基于高维非线性方法胃癌血清蛋白质谱数据整合平台的建立及评价
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:30872957
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:34.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:H1813.肿瘤诊断
- 结题年份:2011
- 批准年份:2008
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2009-01-01 至2011-12-31
- 项目参与者:邱福铭; 钟献; 郑军; 金胜航; 王晓晨; 王一刻; 陶熠昆; 张涛;
- 关键词:
项目摘要
SELDI-TOF-MS技术作为一种高通量的检测方法,文献与我们的研究证明其在许多肿瘤中能提高诊断效能,但发现以下三个问题:1)实验结果可重复性较差;2)数据预处理中的信息丢失;3)建立的模型存在过拟合问题。各环节的质量控制和标准化工作就成为亟待解决的问题。我们已建立了完善的实验前、中操作规范,因此分析方法的标准化成为关键。常规分析方法主要有SVM、PCA+LDA、决策树、神经网络等,均存在缺陷。鉴于SELDI-TOF质谱图的非线性特征标志如不稳定、非平衡、无序和非一致性,启发我们用分形分维、小波分析、模式聚类及多种数据挖掘技术等多种非线性方法分析,以简化数据预处理过程,减少信息丢失,得到更准确的结果,前期的工作也证实了该方法的可行性。故利用高维非线性方法,结合患者的临床病理参数,开发具有自主知识产权的血清蛋白质谱分析软件,可准确识别不同时间、实验室提供的胃癌样本,为其临床推广应用打下基础
结项摘要
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mining novel biomarkers for prognosis of gastric cancer with serum proteomics.
利用血清蛋白质组学挖掘胃癌预后的新型生物标志物
- DOI:10.1186/1756-9966-28-126
- 发表时间:2009-09-09
- 期刊:Journal of experimental & clinical cancer research : CR
- 影响因子:--
- 作者:Qiu FM;Yu JK;Chen YD;Jin QF;Sui MH;Huang J
- 通讯作者:Huang J
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