基于DNA折纸组装等离子体纳米探针的单细胞成像分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    22004065
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    16.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2020
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2021-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Obtaining real-time dynamic information of bioactive molecules in the cellular environment is highly crucial for understanding cell behaviors and functions and elucidating the mechanism of physiological processes.Plasmonic nanostructures have been widely used in the fields of biological analysis and single particle imaging of cells due to their unique optical properties. Current plasmonic nanoprobe-based cell optical sensing strategies focus on the interaction between probe and target biomolecule. Where their selectivity and sensitivity are limited by the recognition specificity and optical change after recognition. In this project, the applicant makes full advantages of DNA molecules in specific identification and precise assembly. By employing DNA molecules as a structural basis and functional carrier and integrating plasmonic nanomaterials with unique optical properties, the applicant constructs highly sensitive and multifunctional DNA origami-plasmonic nanoprobes. Moreover, the applicant constructs a multi-modal single-nanoparticle imaging technology and proposes a sensing mechanism based on single-molecule specific recognition induced plasmon-coupled optical signals. Based on the ultra-sensitive nanoprobes and imaging platform, the applicant aims to propose new strategies for real-time and dynamic monitoring of intracellular biomolecules.
获取细胞环境下生物活性分子的实时动态信息对理解细胞行为和功能、阐明生理过程的机理具有重要的意义。表面等离子体共振金属纳米结构凭借独特光学性质,在生物分析和细胞单颗粒成像领域获得广泛的应用。基于等离子体纳米探针的细胞光学传感策略利用探针与目标生物分子相互作用产生信号并对其进行分析,其抗干扰能力以及响应灵敏度分别受到探针对目标分子特异性识别能力和识别前后探针光学性质差异大小的限制。本项目借助DNA折纸技术,充分发挥DNA分子在特异性识别、精确组装方面的优异性能,利用DNA作为结构基础和功能载体,整合具有独特光学性质的等离子体纳米材料,构筑DNA折纸-等离子体纳米探针。并提出基于单分子特异性识别引发等离子体耦合光学信号变化的传感机制,构建一种多视场单颗粒显微成像技术,凭借DNA折纸术介导精确组装高灵敏多功能纳米探针,实现多模态的单细胞高灵敏传感,实现对细胞生理过程的高灵敏实时成像。

结项摘要

获取细胞环境下生物活性分子的实时动态信息对理解细胞行为和功能、阐明生理过程的机理具有重要的意义。表面等离子体共振金属纳米结构凭借独特光学性质,在生物分析和细胞单颗粒成像领域获得广泛的应用。基于等离子体纳米探针的细胞光学传感策略利用探针与目标生物分子相互作用产生信号并对其进行分析,其抗干扰能及响应灵敏度分别受到探针对目标分子特异性识别能力和识别前后探针光学性质差异大小的限制。本项目严格按照既定的研究计划执行,完成所指定的研究目标。首先本项目搭建了共轴双物镜激光暗场显微镜,利用表面等离子体共振耦合散射增强暗场显微成像技术,可以实现毫秒级别颗粒三维空间精准定位。借助DNA折纸技术精确设计组装三维纳米结构,实现纳米探针运动情况的精确追踪。同时本项目利用表面等离子体共振产生近场电磁场增强作用,增益吸附在金属纳米材料表面的有机分子的拉曼散射信号,并且构建了时空分辨拉曼高光谱算法,实现快速的单分子级别拉曼光谱成像。此外,本项目基于自主研制的全内反射暗场显微镜,利用细胞外膜中细胞色素复合物氧化还原状态产生独特的结构色散射,构建无标记结构色显微光谱分析方法,可以实现对生物电化学过程中单个微生物细胞中的电子转移的定量、非侵入分析。本项目目前共发表SCI论文4篇。经费使用方面,本项目严格遵照国家法律法规和南京大学经费管理规定,专款专用,符合预算书的规定。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Label-Free Probing of Electron Transfer Kinetics of Single Microbial Cells on a Single-Layer Graphene via Structural Color Microscopy
通过结构彩色显微镜对单层石墨烯上单个微生物细胞的电子转移动力学进行无标记探测
  • DOI:
    10.1021/acs.nanolett.1c02828
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Nano Letters
  • 影响因子:
    10.8
  • 作者:
    Qing Xia;Xueqin Chen;Changhong Liu;Rong-Bin Song;Zixuan Chen;Jianrong Zhang;Jun-Jie Zhu
  • 通讯作者:
    Jun-Jie Zhu
Plasmonic Probing Single-Cell Bio-Current Waves with a Shrinking Magnetite Nanoprobe
使用收缩磁铁矿纳米探针探测单细胞生物电流波
  • DOI:
    10.1021/acsnano.2c08223
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    ACS Nano
  • 影响因子:
    17.1
  • 作者:
    Zhuodong Tang;Rui Liu;Xueqin Chen;Di Gao;Jian-Rong Zhang;Jun-Jie Zhu;Zixuan Chen
  • 通讯作者:
    Zixuan Chen
DNA functionalized plasmonic nanoassemblies as SERS sensors for environmental analysis
DNA 功能化等离子体纳米组件作为环境分析的 SERS 传感器
  • DOI:
    10.1002/agt2.271
  • 发表时间:
    2022-09
  • 期刊:
    Aggregate
  • 影响因子:
    18.8
  • 作者:
    Jinxiang Li;Xueqin Chen;Jun‐Jie Zhu
  • 通讯作者:
    Jun‐Jie Zhu
Spatiotemporal-Resolved Hyperspectral Raman Imaging of Plasmon-Assisted Reactions at Single Hotspots
单热点等离子体激元辅助反应的时空分辨高光谱拉曼成像
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.1c05545
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Analytical Chemitry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xueqin Chen;Yan Gao;Jiayin Zhan;Qing Xia;Zixuan Chen;Jun-Jie Zhu
  • 通讯作者:
    Jun-Jie Zhu

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其他文献

论治糖尿病之“通阳三法”初探
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中华中医药杂志
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  • 作者:
    朱建平;朱章志;叶笑;陈学勤
  • 通讯作者:
    陈学勤
基于改进Eclat算法的资源池节点异常模式挖掘
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    计算机应用研究
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  • 作者:
    高强;张凤荔;陈学勤;王馨云;耿贞伟;周帆
  • 通讯作者:
    周帆
“首辨阴阳,再辨六经”论治糖尿病前期医案浅析
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    世界中医药
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  • 作者:
    韩蕊;陈学勤;朱章志;朱建平
  • 通讯作者:
    朱建平
Electrophysiological actions o
电生理作用o
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    余勇;陈学勤;胡国渊*
  • 通讯作者:
    胡国渊*
从“神,形,纳,眠,便”初探论治糖尿病
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中华中医药杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    朱建平;刘成;吕英;陈学勤
  • 通讯作者:
    陈学勤

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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