菲律宾海盆线虫群落结构与生物多样性特征

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41706163
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Nematode is the most abundant metazoan on earth, accounting for more than 90% in deep-sea habitats, and plays an important role in deep-sea benthic ecosystem. It is very difficult for taxonomy of deep-sea nematodes because of its small body size and low density in deep-sea sediments. Thus, the study of deep-sea nematodes is very insufficient. Molecular biology is a forceful tool to make up for the shortcomings in traditional morphological taxonomy and has been applied in several studies of deep-sea nematodes. The Philippine Basin is close to China seas and is the strategic choice for deep-sea research of China. At present, a large number of scientific researches have been carried out in this area, but its benthos biodiversity has not yet been studied, despite that its complex environment may raise a high degree of biodiversity. The author found that the Philippine Basin has high species diversity of nematodes at the local scale (a single station), close to that in the Yellow Sea, slightly lower than that in the East China Sea. Accordingly, we propose two main scientific problems in this study: whether the high diversity of nematodes at the local scale in Philippine Basin has the same patterns at the regional scale? What are the main factors driving the species diversity and distribution of nematodes in Philippine Basin? In this project, we will use the traditional morphological and molecular biology techniques to analyze the nematode communities in the Philippine basin, to unmask the community structure and biodiversity of nematodes, to discover new species and hidden species, to reveal its biodiversity characteristics based on the species diversity data and molecular diversity data. This project will provide a reliable background data for the study of deep-sea biodiversity in the Western Pacific Ocean and is expected to lay a foundation for further research on the biogeography and evolution of deep-sea nematodes.
线虫是地球上数量最多的后生动物,在深海底栖环境中占后生动物数量的90%以上。深海线虫由于个体小、丰度低,因此分类鉴定十分困难,对其物种多样性构成无论是在局域还是区域尺度上都知之甚少。菲律宾海盆是我国开展深海研究的战略优选区域,海底具有多样化的生境,但有关线虫的多样性仍然未知。申请人前期研究发现,菲律宾海盆的线虫在局域上具有高物种多样性,与黄海的相近,仅略低于东海陆架海域。由此,本研究提出的主要科学问题是:菲律宾海盆线虫局域上的高多样性是否在区域尺度上有同样的模式?驱动该海域线虫物种多样性及分布的主要因素是什么?本项目拟利用传统形态学和分子生物学技术,解析菲律宾海盆的底栖线虫群落结构组成和分布特点,发现新物种和隐存种,通过物种组成和分子多样性两个层次揭示其多样性特点及其主要驱动因素。本项目将为西太平洋深海生物多样性和分布研究提供翔实可靠的本底资料,为深入研究深海线虫的生物地理学奠定基础。

结项摘要

线虫在深海底栖环境中占后生动物数量的90%以上,但由于深海线虫个体小、丰度低,其分类鉴定十分困难,对其物种多样性构成无论是在局域还是区域尺度上都知之甚少。菲律宾海盆是我国开展深海研究的战略优选区域,但有关线虫的多样性仍然未知。项目按照研究计划执行,包括对菲律宾海盆及邻近海域多个生境的小型底栖生物样品采集、分类鉴定和群落结构分析;对线虫DNA序列提取和扩增,对重要类群进行系统发育研究;对深海沉积物的总DNA进行了提取和高通量测序分析。项目揭示了菲律宾海盆深海小型底栖生物和线虫的群落结构和生物多样性特点,发现西太平洋小型底栖生物平均丰度为(147±93)ind/10 cm2,其中线虫是最优势类群,占比极高(93.56%);比较不同海区小型底栖生物研究发现,小型底栖生物丰度随着深度的增大呈现降低趋势。对海槽、深海平原、海沟和海山等不同生境的深海沉积物样品进行了高通量测序分析,获得了小型底栖生物的分子多样性数据,发现小型底栖生物和线虫的分布与距离相关。对分选出的线虫进行了分类鉴定,获得了深海线虫物种组成,发现并报道了线虫新物种:Actinonema falciforme Shi & Xu, 2018, Paramphimonhystrella longispicula Shi & Xu, 2017, P. eurystoma Shi & Xu, 2017, Africanema multipapillatum Shi & Xu, 2018。项目发表研究论文5篇,其中SCI收录论文3篇。通过本项目,获得了西太平洋深海小型底栖生物的群落结构和线虫的物种组成情况,为西太平洋深海线虫多样性研究提供一份翔实可靠的本底资料,为未来深入研究深海线虫生物地理格局奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Morphological and molecular characterizations of Africanema multipapillatum sp. nov. (Nematoda, Enoplida) in intertidal sediment from the East China Sea
Africaema multipapillatum sp. 的形态和分子特征。
  • DOI:
    10.1007/s12526-017-0690-7
  • 发表时间:
    2018-03
  • 期刊:
    Marine Biodiversity
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Benze Shi;Kuidong Xu
  • 通讯作者:
    Kuidong Xu
西北太平洋深海小型底栖生物群落结构与分布特点初探
  • DOI:
    10.11693/hyhz20191200265
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蒲思潮;史本泽;徐奎栋
  • 通讯作者:
    徐奎栋
Two new species of Paramphimonhystrella (Nematoda, Monhysterida, Xyalidae) from the deep-sea sediments in the Western Pacific Ocean and adjacent shelf seafloor
西太平洋和邻近陆架海底深海沉积物中的两个新种Paramphimonhystrella(线虫纲、Monhysterida、Xyalidae)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Zootaxa
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    BENZE SHI;TINGTING YU;KUIDONG XU
  • 通讯作者:
    KUIDONG XU
莱州湾和牟平近海夏季小型底栖生物群落组成及环境状况分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    海洋科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蒲思潮;史本泽;张光涛;徐奎栋
  • 通讯作者:
    徐奎栋

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其他文献

中国海洋底栖生物学发展回顾与展望
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    海洋科学集刊
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张均龙;史本泽;赵峰;徐奎栋
  • 通讯作者:
    徐奎栋

其他文献

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中国海嘴刺目线虫系统分类与多样性研究
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  • 批准年份:
    2021
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    面上项目
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    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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