小单孢菌ATCC15835中庆大霉素与西索霉素耦合生物合成机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470186
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    85.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Elucidation of biosynthetic mechanism of important antibiotic is a key for its further research and application. Comprehensive characterisation of clinically and wildly used gentamicin and sisomicin is a necessary precondition for directed optimization and creation of aminoglycoside antibiotics through combinatorial biosynthesis and synthetic biology. The results of our/others preliminary studies indicated strongly that certain coupling pathway probably shared by gentamicin and sisomicin biosynthesis resulting in their co-biosynthesis. Thus, we propose here to undertake work on elucidation of the coupling biosynthetic mechanism of gentamicin and sisomicin in Micromonospora echinospora ATCC15835 by means of molecular biological, chemical biological and bioinformatic approachs to target renew the "old medicine" of aminoglycoside antibiotics by modification of natural product biosynthetic pathway, and aim for human health.
重要抗生素生物合成机制的解析是当今药物深度研发的核心环节,对已广泛应用于临床治疗的庆大霉素和西索霉素生物合成机制进行全面清晰的阐明是利用组合生物合成和合成生物学方法进行定向优化和创新氨基糖苷类抗生素的必要前提。基于前期实验中的研究发现,强烈地暗示着庆大霉素与西索霉素的生物合成途径可能存在着某种"耦合",从而引发庆大霉素与西索霉素的共合成。因此,本申请以庆大霉素野生型产生菌棘孢小单孢菌Micromonospora echinospora ATCC15835为研究材料,拟综合运用分子遗传学、化学生物学和生物信息学等方法,开展关于庆大霉素与西索霉素耦合生物合成机制的研究,为有的放矢地利用天然产物生物合成途径来改造氨基糖苷类抗生素从而实现老药新用,更好地为人类健康服务。

结项摘要

重要抗生素生物合成机制的解析是当今药物深度研发的核心环节,对广泛应用于临床的氨基糖苷类氨基糖苷类抗生素庆大霉素和西索霉素生物合成机制进行全面清晰的阐明,是利用组合生物合成和合成生物学方法进行定向优化和创新氨基糖苷类抗生素的必要前提。本研究以庆大霉素野生型产生菌Micromonospora echinospora ATCC15835为主要研究材料,并以西索霉素产生菌Micromonospora inyoensis DSM46123为参照,综合运用生物信息学、分子遗传学和化学生物学等技术手段对庆大霉素和西索米星生物合成共耦合机制进行了系统研究,成功阐释了庆大霉素和西索霉素生物途径发生耦合的关键基因,阐明两者生物转化和共合成机制。同时还解析了庆大霉素甲基化代谢网络机制,特别是定位了基因簇外决定庆大霉素多组分的关键甲基转移酶基因。这些发现为利用天然产物生物合成途径来主动创新氨基糖苷类抗生素提供理论和技术支撑。另外,本研究所构建的庆大霉素脱氢酶阻断突变株可大量积累分子遗传试验中最常用的抗性筛选试剂G418,为其工业化生产提供了理想的候选材料。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
氨基糖苷抗生素庆大霉素:基础研究的新进展及应用研究的新潜力
  • DOI:
    10.13345/j.cjb.140635
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    简心韵;邓子新;孙宇辉
  • 通讯作者:
    孙宇辉
Methyltransferases of gentamicin biosynthesis
庆大霉素生物合成的甲基转移酶
  • DOI:
    10.1073/pnas.1711603115
  • 发表时间:
    2018-02-06
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Li S;Guo J;Reva A;Huang F;Xiong B;Liu Y;Deng Z;Leadlay PF;Sun Y
  • 通讯作者:
    Sun Y
Delineating the biosynthesis of gentamicin X2, the common precursor of the gentamicin C antibiotic complex
描述庆大霉素 X2(庆大霉素 C 抗生素复合物的常见前体)的生物合成
  • DOI:
    10.1016/j.chembiol.2014.12.012
  • 发表时间:
    2015-02-19
  • 期刊:
    Chemistry & Biology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Huang C;Huang F;Moison E;Guo J;Jian X;Duan X;Deng Z;Leadlay PF;Sun Y
  • 通讯作者:
    Sun Y

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  • 通讯作者:
    Shang Qinglong1 Ma Yanxiu1 Guo Zhiwei1 Li Liqun1 H
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    孙宇辉

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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