海洋放线菌来源thiostrepamide的生物合成机制研究及结构优化

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41876184
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Thiostrepamide 1078-H6D is a new peptide natural product derived from marine Actinomyces and has significant antitumor activities. There are several thioamide functional groups in the structure of thiostrepamide 1078-H6D, which is very rare in nature. To date, it remains unknown how thioamide bond is formed in microorganism (biosynthesis mechanism) and how thioamide affects the biological activities (pharmacological effects). This project is intended to carry out the research focusing on firstly the biosynthesis of thiostrepamide 1078-H6D, to find the key enzymes and to clarify the catalytic mechanism in forming thioamide bond. On the base of biosynthetic results, a combinatorial biosynthesis will be utilized to produce structural analogues. By amino acid mutations in the precursor peptide structural analogues will be prepared in an efficient and rapid way and in a large amount. The production potential of microbial system will meet the requirements in the creation of structural diversity, structure-activity relationship and pharmacological mechanism and other aspects of the analogues. The research will reveal the role of thioamide in pharmacological activities. We will also screen out the lead compounds with enhanced activity and weakened toxicity by in vitro and in vivo pharmacological evaluation. The research will provide scientific basis and lead compounds for developing new marine drugs with independent intellectual property rights in China.
硫链丝酰胺(thiostrepamide)1078-H6D是一种来源于海洋放线菌的新型核糖体肽,具有显著的抗肿瘤活性。其结构中含有多个硫代酰胺(thioamide)官能团,在天然产物中极为罕见,这一特异官能团的“来龙”(微生物体内如何产生)和“去脉”(在生物活性中的贡献)目前均不清楚。围绕着解答上述两个科学问题,本项目拟首先开展生物合成研究,重点阐明硫代酰胺键形成的新颖酶学基础和催化机制。在此基础上,发展前体肽氨基酸突变的组合生物合成方法,利用微生物体系的制造潜力实现结构类似物的高效、快速合成和大量制备,满足该类化合物在结构多样性创造、构效关系研究和作用机制研究等方面的共同需求,揭示硫代酰胺在药理活性中的作用;并从中筛选出活性增强、毒性减弱的先导化合物,进行体内药效学评价,为开发出具有我国自主知识产权的海洋新药提供科学依据和物质基础。

结项摘要

硫代酰胺类天然产物(thiostrepamide)是含有特殊硫代酰胺键的核糖体肽(RiPPs),围绕该类天然产物的生物合成和化学多样化拓展,我们开展了系列工作:1)采用异源表达的方式进行thioviridamide类似物的发酵制备,对核心肽的关键氨基酸进行饱和突变,成功获得了4个突变体;2)对结构中特殊氨基酸(β-羟基-N,N-二甲基组氨酸,hdmHis)的生物合成进行研究,利用基因敲除和突变产物鉴定的方法,确定2个酶tvaG和tvaJ参与了hdmHis的生物合成,在E. Coli体系进行TvaG和TvaJ的体外测活反应,证明其分别负责催化咪唑上的N,N-二甲基化和His上的β-羟化,研究结果加深了RiPPs天然产物翻译后修饰机制及多样化拓展方面的认识。3)利用全基因测序和基因挖掘的策略,从野生菌株中发现了I型PKS类化合物venturicidins的生物合成基因簇(BGC),并获得3个新结构类似物,活性研究表明其对人白血病细胞MV-4-11具有选择性抑制活性。还发现了pentalenolactone型倍半萜BGC及其2个新衍生物。4)从链霉菌S. flaveolus中发现了9个新颖的具有5/6/8二氢呋喃并benzo[b]azocin结构的安莎菌素类似物ansafurantrienins A−H,确定了这些化合物的结构和绝对构型,并验证了其在365nm波长UV光和氧气条件下发生分子内[3+2]环合的过程。5)此外,从海洋链霉菌AH25中发现了2种caryolane型倍半萜新成分;从稀有海洋放线菌MYH522中发现了4种大环内酰胺新结构Fluvirucins B7–B10。6)对微生物来源的安莎三烯类天然产物、海洋小单孢菌来源的天然产物以及茚满霉素类天然产物进行了详细综述。.上述研究结果在J. Am. Chem. Soc.,Org. Lett.,Eur. J. Med. Chem.,J. Nat. Prod.,RSC Adv.,Molecules, Chem. Biodivers.等SCI期刊上发表论文10篇,核心期刊论文2篇,申请国家发明专利2项。研究过程中联合培养硕士研究生7名,与中科院上海有机所刘文研究员、上海海洋大学吴文惠教授和浙江工业大学吴杰群研究员形成良好的合作关系。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Characterization of Histidine Functionalization and Its Timing in the Biosynthesis of Ribosomally Synthesized and Posttranslationally Modified Thioamitides
核糖体合成和翻译后修饰的硫代酰胺生物合成中组氨酸功能化的表征及其时机
  • DOI:
    10.1021/jacs.1c11669
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    J. Am. Chem. Soc.
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    Hu L.;Qiao Y.;Liu J.;Zheng C.;Wang X.;Sun P.(孙鹏);Gu Y.;Liu W.
  • 通讯作者:
    Liu W.
海绵共附生放线菌Streptomyces parvulus MA1076的次级代谢产物研究
  • DOI:
    10.13233/j.cnki.mar.fish.2021.04.007
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    海洋渔业
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张梦雪;李欢欢;邵峰;李宏基;吴文惠;孙鹏
  • 通讯作者:
    孙鹏
Micaryolanes A and B, Two New Caryolane-Type Sesquiterpenoids from Marine Streptomyces sp. AH25
Micaryolanes A 和 B,来自海洋链霉菌属的两种新的石蒜烷型倍半萜类化合物。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chem. Biodivers.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jiequn Wu;Yuqin Zhu;Mengxue Zhang;Hongji Li;Peng Sun (孙鹏)
  • 通讯作者:
    Peng Sun (孙鹏)
Natural Occurrence, Bioactivity and Biosynthesis of Elaiophylin Analogues
Elaiophylin 类似物的天然存在、生物活性和生物合成
  • DOI:
    10.3390/molecules24213840
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Molecules
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Gui Min;Zhang Meng-xue;Wu Wen-hui;Sun Peng(孙鹏)
  • 通讯作者:
    Sun Peng(孙鹏)
Ansafurantrienins, Unprecedented Ansatrienin Derivatives Formed via Photocatalytic Intramolecular [3 + 2] Oxidative Cycloaddition
Ansafurantrienins,通过光催化分子内 [3 2] 氧化环加成形成的前所未有的 Ansatrienin 衍生物
  • DOI:
    10.1021/acs.orglett.1c04032
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Org. Lett.
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Li Hongji;Chen Shuo;Wang Jinxin;Zhang Mengxue;Wu Wenhui;Liu Wen;Sun Peng(孙鹏)
  • 通讯作者:
    Sun Peng(孙鹏)

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其他文献

证候动物模型质量考核的思路与方法
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    --
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    --
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一种信息呈现方式及其搜索效率的眼动研究
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  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    盛金根;孙鹏;李永建
  • 通讯作者:
    李永建

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孙鹏的其他基金

Cyclooctatin型抗肿瘤二萜生物合成途径阐明及化学多样性拓展
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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