塔里木河流域微小隐孢子虫地理隔离分化的系统发育研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31702227
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    22.0万
  • 负责人：
    齐萌
  • 依托单位：
    塔里木大学
  • 学科分类：
    C1805.兽医寄生虫学
  • 结题年份：
    2020
  • 批准年份：
    2017
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Cryptosporidium parvum is an important zoonotic protozoan, which subtypes families have the characteristics of geographical segregation. C. parvum IId subtype family was probably dispersed from Western Asia to other geographical regions as a result of introduction of cattles. The Tarim River Basin has a unique hydrological and geographical characteristics, and it is an important trading channel of cattles and sheep from Central Asia to China. Our previous study found that C. parvum was the dominant species of Cryptosporidium from calves in Tarim River Basin that appear to belong to IId family. Thus, in this project, we choose C. parvum isolates from different hosts in the Tarim River Basin as the research objects. Based on the MLST data of C. parvum, the genetic polymorphism, the linkage disequilibrium, as well as the genetic difference degree will be calculated. The present project will focus on understanding the geographical segregation of C. parvum isolates in Tarim River Basin. This results of this study will provide a foundation for better understanding the genetic evolution and mechanism of host-adaptation of C. parvum.
微小隐孢子虫是重要的人兽共患原虫之一，亚型家族存在地理隔离分化特征，其IId亚型家族可能从西亚随着牛的驯化史而扩散至世界各地。塔里木河流域具有独特的水文和地域特点，且为牛、羊等家畜自中亚引入中国的重要通道。申请人项目团队前期研究发现，该流域犊牛以微小隐孢子虫为优势感染种类，基因亚型均属IId亚型家族。鉴于此，本项目拟以塔里木河上游流域不同宿主源微小隐孢子虫为主要研究对象，基于多位点序列分型( MLST)方法，计算其遗传多态性、连锁不平衡及群体分化，采用系统发育分析方法重点研究该流域微小隐孢子虫地理隔离分化特征。研究结果将对深入研究微小隐孢子虫的遗传进化和宿主适应性机制提供基础资料。

