基因组重组比较算法与复杂性研究

项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    60573024
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0201.计算机科学的基础理论
  • 结题年份:
    2008
  • 批准年份:
    2005
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2006-01-01 至2008-12-31

项目摘要

研究基因组重组排序类问题的算法与复杂性。证明无向基因组Translocation排序的计算复杂性和近似计算复杂性,设计该问题1.75近似度多项式时间近似算法。设计无向基因组Reversal+Translocation排序1.5近似度多项式时间近似算法。证明Transposition排序的计算复杂性,设计该问题改进多项式时间近似算法。设计有向基因组Reversal+Transposition排序的多项式时间精确算法,设计无向基因组Reversal +Transposition排序1.5近似度多项式时间近似算法。重组排序计算结果直接用于度量两种生命的特征差异,推导两者的演化关系。研究生命的演化关系和演化规律,在农业生产、疾病防治、医药设计中具有显著应用价值。快速有效的生命信息比较计算方法已经成为分子生物学和医学研究与实践中探索生命演化规律的重要工具。

结项摘要

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项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(4)
专利数量(0)
一般设施定位问题计算复杂度和近似算法研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    计算机研究与发展, 44(5):790-798, 2007. (EI收录)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
Faster Algorithms for Sorting by Transpositions and Sorting by Block Interchanges
更快的转置排序和块交换排序算法
  • DOI:
    10.1145/1273340.1273341
  • 发表时间:
    2007-08-01
  • 期刊:
    ACM TRANSACTIONS ON ALGORITHMS
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Feng, Jianxing;Zhu, Daming
  • 通讯作者:
    Zhu, Daming
A 1.75-approximation algorithm for unsigned translocation distance
无符号易位距离的 1.75 近似算法
  • DOI:
    10.1016/j.jcss.2007.03.009
  • 发表时间:
    2005-12
  • 期刊:
    J. Comput. Syst. Sci.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
A polynomial algorithm to compute the minimum degree spanning trees of directed acyclic graphs with application to the broadcast problem
计算有向无环图最小度生成树的多项式算法及其在广播问题中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
有向无环图最小度生成树问题的一种近似算法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    计算机研究与发展,已录用,带发表。
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
共 8 条
  • 1
  • 2
前往

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基因组移位排序的多项式时间算法
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    朱大铭
PQ-树断点距离中心问题的复杂性和精确算法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    计算机研究与发展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘培霞;姜海涛;朱大铭
  • 通讯作者:
    朱大铭
Predicting Model and Algorithm in RNA Folding Structure Including Pseudoknots
包括假结在内的 RNA 折叠结构的预测模型和算法
  • DOI:
    10.1142/s0218001418510059
  • 发表时间:
    2018-06
  • 期刊:
    International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence
  • 影响因子:
    1.5
  • 作者:
    刘振栋;朱大铭;戴琼海
  • 通讯作者:
    戴琼海
短块移动排序的14/11近似算法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    中国科学:信息科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜海涛;朱大铭
  • 通讯作者:
    朱大铭
基于深度卷积神经网络的无序蛋白质功能模体的识别
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    济南大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    方春;田爱奎;孙福振;李彩虹;朱大铭
  • 通讯作者:
    朱大铭
共 12 条
  • 1
  • 2
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