β-半乳糖苷酶转糖苷活性的功能进化与调控机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31301523
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2002.食品生物化学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Galactooligosaccharide as the new food additive, owns unique functionality. However, the yield in galactooligosaccharide is limited by the synthetic capability of biocatalyst β-galactosdase. The low transgalactosylation activity and the reverse-hydrolysis reaction associated with transgalactosylation are the common disadvantage for production galactooligosaccharide,which limited by the synthesis efficiency. The objects of this study are the function optimization of transgalactosylation activity, based on the evolution divergences modification and the research on the regulation mechanism of bidirectional catalytic reaction. According to the differences of the capability on galactooligosaccharide production, the glycosidase will be classified in this study. The amino acid sites, where the evolution divergences occur, will be research using the family as the unit for evolution analysis. The amino acids in the TIM domain are the targets for molecular evolution. The optimization mutants could gain through bidirectional screening. The regulation mechanism of bidirectional catalytic reaction could be studied based on the result of molecular modification and transient analysis. The research result of this study could direct the development of new biocatalyst using for galactooligosaccharide production.
低聚半乳糖以其特有的功能性,成为新型食品添加剂。但其生产量却一直受到生物催化剂β-半乳糖苷酶合成能力的制约。本项研究针对β-半乳糖苷酶转糖苷活性低、存在逆向水解催化,导致低聚半乳糖合效率受限这一共性瓶颈问题,拟通过针对功能差异位点的分子改造优化催化剂性能,并对其双向反应的分子调控机制进行探讨。研究拟依据低聚半乳糖合成能力差异,对现有糖苷酶数据资源进行分类汇总。以具有共性催化特性的家族为单位,通过进化历程分析探索其功能分歧产生的氨基酸位点。针对糖苷酶TIM保守催化结构域内的功能分歧位点进行体外体外改造,结合"转糖苷-水解"双向催化活性筛选,以期达到优化低聚糖合成能力的目标。在功能分歧位点改造与双向筛选结果基础上,对反应过渡态进行分析,探索β-半乳糖苷酶低聚半乳糖合成与水解反应的分子调控机制,为开发新型低聚半乳糖生物催化剂提供理论指导。

结项摘要

低聚半乳糖是一种重要的功能性低聚糖,其产量一直受限于生物催化剂β-半乳糖苷酶的合成能力。本项目针对β-半乳糖苷酶转糖苷活性低、存在逆向水解这一限制低聚半乳糖合成效率的共性瓶颈问题,以GH42家族嗜热脂肪芽胞杆菌来源耐热β-半乳糖苷酶BgaB为模式酶,采用分子动力学模拟与酶家族功能进化相结合的研究策略,对β-半乳糖苷酶TIM保守结构域内的功能氨基酸位点进行定位。通过位点突变体构建及催化特性分析,分别确认了具有亲核催化氨基酸作用、底物结合作用及与环境适应性进化相关的功能位点。并分别阐述了主要功能位点对β-半乳糖苷酶催化活性的分子调控机制;获得了转糖苷活性提高的单点突变体,及兼具抑制水解活性与转糖活性提高的双点突变体。在完成预定研究目标基础上,本项目还针对试验过程中遇到的两个应用性问题,进行了研究拓展。项目主要研究内容与重要结果概括如下:.1) 结合分子动力学模拟与酶家族功能进化,建立了高效定位功能氨基酸位点的研究策略,为现有基于理性与半理性设计的分子改造方法提供了参考与补充;.2) 研究了家族内高度保守位点(Glu303)突变对酶活性的影响,揭示了其亲核催化氨基酸作用,及对转糖苷活性的调控功能规律;.3)系统分析了GH42家族保守氨基酸位点的分化与变异规律,发现了与环境适应性有关的进化分歧位点(Ile42),并阐述了其对酶热稳定性与催化活性的分子调控机制。.4)通过对功能氨基酸位点间累积突变体性质的研究发现,保守位点的协同突变以导致催化效率降低的负向进化为主;通过缩短结合位点氨基酸侧链长度,扩大活性口袋空间,能够获得具有双重功能优化的突变体酶。.本项目从微观分子作用与宏观进化相结合的角度,深入揭示了β-半乳糖苷酶催化活性的分子调控机制及功能氨基酸位点的进化规律。不仅为酶的功能研究提供了方法参考,更为β-半乳糖苷酶的功能改造及对低聚半乳糖的合成调控提供了科学依据。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A differentially conserved residue (Ile42) of GH42 β-galactosidase from Geobacillus stearothermophilus BgaB is involved in both catalysis and thermostability
来自嗜热脂肪芽孢杆菌 BgaB 的 GH42 β-半乳糖苷酶的差异保守残基 (Ile42) 参与催化和热稳定性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Dairy Science
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Chen HQ;Sun YH;Zhang H;Chen W
  • 通讯作者:
    Chen W
Beta-半乳糖苷酶的研究现状与进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    食品与生物技术学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    董艺凝;陈海琴;张灏;陈卫
  • 通讯作者:
    陈卫
嗜热脂肪芽孢杆菌耐热β-半乳糖苷酶功能位点的累积进化研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    食品工业科技
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    董艺凝;陈海琴;张灏;陈卫
  • 通讯作者:
    陈卫
水/有机溶剂双相体系中乳糖溶解度的测定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国食品学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    董艺凝;孙艳辉;陈玉萍;吴维
  • 通讯作者:
    吴维

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其他文献

基于荧光光谱技术的菜籽油氧化状态智能评价
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    光谱学与光谱分析
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙艳辉;李双芳;郭玉宝;顾海洋;董艺凝
  • 通讯作者:
    董艺凝

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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