基于双生子数据的动态遗传模型研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    11401600
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    22.0万
  • 负责人：
    郭小波
  • 依托单位：
    中山大学
  • 学科分类：
    A0403.贝叶斯统计与统计应用
  • 结题年份：
    2017
  • 批准年份：
    2014
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Human complex disease attracts people’s attention substantially in the world since its severe effects on human being. To investigate the complex disease, we first need to make clear its genetic effect, environmental effect and to calculate the heritability. Heritability is an important index to measure genetic effects as well as to provide guidelines for identifying the genetic susceptibilities for human complex disease. The existing genetic models for estimating the heritability simply assume that the genetic effect and the environmental effect would not vary with age, which might not reflect the dynamic chances of genetic and environmental effects as well as provide little information for how to design the gene mapping. In this project, we will study the dynamic genetic model for quantitative and categorical traits based on longitudinal twin data, and investigate how to incorporate the dynamitic genetic information into the genome-wide association studies (GWAS).
复杂疾病严重威胁着人类的健康，受到世界各国人民的普遍关注。研究复杂疾病首先要清楚复杂疾病的遗传因素、环境因素的影响，计算遗传率。遗传率是刻画复杂疾病遗传信息、指导寻找复杂疾病易感基因的重要指标。已有的计算遗传率的遗传模型均在假设遗传因素、环境因素的影响不会随着年龄的变化而改变。这种静态遗传模型不能反映遗传因素、环境因素的变化规律，同时也不利于指导下一步基因定位。本项目基于纵向双生子数据构建定量及定性性状的动态遗传模型，并研究如何利用动态遗传信息进行全基因组关联研究。

结项摘要

复杂疾病严重威胁着人类的健康，受到世界各国人民的普遍关注。研究复杂疾病首先要清楚复杂疾病的遗传因素、环境因素的影响，计算遗传率。遗传率是刻画复杂疾病遗传信息、指导寻找复杂疾病易感基因的重要指标。已有的计算遗传率的遗传模型均在假设遗传因素、环境因素的影响不会随着年龄的变化而改变。这种静态遗传模型不能反映遗传因素、环境因素的变化规律，同时也不利于指导下一步基因定位。本项目基于纵向双生子数据构建定量及定性性状的动态遗传模型，并研究如何利用动态遗传信息进行全基因组关联研究。

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Association Tests of Multiple Phenotypes: ATeMP
多种表型的关联测试：ATeMP
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0140348
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    PLOS ONE
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Guo X;Li Y;Ding X;He M;Wang X;Zhang H
  • 通讯作者：
    Zhang H
Childhood gene-environment interactions and age-dependent effects of genetic variants associated with refractive error and myopia: The CREAM Consortium
儿童基因-环境相互作用以及与屈光不正和近视相关的遗传变异的年龄依赖性影响：CREAM 联盟
  • DOI：
    10.1038/srep25853
  • 发表时间：
    2016-05-13
  • 期刊：
    Scientific Reports
  • 影响因子：
    4.6
  • 作者：
    Fan Q;Guo X;Tideman JW;Williams KM;Yazar S;Hosseini SM;Howe LD;Pourcain BS;Evans DM;Timpson NJ;McMahon G;Hysi PG;Krapohl E;Wang YX;Jonas JB;Baird PN;Wang JJ;Cheng CY;Teo YY;Wong TY;Ding X;Wojciechowski R;Young TL;Pärssinen O;Oexle K;Pfeiffer N;Bailey-Wilson JE;Paterson AD;Klaver CC;Plomin R;Hammond CJ;Mackey DA;He M;Saw SM;Williams C;Guggenheim JA;CREAM Consortium
  • 通讯作者：
    CREAM Consortium
A Practical Model Evaluating Antiviral Cytokines by Natural Killer Cells in Treatment Naive Patients with Chronic Hepatitis B Virus Infection
评估自然杀伤细胞在慢性乙型肝炎病毒感染初治患者中的抗病毒细胞因子的实用模型
  • DOI：
    10.1038/s41598-017-06192-1
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    SCIENTIFIC REPORTS
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Li Xiaoyan;Gu Yurong;Guo Xiaobo;Gu Lin;Zhou Liang;Wu Xiaojuan;Wang Xueqin;Stamataki Zania;Huang Yuehua
  • 通讯作者：
    Huang Yuehua
When do myopia genes have their effect? Comparison of genetic risks between children and adults
近视基因什么时候发挥作用？
  • DOI：
    10.1002/gepi.21999
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    Genetic Epidemiology
  • 影响因子：
    2.1
  • 作者：
    Tideman J. Willem L.;Fan Qiao;Polling Jan Roelof;Guo Xiaobo;Yazar Seyhan;Khawaja Anthony;Hoehn Rene;Lu Yi;Jaddoe Vincent W. V.;Yamashiro Kenji;Yoshikawa Munemitsu;Gerhold-Ay Aslihan;Nickels Stefan;Zeller Tanja;He Mingguang;Boutin Thibaud;Bencic Goran;Vita
  • 通讯作者：
    Vita

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其他文献

马朗凹陷芦草沟组泥页岩储层含油性特征与评价
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    沉积学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭小波; 黄志龙. 陈璇等
  • 通讯作者：
    黄志龙. 陈璇等
Possible Causes of Discordance in Refraction in Monozygotic Twins: Nearwork, Time Outdoors and Stochastic Variation
同卵双胞胎屈光不一致的可能原因：近距离、户外时间和随机变化
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  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    Invest Ophthalmol Vis Sci
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    丁小虎;胡音;郭歆星;郭小波
  • 通讯作者：
    郭小波
Discussion on prediction method for hydrocarbon resource potential of shale oil: Taking Lucaogou Formation shale oil of Malang sag as case
页岩油油气资源潜力预测方法探讨——以马朗凹陷芦草沟组页岩油为例
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  • 发表时间：
    2024-09-14
  • 期刊：
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  • 作者：
    涂小仙;郭小波;柳波;黄志龙;王瑞;申英
  • 通讯作者：
    申英
小干扰RNA沉默干扰素调节因子-8对缺氧复氧后肺泡上皮细胞凋亡的影响
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  • 发表时间：
    2020
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    --
  • 作者：
    郭小波;范涛;张霖;江文阳;汪巍;方一凡;李东航;耿庆
  • 通讯作者：
    耿庆
湖相纹层状细粒岩特征、成因模式及其页岩油意义——以三塘湖盆地马朗凹陷二叠系芦草沟组为例
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  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    石油勘探与开发
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李新宁;郭小波;马强;赵万春
  • 通讯作者：
    赵万春

其他文献

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郭小波的其他基金

基于全基因组概括关联统计量的统计建模与推断
  • 批准号：
    11771463
  • 批准年份：
    2017
  • 资助金额：
    48.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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