秦岭及周边鱼类寄生三代虫科分类及其寄主特异性的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31372158
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Species of Gyrodactylidae are common viviparous and ectoparasites of teleost fishes worldwide and gyrodactylosis, the disease these parasites cause when intensities are high, have had case histories described from every type of fish culture attempted to date, including anguillids, cyprinids, cichlids, ictalurids, pleuronectids, poeciliids, and salmonids. But it is assumed that only about 2% of species in the family Gyrodactylidae are described. This study will examine the morphology, taxonomy, ecology and molecular sequence to ascertain the species, distribution, the characters of biology and host specificity of the gyrodactylids from the fishes in the Qinling Mountains and its surrounding regions, where is one of the key areas in studying the fauna, genesis and evolution of the organisms. We will compare the differences in the morphology and molecular sequence of the complete mitochondrial genome as well as the ribosomal gene sequence between the gyrodactylids species collected in these areas. Taxonomic study of the gyrodactylids revealed a series of previously undescribed species, and clarified the taxonomy of the other gyrodactylids found using traditional morphology, scanning electron microscopy, mtDNA and rDNA sequence data. We will also reconstruct the Gyrodactylidae phylogeny with the molecular sequence data in the study and downloaded from GenBank by using the software MrBayes 3.1.2, PAUP 4 beta, MEGA 5 and RaxML-7.0.3. Therefore, we can be sure that which molecular sequence data can be use in gyrodactylids taxonomic and systematic study. We will analyse the host specificity dynamics of the gyrodactylids species in the Qinling Mountains as well as estimate the importanc to study the taxonomic and systematic problems in fishes by using their parasites information. This study will be of value to those studying the gyrodactylids fauna in China, culturing fishes in freshwater, and will also help management of natural resources and the protection of the environment in the Qinling Mountain region.
三代虫科是主要寄生于鱼类并引起多种养殖种类疾病的卵胎生体外寄生虫,据估计已知种类仅占2%。本研究用传统形态学结合扫描电镜、系统分类学及分子生物学等方法技术系统研究动植物区系特征、起源和演化的关键地区之一的秦岭及周边地区三代虫科的种类、分布、寄主特异性等特征。通过采用常规三代虫形态学研究方法结合蛋白酶消化、扫描电镜观察等研究,正确确定及归属其种类;测序分析这一区域鱼类寄生三代虫全线粒体基因组及核糖体基因序列的部分基因,结合GenBank已知的数据用相关软件进行部分种类系统发育关系研究,评价各分子标记在分类鉴定中的作用和意义,筛选3-5种可用于种类鉴定的分子标记,为系统研究三代虫打下坚实的基础;在种类及分布研究的基础上,进行寄主特异性分析,结合分布于秦岭南北各水系的寄主和三代虫数据,进行其寄主特异性的应用及评价研究,进一步确定其寄主特异性特征。为理清我国动物区系,保护及利用自然资源服务。

结项摘要

三代虫科是主要寄生于鱼类并引起多种养殖鱼类疾病的卵胎生体外寄生虫,目前已知500多种,科学估计已知种类仅占2%,即此类寄生虫大约有20000种左右。本研究用传统形态学结合扫描电镜、系统分类学及分子生物学等方法技术系统研究了动植物区系特征、起源和演化的关键地区之一的秦岭及周边地区三代虫科的种类、分布、寄主特异性等特征。发现三代虫2属36种,其中1中国新纪录属,10新种,6新纪录种。明确了秦岭及周边地区的三代虫区系,并进行了寄主特异性分析。采用清晰显微形态图像到经蛋白酶消化,扫描电镜观察及记录其骨化结构,加上rDNA内转录间隔区基因序列测序的特征来记述三代虫,使我国三代虫科的研究进入世界先进水平的行列。首次研究报道了拟三代虫属条鳅拟三代虫(Paragyrodactylus variegatus)的全线粒体基因组,在已知少量引物的基础上,新设计特异性引物27条(对),为三代虫的分子系统学研究探明了基本的操作规程和实验规范,可满足三代虫科线粒体基因组研究的需求。在此基础上,完成秦岭及周边19种三代虫线粒体基因组的测序工作。总结了三代虫线粒体基因组的结构特征,评价了各分子标记在分类鉴定中的作用和意义。确定秦岭及周边山区养殖虹鳟寄生三代虫的种类为细鳞鲑三代虫(Gyrodactylus brachymystacis),区别于我国东北等地养殖虹鳟寄生的细鳞鱼三代虫(Gyrodactylus lenoki),明确了其来源、感染途径和季节动态等相关知识,总结了养殖鳟鱼寄生三代虫的生态学规律,为鳟鱼养殖和秦岭山区虹鳟养殖业的健康发展及环境风险评价提供基础知识和理论依据。此项目已发表学术论文21篇,其中SCI论文14篇。培养博士研究生2名,硕士研究生11名。

