番茄茎尖分生组织成熟决定开花时间和花序结构的分子机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900174
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Inflorescences originate from stem cells which are in shoot apical meristem (SAM). Meristem maturation is a precisely regulated programmatic process, during which the stem cell fate switches from vegetative to reproductive growth. Differences of meristem maturation determine the quantity and configuration of branches and flowers within inflorescence, which is a determinative factor of successful reproduction in plants and yield in agriculture. Achieving ideal inflorescence architecture is essential for fruit crops. ALOG family contains 12 members in tomato, in addition to TMF, we obtained the mutants of other genes which are highly expressed in SAM by CRISPR/Cas9 gene editing technology, and generated different double, triple, quadruple, quintuple mutants by crossing. Compared with WT, mutants have advanced flowering time and simple inflorescence architecture, suggesting that ALOG family members play important roles in regulating flowering and inflorescence architecture of tomato. In this project, we will use tomato as a research model, based on the gradual maturation of SAM to determine the inflorescence architecture and flowering time, using traditional strategies such as molecular genetics, biochemistry, cell biology, combined with transcriptomics of specific tissue microdissection and DAP-seq to identify the molecular regulatory network that regulates the inflorescence architecture and flowering in tomato.
植物干细胞组成的茎尖分生组织(Shoot Apical Meristem,SAM)的成熟很大程度上决定植物丰富多样的花序结构。番茄 SAM 的成熟是一个被精准调控的程序化过程,决定番茄的开花时间和花序结构,进而决定果实的收获时间和产量,所以获得理想花序结构对收获果实的蔬菜作物产量至关重要。番茄ALOG 家族一共12个成员,我们通过CRISPR/Cas9技术获得ALOG家族其它在SAM高表达基因的缺失突变体,并通过杂交获得不同组合的多突变体,这些突变体的开花时间提前,花序结构简单化,说明ALOG家族成员在调控番茄开花时间和花序结构中具有重要作用。本项目将根据SAM成熟的程序化过程决定花序结构和开花时间的原理,运用分子遗传学、生物化学、细胞生物学等传统策略,结合特异组织显微切割转录组学和顺式调控元件鉴定组学(DAP-seq)等新兴技术,解析番茄花序结构和开花的分子调控网络。

结项摘要

植物干细胞组成的茎尖分生组织(Shoot Apical Meristem,SAM)的成熟很大程度上决定植物丰富多样的花序结构。番茄 SAM 的成熟是一个被精准调控的程序化过程,决定番茄的开花时间和花序结构,进而决定果实的收获时间和产量,所以获得理想花序结构对收获果实的蔬菜作物产量至关重要。基因组复制过程中的启动子和编码区变异,通常会产生基因表达的时空和蛋白功能出现差异的家族成员,这些成员可能保持原本功能,也可能出现新功能,分工协作保证植物在遭遇遗传突变和环境改变下维持稳健发育,但家族成员实现如何实现协同作用和合理分工的分子机制并不清楚。本项目根据SAM成熟的程序化过程决定花序结构和开花时间的原理,以番茄为研究对象,运用分子遗传学、生物化学、细胞生物学、基因编辑等方法和技术,解析了ALOG家族成员TMF,TFAM1,TFAM2,TFAM3通过蛋白质相分离和蛋白相互作用形成以TMF为核心的转录凝聚体,靶向下游成花基因AN抑制其过早表达,精确控制番茄SAM程序化成熟过程,从而调控番茄花序结构和开花的分子机制。首次在作物中发现了蛋白质相分离现象,揭示了转录因子家族成员通过蛋白质相分离实现家族分工和转录协同的全新机制。丰富了茎尖分生组织成熟程序化调控的分子机理,有助于解析直接决定番茄产量的花序结构和开花时间的调控机理,为番茄品种改良提供了新的分子模块和研究思路。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Heterotypic transcriptional condensates formed by prion-like paralogous proteins canalize flowering transition in tomato.
由类朊病毒旁系同源蛋白形成的异型转录缩合物促进番茄开花转变
  • DOI:
    10.1186/s13059-022-02646-6
  • 发表时间:
    2022-03-14
  • 期刊:
    Genome biology
  • 影响因子:
    12.3
  • 作者:
    Huang X;Xiao N;Zou Y;Xie Y;Tang L;Zhang Y;Yu Y;Li Y;Xu C
  • 通讯作者:
    Xu C
ROS regulated reversible protein phase separation synchronizes plant flowering
ROS调节可逆蛋白质相分离同步植物开花
  • DOI:
    10.1038/s41589-021-00739-0
  • 发表时间:
    2021-02-25
  • 期刊:
    NATURE CHEMICAL BIOLOGY
  • 影响因子:
    14.8
  • 作者:
    Huang, Xiaozhen;Chen, Shudong;Xu, Cao
  • 通讯作者:
    Xu, Cao

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其他文献

“调气”电针远端腧穴对神经根型颈椎病大鼠PGE2含量、COX-2蛋白及其mRNA的影响
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  • 发表时间:
    2018
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    辽宁中医杂志
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  • 通讯作者:
    赵骏
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    辽宁中医杂志
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    邱菊
电针远端腧穴对神经根型颈椎病模型大鼠镇痛相关因子影响
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针灸辨证治疗神经根型颈椎病研究概况
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  • 通讯作者:
    黄霞

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黄小珍的其他基金

活性氧触发蛋白质相分离控制番茄程序化花器官脱落的分子机制研究
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  • 批准年份:
    2022
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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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