节律钟和光周期调控水稻代谢组及抽穗期的分子机理

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31530052
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    281.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Understanding the genetic basis and regulation of the diversity of plant metabolites is of crucial importance in plant biology. As the bridge between the genome and the phenome, the plant metabolome is the material basis of all aspects of biological processes in plants. Rice is one of the most important crops in China and worldwide. Circadian clock and photoperiod are the key internal and external factors that determine the metabolome and also the heading date in rice. Using a novel widely-targeted metabolic profiling strategy developed by us that can quantify nearly 1000 metabolites in 30 minutes. We have found that about 20% of the metabolome showed circadian accumulation in rice leaf. We have also preliminary identified a compound that is involved in the regulation of heading date. This compound is controlled by Ghd7 and we have also precisely mapped other loci that regulate the content of the metabolite. In this application, we will use the combined forward and reverse genetic strategies, together with approaches integrating biochemistry, molecular biology, and bioinformatics, to investigate the genetic and biochemical bases of the regulation of metabolome by circadian clock and photoperiod. We also intend to find out how circadian clock and photoperiod determine heading date through manipulate metabolism in rice.
植物代谢物多样性的遗传基础及其调控是植物生物学重要科学问题。植物代谢组做为基因组与表型组的桥梁,是植物各种生物学过程的物质基础。水稻是我国及世界上最重要的作物之一,抽穗期是决定水稻产量最为重要的农艺性状之一。节律钟和光周期是调控植物代谢最重要的内、外因子,也是决定水稻抽穗的重要因素。申请者利用自己开发的能够在30分钟内定量近1000种代谢物的新广泛靶向代谢组学分析方法研究了长日照条件下水稻苗期叶片及根的代谢组动态变化,结果表明约20%的代谢物的积累具有明显的节律,同时筛选到一种受到Ghd7控制,参与节律钟和光周期调控水稻抽穗的代谢物,并精确定位了其遗传控制位点。本申请将在此基础上采用正反向遗传学相结合的手段,综合利用遗传学、生物化学、分子生物学和生物信息学等方法,解析组织特异性节律钟和光周期调控水稻代谢组的遗传和生化基础,阐明节律钟和光周期通过代谢物调控水稻抽穗期的分子机理。

结项摘要

植物代谢物多样性的遗传基础及其调控是植物生物学重要科学问题。植物代谢组做为基因组与表型组的桥梁,是植物各种生物学过程的物质基础。水稻是我国及世界上最重要的作物之一,抽穗期是决定水稻产量最为重要的农艺性状之一。节律钟和光周期是调控植物代谢最重要的内、外因子,也是决定水稻重要农艺性状的重要因素。申请者利用自己开发的能够在30分钟内定量近1000种代谢物的新广泛靶向代谢组学分析方法研究了长日照条件下水稻苗期叶片及根的代谢组动态变化,结果表明约20%的代谢物的积累具有明显的节律。本研究在此基础上采用正反向遗传学相结合的手段,综合利用遗传学、生物化学、分子生物学和生物信息学等方法,解析组织特异性节律钟调控水稻代谢组的遗传和生化基础,阐明节律钟通过代谢物调控水稻重要性状的分子机理。首先以水稻为材料进行了不同组织材料转录组和代谢组的研究,获得了不同组织的节律转录组,解析并鉴定了节律代谢组;利用水稻自然群体研究了节律钟等组织特异性调控代谢组的遗传、生化基础,定位到大量的主效调控位点,并进一步通过分子和生化手段克隆并鉴定了一批关键结构及调控基因;以节律性积累的苯丙烷代谢途径的代表性代谢物(类黄酮、酚胺等)为研究对象,解析了其代谢途径及转录调控网络;利用代谢组学辅助解析水稻复杂性状分子机理的方法,成功鉴定了一批调控水稻重要农艺性状的节律性代谢物,初步解析了节律代谢物支链氨基酸、茉莉素、葫芦巴碱等分别调控水稻生长、抽穗及衰老、粒型等重要农艺性状的分子机理,为代谢组学辅助作物育种的提供了新手段。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Branched-chain amino acids regulate plant growth by affecting the homeostasis of mineral elements in rice
支链氨基酸通过影响水稻中矿质元素的稳态来调节植物生长
  • DOI:
    10.1007/s11427-019-9552-8
  • 发表时间:
    2019-08-01
  • 期刊:
    SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES
  • 影响因子:
    9.1
  • 作者:
    Jin, Cheng;Sun, Yangyang;Luo, Jie
  • 通讯作者:
    Luo, Jie
A UV-B-responsive glycosyltransferase, OsUGT706C2, modulates flavonoid metabolism in rice
UV-B 响应性糖基转移酶 OsUGT706C2 可调节水稻中的类黄酮代谢
  • DOI:
    10.1007/s11427-019-1604-3
  • 发表时间:
    2020-02
  • 期刊:
    Sci China Life Sci
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Feng Zhang;Hao Guo;Jiacheng Huang;Chenkun Yang;Yufei Li;Xuyang Wang;Lianghuan Qu;Xianqing Liu;Jie Luo
  • 通讯作者:
    Jie Luo
Control of leaf senescence by a MeOH-jasmonates cascade that is epigenetically regulated by OsSRT1 in rice
水稻中由 OsSRT1 表观遗传调控的 MeOH-茉莉酮酸酯级联控制叶片衰老
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Molecular Plant
  • 影响因子:
    27.5
  • 作者:
    Chuanying Fang;Hua Zhang;Jian Wan;YangYang Wu;Kang Li;Cheng Jin;Wei Chen;Shouchuang Wang;Wensheng Wang;Haiwei Zhang;Pan Zhang;Fei Zhang;Lianghuan Qu;Xianqing Liu;Daoxiu Zhou;Jie Luo
  • 通讯作者:
    Jie Luo
Metabolic GWAS-based dissection of genetic bases underlying the diversity of plant metabolism
基于代谢 GWAS 的植物代谢多样性遗传基础解析
  • DOI:
    10.1111/tpj.14097
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    PLANT JOURNAL
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    Fang, Chuanying;Luo, Jie
  • 通讯作者:
    Luo, Jie
Comparative analysis of metabolome of rice seeds at three developmental stages using a recombinant inbred line population
使用重组自交系群体对水稻种子在三个发育阶段的代谢组进行比较分析
  • DOI:
    10.1111/tpj.14482
  • 发表时间:
    2019-09-04
  • 期刊:
    PLANT JOURNAL
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    Li, Kang;Wang, Dehong;Luo, Jie
  • 通讯作者:
    Luo, Jie

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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