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Thecomplete mitochondrial genome of Paracymoriza distinctalis (Lepidoptera: Crambidae).
Paracymoriza differentalis(鳞翅目:Crambidae)的完整线粒体基因组。
  • DOI:
    10.3109/19401736.2013.869678
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ye Fei;You Ping
  • 通讯作者:
    You Ping
Mitochondrial genomes of praying mantises (Dictyoptera, Mantodea): rearrangement, duplication, and reassignment of tRNA genes.
螳螂(网翅目、螳螂总科)线粒体基因组:tRNA 基因的重排、复制和重新分配
  • DOI:
    10.1038/srep25634
  • 发表时间:
    2016-05-09
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Ye F;Lan XE;Zhu WB;You P
  • 通讯作者:
    You P
Thecomplete mitochondrial genome of Cobitis granoei (Cyprinformes: Cobitidae).
Cobitis granoei(鲤形目:Cobitidae)的完整线粒体基因组。
  • DOI:
    10.3109/19401736.2013.873899
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Song Jing Rui;You Ping
  • 通讯作者:
    You Ping
Comparative analyses within Gyrodactylus (Platyhelminthes: Monogenea) mitochondrial genomes andconserved polymerase chain reaction primers for gyrodactylids mitochondrial DNA
圆环藻(扁形动物:单基因)线粒体基因组内的比较分析和圆环藻线粒体 DNA 的保守聚合酶链反应引物
  • DOI:
    10.1111/jfd.12539
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Fish Diseases
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    叶飞;Russell H Easy;Stanley D;David K Cone;尤平
  • 通讯作者:
    尤平
The complete mitochondrial genome of Pycnarmon lactiferalis (Lepidoptera: Crambidae).
Pycnarmon milkiferalis(鳞翅目:Crambidae)的完整线粒体基因组
  • DOI:
    10.1080/23802359.2016.1214551
  • 发表时间:
    2016-09-04
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA. Part B, Resources
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Chen S;Li FH;Lan XE;You P
  • 通讯作者:
    You P

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其他文献

长江下游三省湖北钉螺不同地理种群的群体遗传结构研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国血吸虫病防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    崔斌;杨坤;张丽;尤平;李石柱
  • 通讯作者:
    李石柱
分子系统地理学及其在湖北钉螺中的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    国际医学寄生虫病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    崔斌;张丽;杨坤;尤平;李石柱
  • 通讯作者:
    李石柱
基于微卫星标记的不同壳型湖北钉螺小尺度景观群体遗传结构研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国人兽共患病学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    崔斌;官威;尤平;李石柱
  • 通讯作者:
    李石柱
染色体构象俘获技术及其研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    生物技术通讯
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尤平;李一锋;赵志虎
  • 通讯作者:
    赵志虎
长江下游3省湖北钉螺不同地理种群的群体遗传结构研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国血吸虫病防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    崔斌;霍志萍;杨坤;张丽;杨频;尤平;李石柱
  • 通讯作者:
    李石柱

其他文献

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尤平的其他基金

中国西部鱼类寄生三代虫科的系统分类研究
  • 批准号:
    31872203
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    62.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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