新型琥珀酸-泛醌氧化还原酶抑制剂的分子设计、合成及杀菌活性研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21272092
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0706.药物化学生物学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Succinate ubiquinone oxidoreductase (SQR) has been identified as one of the most important targets for about 20 commerical fungicides. The long-term and frequent use of SQR fungicides has resulted in many pathogen species developing resistance to these fungicides. In this project, the molecular mechanism between inhibitor and SQR and the structure-activity relationship of inhibitors would be studied systematicly based on the crystal structure of SQR and the bioassay method established previously. And the key amino residues for binding of SQR inhibitors would be found out. After that, the pharmacophore-linked fragment virtual screening (PFVS) method developed by our lab would be used to design novel SQR inhibitors with higher activity. With high active inhibitors as probes, we are going to the crystallographic studies of SQR-inhibitor crystal complex. Furthermore, the prediction of resistance risk would be performed for high active compounds by computational mutation scanning (CMS) method developed in our team before. Based on the research cycle composed of molecular design, synthesis, bioassay and the resistance risk prediction, we strive to obtain 2-3 lead compounds with low resistance risk. Hopefully, the implementation of this project will enrich the molecular design theory in pesticide field, leading an intensive contribution to basic research of new pesticide discovery in China.
琥珀酸-泛醌氧化还原酶是当前最重要的农用杀菌剂作用靶标之一,针对该靶标的商品化农用杀菌剂已有近20种。但由于长期的、反复的大规模应用,病原菌针对该类杀菌剂的抗药性发展也日益迅速。本项目以文献报道的SQR晶体结构及本课题组已经建立的SQR抑制剂筛选方法为基础,系统研究商品化抑制剂与SQR相互作用的分子机制及构效关系,明确对抑制剂结合起关键作用的氨基酸残基,采用申请人所在课题组前期发展的药效团连接碎片虚拟筛选分子设计策略开展分子设计研究,培养高活性分子与SQR相结合的复合物晶体并进行结构解析,并采用申请人所在课题组前期发展的计算突变扫描方法对所得到的高活性分子进行抗性风险预测,力争通过分子设计-合成-活性筛选-抗性预测的研究循环,最终获得2-3个具有低抗性风险的新型SQR杀菌剂先导化合物。该项目的实施将进一步丰富完善农药分子设计理论,为我国的新农药创制基础研究作出积极贡献。

结项摘要

琥珀酸脱氢酶是当前最重要的杀菌剂靶标之一。近年来,杀菌剂市场不断有新品种涌现,较为突出是以琥珀酸脱氢酶为靶标的新型杀菌剂。于此同时,对于琥珀酸脱氢酶抑制剂的抗性报道也是层出不穷。因此,设计并合成新型琥珀酸脱氢酶抑制剂是一项具有理论和实际意义的研究课题。通过本项目的实施,我们将有机合成、分子模拟、生物活性测试等方法进行有机的结合,获得了商品化药剂与靶酶之间的相互作用,确认了关键性氨基酸残基,通过PFVS筛选,我们获得了6个hits,通过取代基进一步优化,获得了2个高活性先导化合物,已经公开发表SCI论文5篇和一篇会议论文。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Discovery of N-benzoxazol-5-yl-pyrazole-4-carboxamides as nanomolar SQR inhibitors
发现 N-苯并恶唑-5-基-吡唑-4-甲酰胺作为纳摩尔 SQR 抑制剂
  • DOI:
    10.1016/j.ejmech.2015.03.060
  • 发表时间:
    2015-05-05
  • 期刊:
    EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Xiong, Li;Zhu, Xiao-Lei;Yang, Guang-Fu
  • 通讯作者:
    Yang, Guang-Fu
N-(1-苯胺基-2,2,2-三氯乙基)-1H-吡唑酰胺类抑制剂的设计、合成及生物活性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国科学 : 化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    胡生全;蒋莉娜;杨文超;杨光富
  • 通讯作者:
    杨光富
Computational and Experimental Insight into the Molecular Mechanism of Carboxamide Inhibitors of Succinate-Ubquinone Oxidoreductase
琥珀酸泛醌氧化还原酶羧酰胺抑制剂分子机制的计算和实验见解
  • DOI:
    10.1002/cmdc.201300456
  • 发表时间:
    2014-07-01
  • 期刊:
    CHEMMEDCHEM
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Zhu, Xiao-Lei;Xiong, Li;Yang, Guang-Fu
  • 通讯作者:
    Yang, Guang-Fu

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其他文献

化学溶液沉积法制备YBCO薄膜的快速分解工艺研究
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李志信

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朱晓磊的其他基金

琥珀酸脱氢酶与酰胺类抑制剂的相互作用研究及反抗性杀菌剂分子设计
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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