通用分子动力学模拟程序的显卡实现及其在金属团簇和纳米粒子动力学模拟中的应用

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    20973041
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    31.0万
  • 负责人：
    李振华
  • 依托单位：
    复旦大学
  • 学科分类：
    B0302.化学模拟与应用
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

本项目将通用动力学模拟程序ANT 07及金属常用分析势函数在通用计算显卡上实现，将极大幅度提高动力学模拟的速度和计算规模。本项目还将利用显卡计算技术对Al金属纳米粒子和纳米球壳的结构及其稳定性，纳米粒子的融合和解离，表面熔化等性质进行研究。本项目还将发展Ga,In半导体金属的精确势能函数，并在显卡计算上实现，用以研究Ga,In团簇和纳米粒子的结构，生长，解离，稳定性，以及相变等现象的一般性规律。精确Ga,In势能函数的发展将极大推动对Ga,In体系的理论模拟研究。

结项摘要

通过自然科学基金的资助，本课题成功的开发了一套全新的GPU版本的ANT07通用动力学模拟程序，并对其做了优化，为后续对超大体系的动力学研究工作打下了坚实基础。本项目还对金和镓金属团簇的精确计算筛选了方法，为金属团簇的精确计算奠定了基础。本项目对金属团簇的结构演化规律做了探索，得到了金团簇二维结构和三维结构转换的规律。本项目还计算了大量不同大小不同结构的团簇精确能量，以此为基础为金团簇初步优化了一个精确的势能面。本项目还对金属团簇碰撞的一般性规律进行了研究，得到了碰撞产物分布，产物角度分布的一般性规律。本课题提出了一个全新的旋转液滴模型用来解释产物的角度分布。课题原计划平均每年发表高质量SCI文章2-3篇，目前发表7篇SCI论文（其中一篇1区，4篇二区），一篇会议论文，并有3篇投寄，基本实现项目计划。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（1）
专利数量（0）
Infrared photodissociation spectra of mass selected homoleptic dinuclear iron carbonyl cluster anions in the gas phase
气相中质量选择均配双核铁羰基簇阴离子的红外光解离光谱
  • DOI：
    10.1039/c2sc20119d
  • 发表时间：
    2012-01-01
  • 期刊：
    CHEMICAL SCIENCE
  • 影响因子：
    8.4
  • 作者：
    Chi, Chaoxian;Cui, Jieming;Zhou, Mingfei
  • 通讯作者：
    Zhou, Mingfei
CO oxidation catalyzed by a single gold atom: benchmark calculations and the performance of DFT methods
单金原子催化的 CO 氧化：基准计算和 DFT 方法的性能
  • DOI：
    10.1039/c1cp21160a
  • 发表时间：
    2011-01-01
  • 期刊：
    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
  • 影响因子：
    3.3
  • 作者：
    Fang, Hao-Cheng;Li, Zhen Hua;Fan, Kang-Nian
  • 通讯作者：
    Fan, Kang-Nian
Periodic density functional theory studies of the VOx/TiO2 (anatase) catalysts: Structure and stability of monomeric species
VOx/TiO2（锐钛矿）催化剂的周期密度泛函理论研究：单体物种的结构和稳定性
  • DOI：
    10.1016/j.susc.2012.02.016
  • 发表时间：
    2012-06
  • 期刊：
    Surface Science
  • 影响因子：
    1.9
  • 作者：
    Du, Yu-Jue;Li, Zhen Hua;Fan, Kang-Nian
  • 通讯作者：
    Fan, Kang-Nian

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    --
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  • 通讯作者：
    徐艳春
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  • 通讯作者：
    陈笑

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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