P-TEFb识别并调控特异基因转录延伸重启机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31570751
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0502.分子生物物理
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The transcription elongation stage has been regarded as a noval platform for the regulation of gene expression. As a positive transcription elongation factor, P-TEFb plays a dispensable role in regulating the transition of paused transcription elongation. However, how P-TEFb recognizes and is recruited to those stimulation-specific genes is still unclear. Our previous data suggest that the dynamic acetylated subunits of Mediator might be the fundation for P-TEFb to recognize those specific genes and the transition of paused elongation might be regulated by the cooperation of two P-TEFb molecules. Therefore, we will study the acetylation mechanism of Mediator subunits and their roles in P-TEFb recruitment, and identify the recruitment pathways of P-TEFbs and their targetings. We expect to reveal how P-TEFb recognizes specific genes and regulates their transcription elongation resuming, thereby providing deep insight into the mechanism of P-TEFb in regulating specific gene expression.
转录延伸重启已被认为是调控应激性基因转录表达的新模式,正性转录延伸因子P-TEFb在调控基因转录延伸重启中扮演关键角色,但目前对P-TEFb识别、募集和调控特异基因转录延伸重启的机制还一无所知。我们的前期结果提示:中介体亚基动态乙酰化修饰可能与P-TEFb识别特异基因有关,且可能以双P-TEFb分子协同作用的模式来调控延伸重启。本项目拟通过探讨中介体亚基的动态乙酰化修饰机制及其对P-TEFb募集的调控作用,来了解P-TEFb识别特异基因的机制,并通过鉴定P-TEFb的两条募集通道及其各自的作用靶点,以揭示P-TEFb调控转录延伸重启的模式。期望能阐明P-TEFb识别并调控特异基因转录延伸重启的机制,为基因转录调控新模式的确立提供理论依据。

结项摘要

近年来随着全基因组高通量检测技术的高速发展,研究人员发现真核细胞中存在两大限速调控平台:转录起始和转录延伸。约有30%的基因转录已经完全启动,但是 RNA聚合酶II却暂停在基因启动子区下游的近端20到60核苷酸的区域。当遇到外界刺激时,暂停的RNA聚合酶II迅速重新启动以合成全长mRNA。这类转录延伸暂停的基因表达产物大多与胚胎发育调节和细胞应激反应等事件相关。这些新发现更新了基因表达调控的观念,使得基因转录起始和转录延伸暂停重启成为基因转录调控的两大核心平台。由于P-TEFb是调控延伸重启的核心因子,P-TEFb及其通用募集因子Brd4和SEC(超级延伸复合物)在调控基因转录延伸重启过程中可能扮演核心的角色。在本项目中,我们已完成项目申请所计划的研究的内容。我们首先揭示了多个P-TEFb分子协同调控转录延伸重启的分子机制,并阐明信号刺激活化Brd4/P-TEFb和SEC/P-TEFb双募集通道调控RNA Pol II转录延伸重启的详尽机理,从而将Brd4和SEC两个研究领域整合统一在一个分子模型中。在此基础上,我们进一步通过两种进入临床实验的抗艾滋病药物HMBA和prostratin刺激Brd4/P-TEFb募集通道活化潜伏艾滋病毒的基因转录。刺激潜伏的艾滋病毒转录活化是目前预期的能彻底清除艾滋病毒的治疗策略。我们发现这两种药物不仅协同激活艾滋病毒基因的转录,而且能刺激NF-kB炎症信号通路进一步提升转录活性,为抗艾滋病毒药物的研发提供了新的理论依据。由于Brd4会结合乙酰化修饰蛋白如中介体和组蛋白调控基因转录,我们与结构生物学课题组合作进一步研究了腺病毒蛋白影响宿主乙酰化修饰干扰宿主基因转录的分子机制,阐释了腺病毒原癌基因E1A抑制乙酰转移酶KAT2B酶活中心的结构基础。最后我们围绕SEC/P-TEFb募集通道调控的靶基因Cbfa2t2的转录活化展开研究,发现该基因的异常表达与肾腺癌细胞的干性维持密切相关,提示Cbfa2t2是潜在的胃腺癌治疗靶点。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
CBFA2T2 is associated with a cancer stem cell state in renal cell carcinoma.
CBFA2T2 与肾细胞癌中的癌症干细胞状态相关
  • DOI:
    10.1186/s12935-017-0473-z
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Cancer cell international
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Chen DC;Liang YD;Peng L;Wang YZ;Ai CZ;Zhu XX;Yan YW;Saeed Y;Yu B;Huang J;Gao Y;Liu J;Jiang YZ;Liu M;Chen D
  • 通讯作者:
    Chen D
Competitive inhibition of lysine acetyltransferase 2B by a small motif of the adenoviral oncoprotein E1A.
腺病毒癌蛋白 E1A 的小基序对赖氨酸乙酰转移酶 2B 的竞争性抑制
  • DOI:
    10.1074/jbc.m115.697300
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    J Biol Chem.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Shi Shasha;Liu Ke;Chen Yanheng;Zhang Shijun;Gong Chenfang;Jin Quanwen;Yang Xiang-Jiao;Chen Ruichuan;Ji Zhiliang;Han Aidong
  • 通讯作者:
    Han Aidong
HMBA Enhances Prostratin-Induced Activation of Latent HIV-1 via Suppressing the Expression of Negative Feedback Regulator A20/TNFAIP3 in NF-κB Signaling.
HMBA 通过抑制 NF-κB 信号传导中负反馈调节器 A20/TNFAIP3 的表达来增强前列腺素诱导的潜在 HIV-1 激活
  • DOI:
    10.1155/2016/5173205
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    BioMed research international
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Chen D;Wang H;Aweya JJ;Chen Y;Chen M;Wu X;Chen X;Lu J;Chen R;Liu M
  • 通讯作者:
    Liu M
P-TEFb: Finding its ways to release promoter-proximally paused RNA polymerase II
P-TEFb:寻找释放启动子近端暂停的 RNA 聚合酶 II 的方法。
  • DOI:
    10.1080/21541264.2017.1281864
  • 发表时间:
    2018-01-01
  • 期刊:
    TRANSCRIPTION-AUSTIN
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Li, You;Liu, Min;Chen, Ruichuan
  • 通讯作者:
    Chen, Ruichuan

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    厦门大学学报(自然科学版)
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    陈瑞川

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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