肾透明细胞癌BAP1突变/缺失下调SETD7导致CpG岛高甲基化表型的分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81902568
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Clear cell renal cell carcinoma is the most common histology with poor prognosis in renal cancers. Clear cell renal cell carcinoma with BRCA1 associated protein 1 (BAP1, a deubiquitinating enzyme) gene mutation/deletion has the most aggressive feature. Moreover, current therapeutic strategies are not good enough in treating advanced BAP1 mutant/deleterious patients. Hence, identifying biological characteristics and discovering new therapeutic targets of BAP1 mutant/deleterious renal carcinoma patients are in urgent need..In our previous studies, we found that the proportion of BAP1 germline/somatic mutation/deletion was higher in Chinese kidney cancer patients, and more than 60% BAP1 mutant/deleterious patients had CpG island methylator phenotype (CIMP). Our previous experiments showed that silencing BAP1 could up-regulate the DNA methylation level and DNMT1 protein level, and down-regulate SETD7 (a negative regulator of DNMT1 protein) protein level, in renal carcinoma cells. However, silencing BAP1 could not alter transcription level of DNMT1 and SETD7. In addition, we found that BAP1 could interact with SETD7. Therefore, we hypothesized that “BAP1mutation/deletion→deubiquitination inactivation→SETD7 degradation→stabilizing DNMT1→CIMP” could be the mechanism of BAP1 mutation/deletion leading to CIMP. .In the future, this project will focus on confirming the hypothesis above, elucidating the specific mechanism of BAP1 mutation/deletion leading to CIMP and exploring the therapeutic value of methylation inhibitors in BAP1 mutant clear cell renal cell carcinoma. This study will help explain the new mechanism of BAP1 mutation in renal cell carcinoma and will propose new therapeutic modalities.
肾透明细胞癌是最常见且预后最差的肾癌亚型。BAP1基因(编码一种去泛素化酶)突变的透明细胞癌恶性程度最高,且现行治疗方案效果不佳。.申请人在前期研究中发现:中国肾癌患者中BAP1基因胚系/体系突变/缺失的比例较高,60%的BAP1突变患者具有CpG岛高甲基化表型(CIMP)。前期实验显示沉默BAP1可上调肾癌细胞DNA甲基化水平和DNMT1蛋白水平、下调DNMT1负性调节因子SETD7的蛋白水平(均不影响转录)。另外,我们发现BAP1可与SETD7相互作用。因此,我们提出“BAP1突变/缺失→去泛素化受损→SETD7降解→稳定DNMT1→CIMP”可能是BAP1突变/缺失致CIMP的机制。.本项目后续聚焦于验证上述假说,阐明BAP1突变/缺失致CIMP的具体机制,探索甲基化抑制剂对BAP1突变型肾癌的治疗价值。本研究有助于明确BAP1突变肾癌进展的新机制并提出新的治疗模式。

