miR-143基因启动子区遗传变异影响基因转录调控机制及与宫颈癌发生危险性的研究

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基本信息

  • 批准号:
    81302502
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Cervical cancer is the second most common diagnosed deadly cancer among females and the most frequently diagnosed malignancy of the female reproductive tract in China. HPV infection is one of the most important factors for cervical cancer, but only a small number of infected people eventually suffer from cervical cancer, indicating that genetic susceptibility involves the reaction of HPV infection. Studies have confirmed that genetic variation (most is SNP) determines individual genetic susceptibility. Recent years, miRNA as a new type of tumor oncogene or suppressor gene has been extensively studied. miRNA involves in a variety of biological pathways, including antiviral immune regulation, therefore, miRNA relevant genetic variation may affect tumor development. Studies have shown that, miR-143 plays as a tumor suppressor gene in the development of cervical cancer. The exact mechanism of its low expression in cervical cancer has not been elucidated. This study will be screening the SNPs within the promoter region of the miR-143 gene which may affect the regulation of gene transcription. The application of cell and molecular techniques, such as reporter assay, EMSA, and real-time quantitative PCR will validated the function of these SNPs. Based on this, we will further analyze the association between the functional SNPs and cervical cancer development, looking for biomarkers for genetic susceptibility. The results of research will have a guiding significance for high risk population screening and individualized prevention of cervical cancer.
宫颈癌高居我国妇女恶性肿瘤前列,患病率居女性生殖道恶性肿瘤的首位。HPV感染是宫颈癌发病的最主要因素之一,但只有少数感染者最终罹患宫颈癌,提示个体对宫颈癌发病具有遗传易感性。研究表明,基因遗传变异(以SNP为主)决定了个体遗传易感性。近年来,miRNA作为一种新的肿瘤癌基因和抑癌基因被广泛研究,参与了包括抗病毒免疫调控在内的多种生物学通路,其遗传变异可影响肿瘤的发生发展。已有研究表明,miR-143发挥抑癌基因作用参与宫颈癌发生发展,其在宫颈癌中低表达的确切机制尚未阐明。本研究将筛选miR-143基因启动子区潜在可影响基因转录调控的SNPs,应用报告基因、EMSA、实时定量PCR等技术和方法对SNPs进行功能学验证;在此基础上,运用分子流行病学研究方法,分析具有调控功能的SNPs与宫颈癌发生危险性的关联性,寻找易感生物标志物。研究结果对宫颈癌高危人群筛检和个体化预防有重要指导意义。

结项摘要

miR-143作为抑癌基因在多肿瘤包括宫颈癌中低表达,其发病机制尚未阐明。本研究通过筛选miR-143基因启动子区潜在可影响基因转录调控的SNPs,采用两阶段的病例-对照研究,分析启动子区遗传变异与宫颈癌遗传易感性的关系,并探讨潜在功能性位点的生物学机制。本研究共筛选出该区域20个SNPs,在第一阶段病例-对照研究中,共纳入571例宫颈癌患者和657对照。结果发现miR-143基因启动子区的rs726953,rs12517403和rs13177623均能够显著增加宫颈癌的发病风险(rs726953: OR =1.71, 95%CI = 1.20-2.43; rs12517403: OR =1.48, 95%CI = 1.15-1.89; rs13177623: OR =1.38, 95%CI = 1.08-1.78)。在第二阶段的954例宫颈癌患者和1339例对照样本中进一步验证,发现rs12517403在共显性模型中仍可增加宫颈癌的发病风险(OR =1.34, 95%CI = 1.11-1.61)。生物信息学预测,发现rs12517403可影响转录因子SP1与miR-143启动子区的结合。通过双荧光素酶报告基因实验,发现相对于rs12517403野生T等位基因,突变C等位基因能够降低miR-143基因启动子区转录活性,从而导致miR-143表达下调。同时,运用生物信息学对TCGA宫颈癌数据库进行分析,发现199例宫颈癌组织携带rs12517403野生纯合基因型TT,73例携带杂合基因型TC,9例携带纯合突变基因型CC,但三者表达值没有显著差异(P=0.281)。rs12517403与组织miR-143表达的关联性需在中国人群宫颈癌组织及癌旁正常组织中进一步验证。综上所述,miR-143基因启动子区rs12517403多态性位点可能通过改变miR-143基因启动子区的转录因子SP1结合能力,从而影响了miR-143的表达,最终导致宫颈癌的遗传易感性改变。该研究的发现对于宫颈癌的早期诊断和预防具有一定的指导意义。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The rs767649 polymorphism in the promoter of miR-155 contributes to the decreased risk for cervical cancer in a Chinese population.
miR-155启动子中的rs767649多态性有助于降低中国人群患宫颈癌的风险。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Gene
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Lu; Xiaoyun;Zhang; Zhengdong;He; Aiqin;Jin; Hua
  • 通讯作者:
    Hua
A novel mechanism of rs763110 polymorphism contributing to cervical cancer risk by affecting the binding affinity of C/EBPbeta and OCT1 complex to chromatin.
rs763110 多态性通过影响 C/EBPbeta 和 OCT1 复合物与染色质的结合亲和力而增加宫颈癌风险的新机制。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Int J Cancer
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Cao; Xiaoli;Li; Xiaobo;Zhang; Zhengdong;Chen; Rui
  • 通讯作者:
    Rui
FAS rs2234767 and rs1800682 polymorphisms jointly contributed to risk of colorectal cancer by affecting SP1/STAT1 complex recruitment to chromatin.
FAS rs2234767 和 rs1800682 多态性通过影响 SP1/STAT1 复合物向染色质的募集而共同增加结直肠癌的风险。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li; Xiaobo;Zhang; Jinchun;Chen; Rui;Wang; Meilin
  • 通讯作者:
    Meilin
miR-107 regulates tumor progression by targeting NF1 in gastric cancer.
miR-107 通过靶向胃癌中的 NF1 来调节肿瘤进展。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tao; Guoquan;Zhou; Jianwei;Zhang; Zhengdong;Wang; Meilin
  • 通讯作者:
    Meilin
PSCA rs2294008 polymorphism contributes to the decreased risk for cervical cancer in a Chinese population.
PSCA rs2294008 多态性有助于降低中国人群患宫颈癌的风险。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang; Meilin;Chen; Rui;Jin; Hua;Zhang; Zhengdong
  • 通讯作者:
    Zhengdong

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其他文献

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MiR-143/145宿主基因CARMN低表达参与宫颈癌遗传易感及其机制研究
  • 批准号:
    81872684
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    57.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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