基于核糖体晶体学的抗生素机理和耐药性的分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31770784
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Protein synthesis occurs on the ribosome, a gigantic cellular complex comprised of RNA and proteins. Bacterial ribosomes and the process of protein synthesis are the major targets of antibiotics. Therefore, structural and biochemical studies of ribosome-targeting antibiotics can provide valuable mechanistic insights into the modes of action of antibiotics and their associated drug resistance. This project focuses on the investigations of the antibiotic Tetracycline and Dityromycin. Using high-resolution ribosome crystallography in combination with cell-free in vitro translation system, we shall study the molecular mechanism of tetracycline resistance provided by protein projection proteins and the working mechanism of the newly characterized Dityromycin.
核糖体是由RNA和蛋白质组成的一个超大型复合物,负责细胞内所有蛋白质的合成。细菌的核糖体和蛋白质合成一直是抗生素的最主要靶点,因此对核糖体靶向抗生素的结构和生化研究对理解抗生素的工作机理和耐药性机制至关重要。本项目中我们将以Tetracycline(四环素)和Dityromycin两种抗生素为研究对象,利用核糖体高分辨率晶体学结合体外翻译系统,对四环素的耐药性机制之一和Dityromycin的抑制核糖体活性机制展开深入的研究,为Tetracycline的改进和Dityromycin的临床转化做出必要铺垫。

结项摘要

体是由RNA和蛋白质组成的一个超大型复合物,负责细胞内所有蛋白质的合成,是抗生素作用的主要靶标,因此对核糖体机理的研究可以增加对翻译机制的理解,助力设计新型核糖体。本项目以Tetracycline和Dityromycin两种抗生素为切入点,构建了核糖体晶体学平台与体外翻译系统,对抗生素开展了系列研究;与此同时,本项目通过解析核糖体与再循环因子(RRF)的复合物晶体结构,阐明mRNA翻译过程中RRF参与核糖体再循环的分子机制。通过解析水稻线叶绿体甘氨酰tRNA合成酶与底物tRNA的复合物结构,阐明该酶分子识别底物的分子机制。构建了一种新型多顺反子载体用于表达多组份复合物。相关研究不仅加深了我们对核糖体翻译分子机制理解,同时为翻译领域研究提供了新的思路与方案。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Structural basis for ribosome recycling by RRF and tRNA.
RRF 和 tRNA 回收核糖体的结构基础
  • DOI:
    10.1038/s41594-019-0350-7
  • 发表时间:
    2020-01
  • 期刊:
    NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
  • 影响因子:
    16.8
  • 作者:
    Zhou, Dejian;Tanzawa, Takehito;Lin, Jinzhong;Gagnon, Matthieu G.
  • 通讯作者:
    Gagnon, Matthieu G.
Ribosome-Targeting Antibiotics: Modes of Action, Mechanisms of Resistance, and Implications for Drug Design.
核糖体靶向抗生素:作用方式、耐药机制以及对药物设计的影响
  • DOI:
    10.1146/annurev-biochem-062917-011942
  • 发表时间:
    2018-06-20
  • 期刊:
    Annual review of biochemistry
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
  • 通讯作者:

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其他文献

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工程化T7 RNA聚合酶以实现高效Cap-2帽子mRNA的合成
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    32371352
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  • 项目类别:
    面上项目
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  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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