多巴胺代谢相关长非编码RNA调控飞蝗型变可塑性的机理研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31430023
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    317.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0509.生物学过程与代谢
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Animal aggregation is a common phenomenon in nature. Phase change from solitaria to gregaria is the major reason for locust outbreak. The metabolism of neurotransmitters, such as dopamine, plays a central role in the control of locust phase change plasticity. However, little is known about the mechanism underlying the metabolic regulation. Preliminary study revealed that long noncoding RNAs (lncRNA) may be involved into the regulation of phase state changes. Nevertheless it is rarely documented how the lncRNAs control the regulation of neurotransmitter metabolism and phase change plasticity. In this project we will investigate the lncRNAs involving in the regulation of neurotransmitters synthesis and downstream pathways, and modulation of locust phase change plasticity. We’ll establish the relationship between lncRNA-target gene (e.g., Henna)-phase change plasticity by using molecular, biochemical and behaviorial methods. Last, we’ll measure the protein-lncRNA complex poising for expresion regulation. Our study will be the first attempt to examine the regulatory role of lncRNA in neurotransmitter metabolisms, and will establish a model for studying relation between lncRNA and animal behavior. The findings are expected to reveal the regulatory mechanism for locust phase change and direct the control of locust plague.
动物群聚行为是自然界的一个普遍现象,飞蝗从散居到群居的型变可塑性是导致蝗灾形成和暴发的原因。神经递质如多巴胺代谢对飞蝗行为可塑性起关键控制作用,但其代谢通路调控的分子机制并不清楚。初步研究发现长非编码RNA(lncRNA)可能在飞蝗群、散两型分化中对基因表达起调控作用,但是lncRNA在神经递质代谢调节和表型可塑性控制方面的功能鲜有报道。本项目从基因组水平筛选在神经递质生成代谢或者信号转导通路中,与飞蝗型变可塑性相关的lncRNA。通过分子生物学、生物化学和行为学等方法,建立lncRNA-靶标基因(如苯丙氨酸羟化酶编码基因Henna)-型变可塑性三者的相关关系,并揭示调节过程中lncRNA-蛋白复合物相互关系。本研究首次尝试揭示lncRNA对神经递质合成代谢的调控机制,并建立lncRNA和动物行为可塑性的关系模型。该研究结果将对揭示飞蝗型变调节机制和指导蝗灾的控制有重要的理论和实践意义。

结项摘要

动物群聚行为是自然界的一个普遍现象,飞蝗从散居到群居的行为型变是导致蝗灾形成和暴发的原因。长链非编码RNA如何通过神经调节网络来影响飞蝗行为转变的机制还不清楚。我们利用高通量RNA测序的方法筛选得到10,304条长链非编码RNA转录本,描述了长链非编码RNA和mRNA在飞蝗型变的时间过程中的表达变化模式。在型变的时间处理的早期阶段,长链非编码RNA比mRNA的反应更快。分析获得多个在群居化和散居化中均为核心节点的长链非编码RNA。更重要的,发现核富集的lncRNA PAHAL对于多巴胺生物合成和飞蝗行为调控的调节机制。PAHAL对于编码苯丙氨酸羟化酶的PAH基因来说是一个sense的转录本。PAH负责催化以苯丙氨酸为前体的多个生物胺的生成。PAHAL通过激活PAH的表达影响飞蝗脑中多巴胺的产生。另外,PAHAL还能影响飞蝗的种群密度依赖的聚集行为。其中蕴含的分子机制是,PAHAL通过招募有转录因子和剪切因子双功能的丝氨酸/精氨酸富含的剪切因子,SRSF2到PAH的近启动子的位置,来激活PAH的转录。PAHAL的这个共激活作用要求PAHAL/SRSF2复合物与PAH启动子相关的新生RNA的相互作用。因此,我们的数据支持这个lncRNA反馈调节动物行为可塑性的模型。在这个模型中,lncRNA通过一个精密的局部转录环来调节神经递质的产生。这个工作为研究飞蝗的型变提供了新的视角并拓展了对长链非编码RNA调控动物行为的认识。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Dop1 enhances conspecific olfactory attraction by inhibiting miR-9a maturation in locusts.
Dop1 通过抑制 miR-9a 成熟来增强蝗虫的同种嗅觉吸引力
  • DOI:
    10.1038/s41467-018-03437-z
  • 发表时间:
    2018-03-22
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Guo X;Ma Z;Du B;Li T;Li W;Xu L;He J;Kang L
  • 通讯作者:
    Kang L
MicroRNA-276 promotes egg-hatching synchrony by up-regulating brm in locusts
MicroRNA-276通过上调蝗虫的brm促进卵孵化同步
  • DOI:
    10.1073/pnas.1521098113
  • 发表时间:
    2016-01-19
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    He, Jing;Chen, Qianquan;Kang, Le
  • 通讯作者:
    Kang, Le
Comparative genomic analysis of SET domain family reveals the origin, expansion, and putative function of the arthropod-specific SmydA genes as histone modifiers in insects.
SET 结构域家族的比较基因组分析揭示了节肢动物特异性 SmydA 基因作为昆虫组蛋白修饰剂的起源、扩展和假定功能
  • DOI:
    10.1093/gigascience/gix031
  • 发表时间:
    2017-06-01
  • 期刊:
    GigaScience
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Jiang F;Liu Q;Wang Y;Zhang J;Wang H;Song T;Yang M;Wang X;Kang L
  • 通讯作者:
    Kang L
Genome-wide identification and developmental expression profiling of long noncoding RNAs during Drosophila metamorphosis.
果蝇变态过程中长非编码RNA的全基因组鉴定和发育表达谱分析
  • DOI:
    10.1038/srep23330
  • 发表时间:
    2016-03-21
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Chen B;Zhang Y;Zhang X;Jia S;Chen S;Kang L
  • 通讯作者:
    Kang L
miR-71 and miR-263 Jointly Regulate Target Genes Chitin synthase and Chitinase to Control Locust Molting.
miR-71和miR-263联合调控靶基因几丁质合酶和几丁质酶控制蝗虫蜕皮
  • DOI:
    10.1371/journal.pgen.1006257
  • 发表时间:
    2016-08
  • 期刊:
    PLoS genetics
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Yang M;Wang Y;Jiang F;Song T;Wang H;Liu Q;Zhang J;Zhang J;Kang L
  • 通讯作者:
    Kang L

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作为昆虫嗅觉进化重要节点的飞蝗嗅觉编码与处理机理研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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