冰期抑或间冰期避难所:山地植物鸡肫草谱系地理学研究

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基本信息

  • 批准号:
    41561014
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    43.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0103.生物地理与土壤地理
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The chronology of lineage splitting is important for developing a testable hypothesis because it reveals causal mechanisms and forces behind diversification processes. To better understand the evolutionary history of the rich flora of China, phylogeography has been one major focus of evolutionary biology in China during recent years. However, being deeply influenced by the concept of Quaternary glacial refugia and postglacial recolonization, most phylogeographic studies in China often quote the Quaternary glaciation as the causal effect on shaping population divergence, but rarely considered the interglacial/postglacial refugia. More importantly, seldom is there time calibration to support this hypothesis of glacial refugia. In this study, we select a cold-adapted plant species, Parnassia wightiana with a disjunct distribution range in China-Himalaya floristic region to test the hypothesis that cold-adapted montane plants at low latitudes could have interglacial/postglacial refugia rather than glacial refugia. For the purpose, we plan to collect population samples across its distribution range. Then chloroplast markers and about ten nuclear loci will be employed to examine the phylogeographic pattern. In particular, population divergence time will be calculated by means of IMa. Through these efforts, we’d like to find robust evidence of interglacial/postglacial refugia for cold-adapted montane plants at low latitudes of China. The results of this project will provide a framework for the conservation cold-adapted montane plants of china in the context of global warming. In addition, the results will shed lights on the evolution and biogeography of Parnassia.
第四纪避难所是植物谱系地理学研究的主要内容之一。按时间尺度,第四纪避难所可分为冰期避难所和间冰期避难所。然而,我国现有大部分植物谱系地理学研究只考虑冰期避难所,很少有人考虑到间冰期避难所。更为重要的是,大多数此类研究没有群体分化时间的估算,冰期避难所的观点难以被证实。本研究选取中国—喜马拉雅特有种鸡肫草(梅花草属),该物种性喜冷凉气候且呈间断分布格局,这种格局极有可能是间冰期(冰后期)“避难”的结果。我们采用叶绿体和核基因多个基因位点,在研究其谱系地理格局的同时,采用IMa等方法计算群体分化时间,为推测该植物第四纪分布区变迁模式提供精确时间尺度。本研究结果可以确认中国山地喜冷(凉)植物间冰期避难所的存在,为全球气候变暖背景下此类植物的保护提供重要理论依据;另外,研究结果对于理解梅花草属的演化和地理分布也有重要的启示。

结项摘要

对我国许多山地喜冷植物来说,冰期扩张—间冰期收缩已被古孢粉资料所揭示,但是并没有给出较为详细的迁移模式。本研究选用中国—喜马拉雅地区山地喜冷植物鸡肫草为研究对象,解析山地喜冷植物冰期间冰期的种群迁移方式。本实验采用基于叶绿体和核基因序列,对38个居群458个鸡肫草个体进行谱系地理学分析。结果表明鸡肫草群体遗传多样性较高,主要原因可能是第四纪冰期间冰期鸡肫草分布区变化不是很大。鸡肫草遗传分化不明显,可能是鸡肫草祖先单倍型H1很早扩散至各个群体,后又经历了种群片段化。本研究可以推测鸡肫草种群经历了多次扩张收缩事件,因为数据分析中没有加入化石节点,此假说还需要进一步验证。通过对植物标本室标本(包括标本类型)和现存鸡肫草植物的研究,以及对原植物种类和分布的分析,我们发现,在印度北部、中国南部和泰国北部广泛分布的城口梅花草(Parnassia chengkouensis)和宽叶梅花草(P. dilatata)与鸡肫草(P. wightiana)是同一种植物。因此,这两种植物并入鸡肫草P. wightiana中。谱系地理学研究两种植物已经包含在内。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Taxonomic note of Parnassia (Celastraceae) in China: the identity of P-wightiana
中国Parnassia(卫矛科)的分类记录:P. wightiana 的身份
  • DOI:
    10.11646/phytotaxa.375.1.10
  • 发表时间:
    2018-11-09
  • 期刊:
    PHYTOTAXA
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Wang, Yi-Ping;Chen, Shan;Wu, Ding
  • 通讯作者:
    Wu, Ding
被子植物退化雄蕊的功能类型及其意义
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    植物分类与资源学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈珊;任宗昕;王红;吴丁
  • 通讯作者:
    吴丁

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其他文献

蓖麻三磷酸甘油脱氢酶基因(RcGPDH)的克隆及功能分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    中国油料作物学报
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  • 作者:
    弭宪杰;徐荣华;刘爱忠;吴丁;田波;MI Xian-jie1,2,XU Rong-hua2,LIU Ai-zhong2,WU Ding1;2.Xishuangbanna Tropic Botanical Garden,Chinese Ac;3.Jingdezhen Comprehensive College,Jingdezhen 3330
  • 通讯作者:
    3.Jingdezhen Comprehensive College,Jingdezhen 3330
Evaluation of the standard DNA barcodes in Adenophora (Campanulaceae) and its phylogenetic analysis based on ITS sequences
沙参标准DNA条形码评价及其基于ITS序列的系统发育分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Life Science Journal
  • 影响因子:
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  • 作者:
    田双;吴丁
  • 通讯作者:
    吴丁
黄连属植物DNA条形码研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    江西农业大学学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    李波;吴丁
  • 通讯作者:
    吴丁
江西沙参属植物资源及川西沙参新异名
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    景德镇学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王义平;吴丁
  • 通讯作者:
    吴丁

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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