高效、精准的糖蛋白化学标记、质谱鉴定及成像技术开发用于蛋白质糖基化时空动态检测

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91853102
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The complex and labile protein glycosylation plays an important role in physiological and pathological processes. It is of great significance to characterize the glycosylation and explore its biological effect and regulation mechanism. Currently, it is a lack of effective methods to detect the dynamic changes of highly complex and heterogeneous protein glycosylation, which greatly hinder the glycoprotein characterizing and functional study. This project is aim to develop the mass spectrometry and imaging methods for the glycoprotein identifying and characterizing based on the chemical labeling, mainly including glycoprotein in vivo and in vitro chemical labeling methods, glycoprotein enrichment methods, mass spectrometry identification and precision analysis strategies, and imaging technologies. Through the project implementation, we can detect the protein glycosylation in spatiotemporal dynamics with high efficiency and specificity. It lays a technical foundation for the characterization of dynamic protein glycosylation and the study of regulation mechanism from multiple level, such as molecular, cell and individual.
复杂多变的蛋白质糖基化在生理和病理过程中起着重要的作用。发现和阐明蛋白质糖基化修饰的特性,揭示其生物学效应和调控机制具有重要的研究意义。然而,目前缺乏对高度复杂和不均一的蛋白质糖基化动态变化及时空差异进行有效检测的技术手段,从而给揭示蛋白质糖基化在生物体内的动态修饰特征和功能研究带来了阻碍。本项目旨在发展基于化学标记的糖蛋白质谱检测及成像技术,包括蛋白质糖基化修饰体内/外化学标记与富集技术,串级质谱鉴定与精准解析技术以及成像技术;实现对蛋白质糖基化修饰的高效、特异和时空动态监测,为从分子、细胞和个体等多个层次揭示蛋白质糖基化动态修饰的特征和调控机制奠定技术基础。

结项摘要

复杂多变的蛋白质糖基化在生命体中扮演着重要角色,发现和阐明蛋白质糖基化修饰的特征对于解释其生物学效应和调控机制具有重要的研究意义。立项初期,缺乏有效的技术方法对高度复杂和不均一的蛋白质糖基化动态变化及差异进行分析。通过本项目的实施,我们建立了系列分析技术和工具,主要包括完整糖肽富集技术、基于质谱的位点特异性糖基化鉴定技术和解析软件,位点特异性糖基化蛋白质组定量技术等,为动态可变的蛋白质糖基化解析提供了技术方法。N-糖肽富集特异性达到98%;突破了位点特异性糖基化解析中含有修饰糖单元及多位点定位的技术难题;同时发展了可用于蛋白质糖基化动态变化定量的分析方法。项目按照计划进行,基本达到了预期目标,超额完成了项目成果。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Novel methods in glycomics: a 2019 update
糖组学新方法:2019 年更新
  • DOI:
    10.1080/14789450.2020.1708199
  • 发表时间:
    2020-01-02
  • 期刊:
    EXPERT REVIEW OF PROTEOMICS
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Cao, Wei-Qian;Liu, Ming-Qi;Yang, Peng-Yuan
  • 通讯作者:
    Yang, Peng-Yuan
Effective Enrichment Strategy Using Boronic Acid-Functionalized Mesoporous Graphene-Silica Composites for Intact N- and O-Linked Glycopeptide Analysis in Human Serum
使用硼酸功能化介孔石墨烯-二氧化硅复合材料进行有效富集策略,用于人血清中完整的 N- 和 O- 连接糖肽分析
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.0c05482
  • 发表时间:
    2021-04-20
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Kong, Siyuan;Zhang, Quanqing;Cao, Weiqian
  • 通讯作者:
    Cao, Weiqian
An ultrafast and highly efficient enrichment method for both N-Glycopeptides and N-Glycans by bacterial cellulose
一种利用细菌纤维素超快速高效富集 N-糖肽和 N-聚糖的方法
  • DOI:
    10.1016/j.aca.2020.10.006
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Analytica Chimica Acta
  • 影响因子:
    6.2
  • 作者:
    Wu Mengxi;Zhang Quanqing;Zhou Xinwen;Kong Siyuan;Zhao Huanhuan;Liu Mingqi;Yang Pengyuan;Cao Weiqian
  • 通讯作者:
    Cao Weiqian
Recent Advances in Software Tools for More Generic and Precise Intact Glycopeptide Analysis.
用于更通用和更精确的完整糖肽分析的软件工具的最新进展
  • DOI:
    10.1074/mcp.r120.002090
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Molecular & cellular proteomics : MCP
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cao W;Liu M;Kong S;Wu M;Zhang Y;Yang P
  • 通讯作者:
    Yang P
Development of a Computational Tool for Automated Interpretation of Intact O-Glycopeptide Tandem Mass Spectra from Single Proteins
开发用于自动解释单一蛋白质的完整 O-糖肽串联质谱的计算工具
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.0c01091
  • 发表时间:
    2020-05-05
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Huang, Jiangming;Jiang, Biyun;Cao, Weiqian
  • 通讯作者:
    Cao, Weiqian

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其他文献

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曹纬倩的其他基金

糖链数据库非依赖的位点特异性糖基化蛋白质组鉴定技术开发
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
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    54 万元
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    面上项目
基于生物质谱的黏多糖(mucin)类O-糖基化蛋白质分析新方法研究
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  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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