结项摘要

肾透明细胞癌是最常见且预后最差的肾癌亚型。BAP1基因(编码一种去泛素化酶)突变的透明细胞癌恶性程度最高,且现行治疗方案效果不佳。前期研究结果提示:BAP1突变/缺失的肾透明细胞癌往往呈现CpG岛高甲基化表型(CIMP)。..项目负责人依托此研究项目围绕BAP1突变/缺失驱动CIMP表型的具体机制进行了一系列研究。我们在临床样本和体内外实验中证实BAP1突变/缺失可驱动肾透明细胞癌产生CIMP表型,且促进DNMT1甲基转移酶的关键负性调节分子SETD7的降解。我们的研究结果提示SETD7可能是BAP突变型肾癌产生CIMP表型的关键中间分子,而DNA甲基化抑制剂可能在治疗BAP1突变/缺失型肾癌中存在潜在优势。在此项目中,我们也在体外试验明确长效甲基化抑制剂SGI-110联合靶向药舒尼替尼对比舒尼替尼单药,能更好地杀伤BAP1突变/缺失型肾癌细胞。该项目明确了BAP1突变/缺失致CIMP的具体机制,探索甲基化抑制剂对BAP1突变型肾癌的治疗价值,有助于明确BAP1突变肾癌进展的新机制并提出新的治疗模式。..此外,在完成既定研究计划的基础上,负责人在多种泌尿系统肿瘤中围绕与本项目相关的“肿瘤易感基因突变”(包括BAP1)和“表观遗传修饰”(包括甲基化、泛素化)这两个关键领域进行研究,也有重要成果发表,具有良好的转化应用价值。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Prevalence of comprehensive DNA damage repair gene germline mutations in Chinese prostate cancer patients
中国前列腺癌​​患者综合DNA损伤修复基因种系突变的患病率
  • DOI:
    10.1002/ijc.33324
  • 发表时间:
    2020-10
  • 期刊:
    International Journal of Cancer
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Wu Junlong;Wei Yu;Pan Jian;Jin Shengming;Gu Weijie;Gan Hualei;Zhu Yao;Ye Ding-Wei
  • 通讯作者:
    Ye Ding-Wei
The Rare Variant rs35356162 in UHRF1BP1 Increases Bladder Cancer Risk in Han Chinese Population
UHRF1BP1 中的罕见变异 rs35356162 会增加中国汉族人群患膀胱癌的风险
  • DOI:
    10.3389/fonc.2020.00134
  • 发表时间:
    2020-02
  • 期刊:
    Frontiers in Oncology
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Wu Junlong;Wang Meilin;Chen Haitao;Xu Jianfeng;Zhang Guiming;Gu Chengyuan;Ding Qiang;Wei Qingyi;Zhu Yao;Ye Dingwei
  • 通讯作者:
    Ye Dingwei
Clear Cell Papillary Renal Cell Carcinoma Shares Distinct Molecular Characteristics and may be Significantly Associated With Higher Risk of Developing Second Primary Malignancy.
透明细胞乳头状肾细胞癌具有独特的分子特征,可能与发生第二原发恶性肿瘤的较高风险显着相关
  • DOI:
    10.3389/pore.2021.1609809
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Pathology oncology research : POR
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tian X;Xu WH;Wu JL;Gan HL;Wang HK;Gu WJ;Qu YY;Zhang HL;Ye DW
  • 通讯作者:
    Ye DW
Inherited mutations in Chinese patients with upper tract urothelial carcinoma.
中国上尿路尿路上皮癌患者的遗传突变
  • DOI:
    10.1016/j.xcrm.2022.100883
  • 发表时间:
    2023-01-17
  • 期刊:
    CELL REPORTS MEDICINE
  • 影响因子:
    14.3
  • 作者:
    Wu, Junlong;Jin, Shengming;Gu, Chengyuan;Wei, Yu;Zhu, Yao;Necchi, Andrea;Shariat, Shahrokh F.;Pan, Jian;Gan, Hualei;Dai, Bo;Zhang, Hailiang;Shi, Guohai;Zhu, Yu;Shen, Yijun;Zhu, Yiping;Ye, Dingwei
  • 通讯作者:
    Ye, Dingwei
Clinicopathological characteristics and loss of mismatch repair protein expression in Chinese upper tract urothelial carcinomas.
中国上尿路尿路上皮癌的临床病理特征及错配修复蛋白表达缺失
  • DOI:
    10.3389/fonc.2022.1012168
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    FRONTIERS IN ONCOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Shang, Zhi;Jin, Shengming;Wang, Wenwen;Wei, Yu;Gu, Chengyuan;Yang, Chen;Zhu, Yu;Zhu, Yao;Shen, Yijun;Wu, Junlong;Ye, Dingwei
  • 通讯作者:
    Ye, Dingwei

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其他文献

ADIPOQ基因多态性与前列腺癌易感性的相关性研究
  • DOI:
    10.19401/j.cnki.1007-3639.2018.09.004
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国癌症杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    顾成元;吴俊龙;朱煜;许华;秦晓健;朱耀;戴波;叶定伟
  • 通讯作者:
    叶定伟

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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