Swc5特异识别H2A并促进H2A.Z交换的结构和分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31801070
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    27.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The structure of chromatin was regulated by kinds of chromatin remodelers, which is very important for maintaining the genomic stability and integrity. SWR1 complex, one of the most important chromatin remodeler, promotes the replacement of H2A/H2B with H2A.Z/H2B in an ATP-consuming manner at specific gene sites where H2A.Z functions as a regulator. The previous researches showed that the ATPase activity of SWR1 complex was stimulated by its substrates, the nucleosomes containing H2A/H2B and free H2A.Z/H2B dimers. Besides the substrates, the latest research has shown that H2A/H2B, the production of the enzymatic reaction, also influences the efficiency of the exchange process. Importantly, Swc5, a subunit of SWR1 complex, plays a critical role in assisting H2A ejection during the exchange process. Applicant has focused on the mechanism of SWR1 complex in regulating the structure of chromatin, and elucidated the principle of recognition of H2A.Z/H2B by SWR1 complex subunit YL1 in the past years. Here, by applying a combination of structural, biochemical and genetic approaches, we would address the functional roles of Swc5 in regulating the efficiency of enzymatic reaction of SWR1 complex by specific recognition of H2A and Swr1. The knowledge we gain in this study is critical to fully understand not only the mechanism of H2A.Z positioned to genome by SWR1 complex, but also the intricate rules which govern epigenetic regulation.
染色质重塑复合物通过调节染色质结构进而影响生命活动的正常完成。染色质重塑复合物SWR1通过水解ATP促进组蛋白变体H2A.Z/H2B替换核小体中的H2A/H2B,从而使H2A.Z定位在特定位点发挥其生物学功能。早先的研究发现SWR1复合物的酶促活性受到底物核小体,游离的H2A.Z/H2B二聚体的调控。最新的研究证实除了底物之外,其酶促反应产物H2A/H2B二聚体同样影响反应效率,而这一过程很可能受到SWR1的亚基Swc5的调控。申请人的前期工作集中在SWR1复合物的工作原理方面,并部分阐释了SWR1复合物与底物H2A.Z/H2B相互作用的机制。在本项目中,申请人拟采用结构生物学、生物化学、酵母遗传学等多种方法揭示Swc5亚基特异性识别H2A以及Swr1进而调控SWR1复合物酶促反应的作用机制。本项目对于阐明SWR1复合物调控H2A.Z在基因组的定位机制具有重要意义。

结项摘要

染色质重塑复合物通过调节染色质结构进而影响生命活动的正常完成。染色质重塑复合物SWR1通过水解ATP促进组蛋白变体H2A.Z/H2B替换核小体中的H2A/H2B,从而使H2A.Z定位在特定位点发挥其生物学功能。研究发现SWR1复合物的酶促活性受到底物核小体,游离的H2A.Z/H2B二聚体的调控。最新的研究证实除了底物之外,其酶促反应产物H2A/H2B二聚体同样影响反应效率,而这一过程很可能受到SWR1的亚基Swc5的调控。因此研究swc5与H2A的相互关系对理解swr1复合物的作用机制具有重要意义。本课题拟采用结构生物学、生物化学、酵母遗传学等多种方法揭示Swc5亚基特异性识别H2A以及Swr1进而调控SWR1复合物酶促反应的作用机制。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Role of a DEF/Y motif in histone H2A-H2B recognition and nucleosome editing
DEF/Y 基序在组蛋白 H2A-H2B 识别和核小体编辑中的作用
  • DOI:
    10.1073/pnas.1914313117
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yan Huang;Lu Sun;Leonidas Pierrakeas;Linchang Dai;Lu Pan;Ed Luk;Zheng Zhou
  • 通讯作者:
    Zheng Zhou
Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin
BRCA1-BARD1 复合物招募至受损染色质的结构洞察
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Molecular Cell
  • 影响因子:
    16
  • 作者:
    Linchang Dai;Yaxin Dai;Jinhua Han;Yan Huang;Longge Ge;Jun Huang;Zheng Zhou
  • 通讯作者:
    Zheng Zhou

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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