红树林环境宏基因组文库中新型漆酶基因克隆及功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30970107
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0106.微生物与环境互作
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

漆酶在环境保护、造纸工业、新能源开发等领域具有广泛应用潜力。然而,目前研究的绝大部分漆酶都来自真菌,这主要因为迄今只在几种可培养的原核生物中发现了漆酶基因。因此对细菌漆酶基因的克隆和功能研究亟待加强。为了从占微生物种类99%以上的未培养微生物中寻找新型细菌漆酶基因,申请人在前期研究中首先进行了宏基因组文库的构建与功能基因筛选研究,并克隆到一个酶活高、热稳定性好、pH范围广的新型酯酶基因。基于这些工作基础,我们在本课题中拟从微生物资源丰富而独特的红树林环境样品中建立宏基因组文库,结合SIGEX(底物诱导的基因表达筛选)方法进行高通量筛选以获得新的细菌漆酶基因,然后进行酶学性质的研究,并利用随机分子突变技术,确定与酶活中心相关的关键位点,最终阐明新型漆酶的功能。研究结果不仅获得了具有新功能特性的漆酶,而且为发现新型细菌漆酶基因提供了新的思路,因此具有重要的理论意义和应用潜力。

结项摘要

利用p18GFP和pUC118载体以及高效电击法分别构建了库容量达5500、8000个克隆的两个宏基因组文库。经过文库筛选,最终从文库中获得一个新的全长为1.5 kb的细菌漆酶基因lac591。对该基因进行了原核表达和重组蛋白的酶学性质研究。结果显示,重组漆酶的表达量高达380 mg/L,酶对2,6-二甲基苯酚的比酶活为12.73 U/mg,并对几种经典的漆酶底物也显示了较高的活性。该酶的最适pH为7.5,在pH7.0-10.0范围内酶活稳定。其最适温度是55°C,在50°C以下酶活稳定。另外,研究了该酶对不同底物的kcat和Km的大小。结果表明,催化效率最高(0.28S-1μM-1)的2,6-二甲基苯酚是该酶的最佳底物,其余最佳底物的顺序依次为:邻苯二酚>α-萘酚>愈创木酚>丁香醛连氮>ABTS。为进一步改善该酶的活性和酶学特性,以野生型酶基因为模板,利用易错PCR技术建立了突变文库。通过连续三轮易错PCR及筛库,最后筛选到一个发生了四个氨基酸替换(E316V,F62L,N40S,V55A)的漆酶突变株Lac3T93,其酶活较野生型提高4.8倍。另外,突变酶Lac3T93的最适温度和最适pH分别从野生型酶的55°C和7.5提高到60°C和8.0。对突变酶进行了三维结构的同源建模,三维结构图显示,突变位点V55A和F62L距离漆酶的活性中心较远,位于漆酶蛋白的表面或环状区域,而N40S和E316V两个突变位点没有显示在三维结构中。另外,突变酶对四种工业染料的降解率分别从野生型酶的10%、26%、49%、61%提高到26%、55%、79%和83%,而突变酶对靛红染料的完全降解时间则由60分钟缩短至40分钟。此外,Lac3T93对木质素的降解率从野生型酶的10%提高到15.3%。但是在加入另外两种酶(黄孢原毛平革菌锰过氧化物酶和灰盖鬼伞菌过氧化物酶)后,木质素的降解率高达68.5%,比不加入漆酶的两种酶的木质素降解率(48.9%)提高19.6%,表明加入漆酶后的复合酶系可更高效地降解木质素。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Improving the decolorization for textile dyes of a metagenome-derived alkaline laccase by directed evolution
通过定向进化改善宏基因组衍生的碱性漆酶的纺织染料脱色
  • DOI:
    10.1007/s00253-011-3292-5
  • 发表时间:
    2011-08-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Liu, Yu Huan;Ye, Mao;Li, Gang
  • 通讯作者:
    Li, Gang
Molecular cloning and characterization of a novel beta-glucosidase with high hydrolyzing ability for soybean isoflavone glycosides and glucose-tolerance from soil metagenomic library
土壤宏基因组文库中具有高大豆异黄酮苷水解能力和葡萄糖耐量的新型β-葡萄糖苷酶的分子克隆和表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Bioresource Technology
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Li Gang;Jiang Yang;Fan XinJiong;Liu YuHuan
  • 通讯作者:
    Liu YuHuan
A novel metagenome-derived beta-galactosidase: gene cloning, overexpression, purification and characterization
一种新的宏基因组衍生的β-半乳糖苷酶:基因克隆、过表达、纯化和表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Wang, Kui;Li, Gang;Yu, Shi Qin;Zhang, Chen Ting;Liu, Yu Huan
  • 通讯作者:
    Liu, Yu Huan
Molecular cloning and characterization of a novel metagenome-derived multicopper oxidase with alkaline laccase activity and highly soluble expression
具有碱性漆酶活性和高度可溶性表达的新型宏基因组衍生多铜氧化酶的分子克隆和表征
  • DOI:
    10.1007/s00253-010-2507-5
  • 发表时间:
    2010-04
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Ye, Mao;Li, Gang;Liang, Wei Qu;Liu, Yu Huan
  • 通讯作者:
    Liu, Yu Huan

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  • 作者:
    马培松;李刚;许皓
  • 通讯作者:
    许皓

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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