灯盏花自交不亲和性S基因克隆及功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81160499
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    52.0万
  • 负责人：
    杨生超
  • 依托单位：
    云南农业大学
  • 学科分类：
    H3201.中药资源
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

自交不亲和性是被子植物在有性生殖过程中避免近亲繁殖的重要机制，在遗传上由具有复等位基因结构的S位点控制。雌性决定因子SRK基因在自交不亲和性反应基因系统中起着重要作用。与配子体型自交不亲和性相比，孢子体自交不亲和分子机理研究较少受到关注。本项目以具有孢子体型自交不亲和性反应的菊科飞蓬属植物灯盏花（Erigeron breviscapus）为对象，在前期克隆得到的3个与SRK和BRLK相似性较高的编码序列为基础，研究内容如下：1）筛选灯盏花cDNA文库，克隆SRK候选基因cDNA全长；2）鉴定灯盏花SRK基因的功能，明确灯盏花SRK基因是其自交不亲和性的雌性决定因子；3）建立灯盏花自交不亲和性的基因型鉴定方法，鉴定个体基因型。通过本项目的研究，可以为阐明菊科及灯盏花自交不亲和性的分子机理及其SRK基因在孢子体型自交不亲和性中的作用提供依据，为灯盏花育种及自交不亲和性利用奠定基础。

结项摘要

自交不亲和性是被子植物在有性生殖过程中避免近亲繁殖的重要机制，在遗传上由具有复等位基因结构的S位点控制。雌性决定因子SRK基因在自交不亲和性反应基因系统中起着重要作用。与配子体型自交不亲和性相比，孢子体自交不亲和分子机理研究较少受到关注。该项目以具有孢子体型自交不亲和性反应的菊科飞蓬属植物灯盏花（Erigeron breviscapus）为对象，对其自交不亲和S位点进行了研究。利用高通量测序对自交、异交处理的灯盏花进行了转录组测序，建立了灯盏花的转录组数据库，通过分析比对，我们推测了230个推测和灯盏花SI相关的unigenes，包括CaM，Annexin，THL，MLPK，ARC1基因等；克隆得到了SRK1基因的cDNA全长，长度为2637bp，和菊科植物千里光SRK1基因的同源性为85%。RT-PCR和western杂交鉴定了灯盏花SRK1的表达模式，实验结果表明SRK1基因没有直接涉及灯盏花的SI反应。我们还克隆了灯盏花的CaM、Annexin、THL 基因，生物信息学分析显示灯盏花这些基因都具有在其它植物中有活性的结构域，这也为我们进一步研究灯盏花SI信号传导提供了线索。最后我们做了灯盏花自交不亲和性克服的研究，培育了3个灯盏花自交系。

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
灯盏花自交不亲和SRK基因编码区甲基化初步分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    西部林业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    孟珍贵;梁泉;魏翔;杨生超
  • 通讯作者：
    杨生超
灯盏花转录组中SSR位点信息分析及其多态性研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    中国中药杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    杨生超;陈军文;杨建文;张广辉
  • 通讯作者：
    张广辉
Transcriptome analysis of Panax vietnamensis var. fuscidicus discovers putative ocotillol-type ginsenosides biosynthesis genes and genetic markers.
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  • DOI：
    10.1186/s12864-015-1332-8
  • 发表时间：
    2015-03-08
  • 期刊：
    BMC genomics
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Zhang GH;Ma CH;Zhang JJ;Chen JW;Tang QY;He MH;Xu XZ;Jiang NH;Yang SC
  • 通讯作者：
    Yang SC

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其他文献

两种黄连转录组中SSR位点信息分析与多态性引物开发
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • 影响因子：
    --
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    --
  • 作者：
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    杨生超
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    天然产物研究与开发
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李玛;王欣林;周博;杨生超
  • 通讯作者：
    杨生超

其他文献

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杨生超的其他基金

灯盏花叶数花期相关基因挖掘与利用
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    2019
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    地区科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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