条斑紫菜不同世代的代谢流量分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41306151
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Pyropia yezoensis is an important economic seaweed, whose life cycle consists of two generations, a macroscopic haploid foliate gametophyte and a microscopic diploid filamentous sporophyte. The gametophytes and sporophytes have differences not only in morphology, but also in living environments, the gametophytes live in the intertidal zone experiencing hydration and dehydration with the tide, while the sporophytes can not live without seawater. These differences may lead to differences in carbon metabolism pathway of different generations. We intend to use the 13C metabolic flux analysis methods to draw the metabolic flux map of gametophytes and sporophytes, and compare the flux map of gametophytes with that of sporophytes. The research results can help to reveal the differences in carbon fixation pathway of the different generations.
条斑紫菜是我国重要的经济海藻,其生活史包括单倍的叶状体阶段和双倍的丝状体阶段。叶状体和丝状体不仅形态结构不同,其生活环境也不同,叶状体生活于潮间带,随着潮水的涨落经历复水和失水等变化,而丝状体不能脱离海水生长。这些差异可能导致紫菜不同世代碳代谢的差异。本课题拟利用13C代谢流量分析方法绘制紫菜叶状体和丝状体的代谢流量图,对它们的碳代谢途径进行比较分析。研究结果可为揭示条斑紫菜不同世代固碳途径差异提供帮助。

结项摘要

条斑紫菜是我国重要的经济海藻,其生活史包括单倍的叶状体阶段和双倍的丝状体阶段。叶状体和丝状体不仅形态结构不同,其生活环境也不同。这些差异可能导致紫菜不同世代碳代谢的差异。.优化中心碳代谢中间代谢物(带磷酸根的糖类)提取方法,但能检测到的糖种类很少,且检测到的糖类峰都很小,可能因为糖类代谢中间物在细胞内只是瞬态存在,很快转化为其他产物难以检测。氨基酸在胞内含量丰富且易于检测, 其合成与多个关键的中间代谢物,包括糖类密切相关, 因此优化了胞内游离氨基酸提取方法,通过游离氨基酸的标记情况推断其相应前体的标记情况,分别获得了叶状体、游离丝状体及贝壳丝状中心碳代谢相关的中间代谢物所合成的相应氨基酸标记度随时间变化图。.比较叶状体、游离丝状体及贝壳丝状体中心碳代谢相关的中间代谢物所合成的相应氨基酸标记度随时间变化图,发现叶状体碳代谢最快, 具有较强的耐受高盐胁迫的能力,在比较高的盐度下仍保持活性;对叶状体、游离丝状体材料进行了转录组、蛋白组分析,发现两个世代间的差异基因及差异表达蛋白;对叶状体、游离丝状体及贝壳丝状体进行了代谢组比较分析,对其进行两两比较,获得不同状态间差异表达的小分子代谢物,为解析不同世代及不同培养状态下的差异提供基础数据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification and bioinformatics analysis of microRNAs from the sporophyte and gametophyte of Pyropia haitanensis
坛紫菜孢子体和配子体微小RNA的鉴定及生物信息学分析
  • DOI:
    10.1007/s00343-015-4235-2
  • 发表时间:
    2016-03
  • 期刊:
    Chinese Journal of Oceanology and Limnology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄爱优;王广策
  • 通讯作者:
    王广策
Identification of potential internal control genes for real-time PCR analysis during stress response in Pyropia haitanensis
坛紫菜应激反应过程中实时 PCR 分析潜在内参基因的鉴定
  • DOI:
    10.1007/s00343-017-6005-9
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Chinese Journal of Oceanology and Limnology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang Xia;Feng Jianhua;Huang Aiyou;He Linwen;Niu Jianfeng;Wang Guangce
  • 通讯作者:
    Wang Guangce

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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