,应对重度低氧,黄河裸裂尻鱼心脏组织中的Mb表达量急剧上升,表明Mb在黄河裸裂尻鱼心脏供氧中发挥重要作用;(9)Ngb主要表达在眼和脑组织。在低氧条件,Ngb在脑和眼中的表达量显著降下降,其他珠蛋白成员在维持神经组织的正常功能中是否发挥了补偿性作用有待进一步研究。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
黄河裸裂尻鱼肌酸激酶M-CK cDNA的克隆及组织表达分析
  • DOI:
    10.13859/j.cjz.201601010
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    动物学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孔庆辉;晁燕;夏明哲;李长忠;祁得林
  • 通讯作者:
    祁得林
Molecular evolution of myoglobin in the Tibetan Plateau endemic schizothoracine fish (Cyprinidae, Teleostei) and tissue-specific expression changes under hypoxia.
青藏高原特有裂腹鱼(鲤科、硬骨鱼)肌红蛋白的分子进化及缺氧下组织特异性表达变化。
  • DOI:
    10.1007/s10695-017-0453-1
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Fish Physiol Biochem
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Qi Delin;Chao Yan;Zhao Yongli;Xia Mingzhe;Wu Rongrong
  • 通讯作者:
    Wu Rongrong
Molecular characterization and expression changes of cytoglobin genes in response to hypoxia in a Tibetan schizothoracine fish, Schizopygopsis pylzovi
西藏裂腹鱼(Schizopygopsis pylzovi)缺氧时细胞珠蛋白基因的分子特征和表达变化
  • DOI:
    10.1007/s10695-018-0582-1
  • 发表时间:
    2018-11
  • 期刊:
    Fish Physiol Biochem
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Chao Yan;Xia Mingzhe;Wu Rongrong;Chen Qichang;Zheng Zhiqin;Qi Delin
  • 通讯作者:
    Qi Delin
Identification, molecular evolution of toll-like receptors in a Tibetan schizothoracine fish (Gymnocypris eckloni) and their expression profiles in response to acute hypoxia
西藏裂腹鱼(Gymnocypris eckloni)Toll样受体的鉴定、分子进化及其响应急性缺氧的表达谱
  • DOI:
    10.1016/j.fsi.2017.07.014
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Fish & Shellfish Immunology
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Qi Delin;Xia Mingzhe;Qi Delin;Xia Mingzhe;Chao Yan;Zhao Yongli;Wu Rongrong
  • 通讯作者:
    Wu Rongrong
黄河裸裂尻鱼MSTN基因RNA干扰研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国实验动物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孔庆辉;晁燕;夏明哲;祁得林
  • 通讯作者:
    祁得林

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其他文献

黄河鮈Cytb基因克隆及其在鮈属中的系统发育
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  • 期刊:
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  • 作者:
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    --
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    动物学研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    祁得林
  • 通讯作者:
    祁得林
黄河裸裂尻鱼细胞色素C氧化酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚基基因的克隆及序列特征分析
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    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    动物学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王国杰;晁燕;杨成;祁得林;申志新
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黄河裸裂尻鱼消化道与肝胰脏淀粉酶的分布与特性研究
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    --
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    祁得林;王国杰;杨成;蒋涛;申志新
  • 通讯作者:
    申志新

其他文献

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祁得林的其他基金

青藏高原特有鱼类血红蛋白多样性格局及其低氧适应性表达调控机制
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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