氧自由基在ε-聚赖氨酸生物合成中的生理功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901672
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2003.食品微生物学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The fermentation process of ε-poly-L-lysine (ε-PL) is heavily dependent on external acid environment and intensive cell respiration, which can easily cause excessive accumulation of reactive oxygen species (ROS). However, there is a lack of mechanism understanding of the effect of ROS to cell physiology and ε-PL biosynthesis currently. Our previous study indicates that, ROS at an appropriate level promotes the cell physiological performance for ε-PL biosynthesis, while ROS at extremely high concentration decreases the ε-PL productivity, which indicates that ROS might be a crucial factor in ε-PL biosynthesis. In this program, chemostat cultures at different ROS levels are first established to obtain cells samples for following physiological assays; Based on this, the positive effects of ROS are analyzed at the genes transcription level, while the negative parts are studied at enzymes and metabolism levels, including antioxidant damage, biomembrane status and enzymes activities, energy and central carbon metabolism for ε-PL biosynthesis. Finally, the physiological mechanisms of Streptomyces albulus responding to ROS and its correlation to ε-PL biosynthesis were systematically studied at the levels of cell physiology, metabolism for ε-PL biosynthesis and gene transcription. The excepted results will not only disclose the physiological effects of ROS in ε-PL production, but also lay the foundation for the regulation of cellular redox state through metabolic engineering and biochemical engineering thereafter, which are of great theoretical and practical significances.
ε-聚赖氨酸(ε-PL)生物合成严格依赖于外界酸环境和高强度细胞呼吸代谢,故极易引发ROS的大量积累,而目前ROS在ε-PL生物合成中的生理功能尚不清楚。申请人前期研究发现,一定浓度范围ROS能大幅强化ε-PL合成,而过高浓度ROS又将削弱ε-PL发酵水平,这说明ROS极有可能在ε-PL合成中发挥重要的调控作用。本课题拟采用恒化培养手段,构建具有不同ROS梯度的细胞样本;基于此,从ROS介导的基因转录调控角度解析其积极效应,从氧化损伤、细胞膜机能、ε-PL合成关键酶活性、能量和碳代谢的角度解析其消极效应。由此通过细胞生理、合成ε-PL代谢和基因转录三个层面的研究,系统阐明小白链霉菌对不同水平ROS的生理响应机制及其与ε-PL合成之间的关联。研究结果不仅可揭示ROS在ε-PL生物合成中的生理作用,还将为后续基于自由基水平调控的代谢工程改造和生化工程优化提供理论指导,具有一定的理论和实践意义。

结项摘要

ε-聚赖氨酸(ε-PL)生物合成严格依赖于外界酸环境和高强度细胞呼吸代谢,故极易引发ROS的大量积累,而目前ROS在ε-PL生物合成中的生理功能尚不清楚。申请人前期研究发现,一定浓度范围ROS能大幅强化ε-PL合成,而过高浓度ROS又将削弱ε-PL发酵水平,这说明ROS极有可能在ε-PL合成中发挥重要的调控作用。本课题构建了具有不同ROS梯度的细胞样本;基于此,从ROS介导的基因转录调控角度解析其积极效应,从氧化损伤、ε-PL合成关键酶活性、能量和碳代谢的角度解析其消极效应。由此通过细胞生理、合成ε-PL代谢和基因转录三个层面的研究,系统阐明小白链霉菌对不同水平ROS的生理响应机制及其与ε-PL合成之间的关联。研究发现,胞内适宜浓度ROS(3.3μmol/gDCW)能够强化细胞总体的抗氧化能力,表现在提升SOD、CAT酶活力以及胞内还原力NADPH水平上;此外,此适宜浓度还能够从转录水平、酶活水平、代谢水平增强细胞PPP途径、TCA循环、DAP途径的代谢活力,进而为细胞生长、能量合成、前体赖氨酸合成提供碳骨架;有趣的是,适宜浓度ROS还能够促进和聚赖氨酸合成有关的转录调节子HrdD以及聚赖氨酸合成酶基因pls的转录,进而提升聚赖氨酸合成酶的活力,直接促进产物的合成。相比于最适ROS浓度,过量的ROS将对细胞施加过量的氧化损伤,进而破坏细胞的正常代谢,使得其代谢发生紊乱,进而削弱细胞生长和合成产物的能力。研究结果不仅可揭示ROS在ε-PL生物合成中的生理作用,还将为后续基于自由基水平调控的代谢工程改造和生化工程优化提供理论指导,具有一定的理论和实践意义。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(9)
Physiological analysis of the improved ε-polylysine production induced by reactive oxygen species
活性氧诱导提高 β-聚赖氨酸产量的生理分析
  • DOI:
    10.1007/s00253-022-12343-w
  • 发表时间:
    2022-12-31
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Yue,Chaoping;Su,Zhiwei;Zeng,Xin
  • 通讯作者:
    Zeng,Xin
Tea consumption and colorectal cancer risk: a meta-analysis of prospective cohort studies
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  • DOI:
    10.1007/s00394-020-02195-3
  • 发表时间:
    2020-02
  • 期刊:
    European Journal of Nutrition
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Ming‑zhi Zhu;Dan‑min Lu;Jian Ouyang;Fang Zhou;Pei‑fang Huang;Bao‑zheng Gu;Jun‑wei Tang;Fan Shen;Jia‑feng Li;Yi‑long Li;Hai‑yan Lin;Juan Li;Xin Zeng;Jian‑lin Wu;Shu‑xian Cai;Kun‑bo Wang;Jian‑an Huang;Zhong‑hua Liu
  • 通讯作者:
    Zhong‑hua Liu
Improvement of natamycin production by controlling the morphology of Streptomyces gilvosporeus Z8 with microparticle talc in seed preculture
在种子预培养中用微粒滑石粉控制绿孢链霉菌 Z8 的形态提高那他霉素的产量
  • DOI:
    10.1002/jctb.6668
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Chemical Technology and Biotechnology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Chaoping Yue;Haitao Xu;Yingying Yu;Xin yu;Min Yu;Chen Zhang;Qian You;Shaofan Xia;Zixian Ding;Hao Fu;Xin Zeng;Feng Li
  • 通讯作者:
    Feng Li
Transcriptome and metabolome analysis revealing the improved epsilon-poly-L-lysine production induced by a microbial call from Botrytis cinerea
转录组和代谢组分析揭示了灰葡萄孢微生物诱导的ε-聚-L-赖氨酸产量的提高
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Applied and Environmental Microbiology
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Xin Zeng;Chen Zhang;Chaoping Yue;Zhiwei Su;Baoyan Tai;Hui Tang;Huawei Zeng;Bingyue Xin;Mingzhi Zhu
  • 通讯作者:
    Mingzhi Zhu
Waste cooking oil: new efficient carbon source for natamycin production by Streptomyces gilvosporeus Z8
废弃食用油:Streptomyces gilvosporeus Z8 生产游霉素的新型高效碳源
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Process Biochemistry
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Xin Zeng;Chaoping Yue;Zixian Ding;Lulin Wang;Zhiwei Su;Huawei Zeng;Biao Zhang;Feng Li;Mingzhi Zhu
  • 通讯作者:
    Mingzhi Zhu

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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