结项摘要

微小隐孢子虫是引起人和动物腹泻的常见病原之一，其亚型家族具有遗传多样性和地理隔离分化特征。本项目在分子流行病学调查基础上，重点开展塔里木河流域动物源微小隐孢子虫的种系进化和群体遗传结构研究。. 调查发现，塔里木河流域规模化场新生犊牛普遍感染微小隐孢子虫，鉴定出4个基因亚型，IIdA14G1、IIdA15G1、IIdA19G1 和IIdA20G1，其亚型呈现多样分化和场聚集性分布特征，结果进一步证实微小隐孢子虫IId 亚型家族可能从西亚随着牛进化的过程逐渐形成独立种系和地理隔离。. 在新疆某规模化场新生犊牛隐孢子虫动态感染纵向调查结果显示，微小隐孢子虫主要感染1-4周龄的犊牛，是在前3周龄犊牛发现的唯一的隐孢子虫种类。该研究结果与我国河北、宁夏和江苏牛场犊牛暴发隐孢子虫病的调查结果相一致，提示微小隐孢子虫是新生犊牛主要的腹泻病原之一。. 研究调查了新疆部分地区规模化场猪、双峰驼、地方品种羊和羊驼等动物隐孢子虫感染情况，初步掌握了其隐孢子虫种类分布和遗传多样分化特征；发现多种动物均可感染微小隐孢子虫，其亚型为IIdA14G1或IIdA15G1，且存在不寻常的亚型分化特征，与我国中东部地区以IIdA19G1为主存在地理隔离分化差异，形成区域性遗传结构特征。. 采用MLST技术解析64株塔里木河流域奶牛源不同亚型微小隐孢子虫群体遗传结构特征，8个微卫星和小卫星基因位点多位点序列分型结果显示，在gp60、DZ-HRG和MSC6-7基因位点有序列差异，在而在其他位点均未表现差异，项目数据结果支持新疆部分地区牛源微小隐孢子虫存在多样性分布，为隐孢子虫的地理隔离分化研究提供了基础数据。. 结合课题组的调查研究和国内外报道，上述研究结果提示新疆地区多种动物源微小隐孢子虫存在独特的基因亚型分布特征，特别是不寻常的亚型分化，其多样分化产生的机制尚不明确，下一步将针对新疆地区不同动物源微小隐孢子虫进行单细胞基因组测序和临床致病性等研究，以阐明其多样遗传分化机制。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Prevalence and molecular characterization of Cryptosporidium spp. in pigs in Xinjiang, China
隐孢子虫属的流行率和分子特征。
  • DOI：
    10.1016/j.actatropica.2020.105551
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    Acta Tropica
  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Qi Meng;Zhang Qiyuan;Xu Chunyan;Zhang Ying;Xing Jinming;Tao Dayong;Li Junqiang;Zhang Longxian
  • 通讯作者：
    Zhang Longxian
Longitudinal detection ofCryptosporidiumspp. in 1-10-week-old dairy calves on a farm in Xinjiang, China
隐孢子虫属的纵向检测。
  • DOI：
    10.1007/s00436-020-06904-z
  • 发表时间：
    2020-09-30
  • 期刊：
    PARASITOLOGY RESEARCH
  • 影响因子：
    2
  • 作者：
    Qi, Meng;Zhang, Kuankuan;Li, Junqiang
  • 通讯作者：
    Li, Junqiang
Genetic Diversity of Cryptosporidium parvum in Neonatal Dairy Calves in Xinjiang, China.
新疆新生奶牛小隐孢子虫遗传多样性
  • DOI：
    10.3390/pathogens9090692
  • 发表时间：
    2020-08-23
  • 期刊：
    Pathogens (Basel, Switzerland)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Wu Y;Zhang K;Zhang Y;Jing B;Chen Y;Xu C;Wang T;Qi M;Zhang L
  • 通讯作者：
    Zhang L
Distribution and molecular characterization of Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis, and Enterocytozoon bieneusi amongst grazing adult sheep in Xinjiang, China
中国新疆放牧成年羊隐孢子虫、十二指肠贾第鞭毛虫和比氏肠细胞虫的分布和分子特征
  • DOI：
    10.1016/j.parint.2019.04.006
  • 发表时间：
    2019-08-01
  • 期刊：
    PARASITOLOGY INTERNATIONAL
  • 影响因子：
    1.9
  • 作者：
    Qi, Meng;Zhang, Zhenjie;Zhang, Longxian
  • 通讯作者：
    Zhang, Longxian
Prevalence and genotypic identification ofCryptosporidiumin free-ranging and farm-raised donkeys (Equus asinus asinus) in Xinjiang, China
中国新疆散养和养殖驴（Equus asinus asinus）隐孢子虫的流行情况及基因型鉴定
  • DOI：
    10.1051/parasite/2020042
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    Parasite
  • 影响因子：
    2.9
  • 作者：
    Wang Wen;Zhang Zhenjie;Zhang Ying;Zhao Aiyun;Jing Bo;Zhang Longxian;Liu Pengtao;Qi Meng;Zhao Wei
  • 通讯作者：
    Zhao Wei

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其他文献

The evolution of Ramp;D capability in multinational corporations (MNCs) in emerging markets: evidence from China
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  • 通讯作者：
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马属动物隐孢子虫和隐孢子虫病研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
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  • 影响因子：
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  • 作者：
    齐萌;张龙现
  • 通讯作者：
    张龙现
规模化引种场进口奶牛隐孢子虫种类、基因亚型鉴定及其生物安全评价
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    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    中国人兽共患病学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王臣荣;齐萌;李俊强;张振杰;刘鹏飞;余复昌;曹建科;宁长申;张龙现
  • 通讯作者：
    张龙现
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    齐萌
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    10.16303/j.cnki.1005-4545.2017.12.13
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中国兽医学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    赵爱云;齐萌;江春雨;井波
  • 通讯作者：
    井波

其他文献

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齐萌的其他基金

新疆犊牛源微小隐孢子虫亚型多样分化的遗传机制
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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