ARID1A 介导的组蛋白H2B单泛素化修饰在抑制胰腺癌转移中的表观遗传机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81902873
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.5万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

ARID1A, a subunit of SWI/SNF, plays crucial functions in suppressing cancer metastasis, while mutated in approximately 15% of pancreatic cancers. However, the mechanism by which this alteration drives tumor metastasis remains poorly understood. Our preliminary studies found that the function of ARID1A in suppressing pancreatic cancer metastasis was specifically depend on the BC box in its C-terminal domain. Upon BC box, ARID1A potentially activated as E3 ubiquitin ligase targeting H2B. Given H2Bub1 plays essential role on suppressing tumor metastasis by mechanism of facilitating the transcriptional elongation of tumor suppressors via controlling the broad H3K4me3 width. In current proposal, we aim to identify a novel mechanism in which ARID1A functions as E3 ubiquitin ligase of H2B to control pancreatic cancer metastasis, it would help us to find potential therapeutic strategy in pancreatic cancer.
胰腺癌被称为“万癌之王”,是5年生存率最低的癌症,预计未来20年我国胰腺癌确诊患者将增加2倍。ARID1A是最近发现在胰腺癌中突变率前五的基因。ARID1A频繁发生截短突变或者错义突变,导致C-末端结构域功能缺失。然而ARID1A及其C-端结构域在胰腺癌中的生物学功能目前还不明了。我们前期结果表明,ARID1A具有抑制胰腺癌细胞迁移的功能,并且这功能依赖于C-端结构域的BC box模体,随后我们证实ARID1A具有潜在的驱动组蛋白H2B单泛素化(H2Bub1)的泛素连接酶功能,而这一功能依赖于BC模体。因此,我们将采用高通量测序技术(mRNA-seq、ChIP-seq),从体外和体内深入研究ARID1A潜在的泛素连接酶活性在调控胰腺癌转移中的作用机制。该研究将会为制定ARID1A缺失的胰腺癌治疗方案提供理论依据,并有机会找到潜在的治疗靶标。

结项摘要

胰腺癌被称为“万癌之王”,是5年生存率最低的癌症。20%以上的人类癌症中BAF染色质重塑复合物都发生了突变,其成员ARID1A在胰腺癌中突变率最高,达到10%左右。然而,ARID1A在胰腺癌中作用还知之甚少。在该项目中,我们采用CRISPR/Cas9基因编辑工具构建了ARID1A缺失和不同结构域突变ARID1A的PANC1细胞株。然后通过ChIP-seq和RNA-seq分析,发现了一条ARID1A促进胰腺癌抑癌基因表达的全新表观遗传路径:ARID1A通过CBRB结构域与RNF40相互作用介导H2Bub1,进而促进H3K4me3向转录起始位点下游延伸,然后提高基因转录延伸。此外,我们通过分析内源性ARID1A的截断突变产生的不同mRNA异构体,我发现截断突变导致的CBRB缺失的ARID1A异构体具有促进癌症发生的作用。该研究发现了CBRB截断突变的ARID1A异构体是潜在的胰腺癌治疗靶位点。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
PHF13 epigenetically activates TGFβ driven epithelial to mesenchymal transition.
PHF13 表观遗传激活 TGFβ 驱动的上皮间质转化
  • DOI:
    10.1038/s41419-022-04940-4
  • 发表时间:
    2022-05-21
  • 期刊:
    CELL DEATH & DISEASE
  • 影响因子:
    9
  • 作者:
    Sun, Yating;Li, Dan;Liu, Hongmei;Huang, Yongye;Meng, Fanyu;Tang, Jiahao;Li, Zhanjun;Xie, Wanhua
  • 通讯作者:
    Xie, Wanhua

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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