盐芥WBC家族参与表皮脂类代谢调控及响应干旱的分子机理

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470392
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0204.水分和营养物质的运输与代谢
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

WBC family members of ABC transporters are required for plant cuticular lipids extracellular secretion. WBC11, WBC12 and WBC13 are involved in cuticular lipids metabolism in Arabidopsis. Saltwater cress (Thellungiella salsuginea), a close relative of Arabidopsis, with exceptionally high innate tolerance to stresses including drought has obviously different cuticle. How are WBC family members involved in cuticular lipids metabolism and drought stress response? It is deserve to study. Here we focus on comparative analysis on WBC family from saltwater cress and Arabidopsis. Saltwater cress WBC members were searched from genome wide and their structure, evolution, expresssion and function were analysed by bioinformative methods. One of key WBC members, EhWBC11 will be researched maily on the types of lipids it can translocate and its function in response to drought stress. We plan to overexpress sense EhWBC11 in wild and mutant Arabidopsis, and inhibit EhWBC11 expression in saltwater cress through RNAi technique. To eluciate the types of dimers that EhWBC11 is involved to form, cDNA library is constructed and screened by EhWBC11 bait. This project aim to eluciate the molecular mechanism of WBC family in cuticular lipids metabolism and drought stress response, and thus will offer important proofs to extreme tolerance of saltwater cress to environmental stresses.
ABC转运器中的WBC家族参与植物表皮脂类的分泌过程。已有研究显示拟南芥中WBC11、WBC12和WBC13均参与表皮脂类代谢。盐芥与拟南芥近源,但其具有极强的抗逆性(包括抗旱性)能和显著不同于拟南芥的叶表皮结构。盐芥WBC家族成员如何参与表皮脂类代谢调控、响应干旱胁迫,值得高度关注。本研究对盐芥和拟南芥中的WBC家族展开比较研究,对盐芥全基因组范围的WBC家族基因进行搜索,并进行结构、进化、表达及功能分析。同时通过拟南芥中过量表达、突变体互补和盐芥中减量表达的方法,研究盐芥WBC家族中关键蛋白EhWBC11运输脂类的类型及在盐芥抗旱中的功能。建立盐芥cDNA文库,用EhWBC11为诱饵筛选盐芥cDNA文库,获得盐芥中与EhWBC11互作的蛋白,探讨WBC11形成转运器的方式。本项目旨在解析盐芥WBC家族参与表皮脂类代谢调控及响应干旱胁迫的分子机理,为揭示盐芥适应极端逆境的机制提供重要证据

结项摘要

盐芥是一种与拟南芥近缘的极度抗旱、抗盐和抗低温的植物。盐芥叶表皮具有肉眼可见的与拟南芥巨大差异,是研究植物表皮脂类代谢及调控理想的材料。ABC 转运蛋白家族中的ABCG亚家族(或称WBC 家族)参与了植物表皮脂类(主要为蜡质、角质或木栓质)的分泌过程。本研究对盐芥全基因组范围的WBC 家族基因进行搜索,并进行结构、进化、表达及功能等分析。完成了盐芥WBC家族成员搜索及生物信息分析,包括基因和蛋白质结构分析、进化分析、启动子分析、染色体上的结构及定位分析。通过高通量转录组测序结合荧光定量PCR技术开展了对盐芥WBC家族成员的表达分析,包括不同组织部位的表达和不同胁迫下的表达。同时根据生物信息学分析和高通量测序结果,对TsWBC成员进行基因转录的可变剪接分析和蛋白质之间互作的分析。以盐芥TsWBC11和TsWBC25为例,初步揭示了TsWBC成员在盐芥抗逆中的功能。通过分析化学和转录组测序的手段对盐芥表皮脂类代谢与盐芥抗逆性的关系进行了研究。同时开展了对荒漠植物表皮脂类与抗旱性的关系的研究,包括:胡杨表皮脂类与抗旱性关系的研究;孑遗植物四合木抗干旱和盐碱分子生物学机制初步研究。本项目初步揭示了WBC家族成员的功能,并对盐芥表皮脂类与抗逆性关系开展了较为深入地研究,从表皮脂类代谢的角度,阐述了盐芥抗逆的机制,为揭示盐芥适应极端逆境提供了重要证据,并有望指导作物抗逆育种以服务于农业生产。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(4)
专利数量(0)
镉胁迫对盐芥根木栓质的代谢影响分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    河南农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈宁美;欧阳舒毓;徐维烈;唐帅;韦善君;冯金朝;徐小静
  • 通讯作者:
    徐小静
Cuticle lipids on heteromorphic leaves of Populus euphratica Oliv. growing in riparian habitats differing in available soil moisture
胡杨异形叶上的角质层脂质。
  • DOI:
    10.1111/ppl.12471
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Physiologia Plantarum
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Xu Xiaojing;Xiao Lei;Feng Jinchao;Chen Ningmei;Chen Yue;Song Buerbatu;Xue Kun;Shi Sha;Zhou Yijun;Jenks Matthew A.
  • 通讯作者:
    Jenks Matthew A.
Compositional and transcriptomic analysis associated with cuticle lipid production on rosette and inflorescence stem leaves in the extremophyte Thellungiella salsuginea.
与极端植物 Thellungiella salsuginea 莲座丛和花序茎叶上角质层脂质产生相关的组成和转录组分析。
  • DOI:
    10.1111/ppl.12753
  • 发表时间:
    2018-08
  • 期刊:
    Physiol Plant
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tang S;Chen N;Song B;He J;Zhou Y;Jenks MA;Xu X
  • 通讯作者:
    Xu X
盐芥EsABCG25基因的克隆及其表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生物技术通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    松布尔巴图;陈悦;陈宁美;唐帅;徐小静
  • 通讯作者:
    徐小静
低温胁迫下盐芥和拟南芥蜡质组成及相关基因的表达比较
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    河南农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    唐帅;陈悦;陈宁美;松布尔巴图;何俊卿;周宜君;徐小静
  • 通讯作者:
    徐小静

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其他文献

盐芥EhKCR1 基因的克隆及表达分析
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    --
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    冯金朝
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
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  • 通讯作者:
    周宜君
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韦善君;武运芳;徐小静;高飞;周宜君
  • 通讯作者:
    周宜君
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    河南农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    安会灵;徐小静;张瑾;韦善君;周宜君
  • 通讯作者:
    周宜君
苦丁茶植物资源及分子鉴定研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中央民族大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐小静;郭志永;刘越
  • 通讯作者:
    刘越

其他文献

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徐小静的其他基金

荒漠孑遗植物四合木基于表皮脂类代谢的干旱适应性研究
  • 批准号:
    31971409
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    58 万元
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    面上项目
基于蜡质代谢的盐芥适应干旱的生理生态与分子机制
  • 批准号:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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