长江中下游浅水湖泊溞属枝角类休眠卵的遗传多样性及其优势种的种群遗传结构对水环境的响应机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31370470
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0306.生态系统生态学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Most of lakes are subtrapical and shallow in the middle and lower reaches of Yangtze River. They have obviously seasonal variations in water environments. The species diversity of Daphnia are abundant in these lakes. Using molecular markers of mitochondrial DNA(such as 12S rDNA、16S rDNA、COI)and nuclear DNA (such as ITS2), genetic diversity of Daphnia resting eggs in the sediments of these lakes were studied, including that genetic differences of Daphnia resting eggs located in different depths of the sediments. We studied the differences of genetic structure of Daphnia species in these selected lakes. Competitive potential and individual fitness of different genotypes in Daphnia were also researched. Moreover, the change of genetic structure in males, sexual females and resting eggs of Daphnia were studied. By these works, the differences of genetic structure of Daphnia resting eggs in the sediments and genetic mechanism of the adaptation of dominant Daphnia to seasonal variations of water environment could be elucidated in shallow lakes. It is very important to further understand seasonal and historical succession of Daphnia populations in subtropical and shallow lakes. In addition, the determination of genetic diversity of Daphnia may make up the deficiency in traditional morphology classify. It will make for exact identification and classify of Daphnia species.
长江中下游地区湖泊大多属典型的亚热带浅水湖泊,水环境的季节变化明显,溞属Daphnia物种多样性较为丰富。本项目运用线粒体DNA(如12S rDNA、16S rDNA、COI)和核DNA(如ITS2)等分子标记技术,研究亚热带浅水湖泊沉积物中溞属枝角类休眠卵的遗传多样性,以及处于不同深度的沉积物中溞属休眠卵的遗传分化;研究栖息于不同湖泊中溞属种类的种群遗传结构差异、不同Daphnia基因型的克隆群的竞争潜力和个体适合度;研究Daphnia雄体、两性生殖雌体及休眠卵的遗传结构的变化。从而揭示浅水湖泊沉积物中Daphnia休眠卵的遗传分化规律及优势种种群适应水环境季节变化的分子机理,这对深入理解亚热带浅水湖泊中Daphnia种群的季节演替规律及历史演变都具有十分重要的科学价值。此外,Daphnia遗传多样性的检测可以弥补其在传统形态分类上的不足,有助于Daphnia种类的准确鉴定和分类。

结项摘要

运用线粒体DNA(12S rDNA、16S rDNA、COⅠ)和核DNA(Microsatellite marker)等分子标记技术,研究了长江中下游湖泊沉积物中溞属休眠卵的遗传多样性和优势种群遗传结构对水环境的响应,取得以下成果:.(1)在长江中下游湖泊中,已鉴定的溞属种类有中华拟同形溞、蚤状溞和盔形溞,且溞属种类及其密度在不同湖泊间差异较大,有的湖泊没有检测到溞属种类。不管怎样,三种溞属种类的卵鞍在已调查的湖泊沉积物中均有分布。在湖泊沉积物中,溞属种类的卵鞍密度在沉积柱的中上层较高,而随着沉积柱深度的增加,溞属种类的卵鞍密度偏低或为零。这种分布特征与湖泊沉积层的营养盐含量存在一定的相关性。(2)与沉积柱下层的溞属休眠卵相比,位于沉积柱中上层(1980s)的溞属休眠卵遗传多样性指数较高,遗传分化明显。这与该地区湖泊生态系统变化和人类活动相一致。在1950年前,长江中下游湖泊的连通性较好,溞属种群间交流频繁,遗传差异小。但1950后,筑坝引起湖泊间的阻隔减少了溞属种群的基因流,遗传分化增加。地理隔离是导致3个溞属种类的遗传多样性在长江中下游地区不同湖泊间产生显著差异的重要因素。(3)巢湖中华拟同形溞和武汉南湖蚤状溞均存在季节性的遗传分化。巢湖中华拟同形溞现生种群的遗传结构明显分化为两个分支,即冬春季分支和春夏季分支。且不同月份的亚种群间的遗传分化随时间增加,Fst值逐步变大。武汉南湖蚤状溞有四个明显的进化方向,二月和三月的蚤状溞亚种群显著区别于一月和四月。(4)单倍型进化显示,巢湖沉积层中中华拟同形溞休眠卵种群有两个起源中心,且分别分布在0~6cm沉积层和6 cm~15 cm沉积层。在军山湖沉积层的5个亚种群中,0~3 cm沉积层中的中华拟同形溞种群偏离中性进化,存在瓶颈效应和种群扩张现象。(5)由于水体富营养化,多数长江中下游湖泊铜绿微囊藻水华频繁暴发。研究发现,中华拟同形溞能够通过上调体内SOD活性来增强自身对有毒铜绿微囊藻的抗逆性,且体内的不同核受体基因和Hox基因的表达对铜绿微囊藻产生不同的响应机制,甚至能够通过母体效应将亲代基因表达上调的信息传递给子代,使子代对有毒铜绿微囊藻有更强的适应能力。. 本研究揭示了溞属种类的种群遗传结构响应短期和长期环境变化(湖泊富营养化和地理隔离)的演变规律,该结果将为深入研究区域间溞属种类的遗传多样性和分子系统进化提供参考。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The complete mitochondrial genome of the Chinese Daphnia pulex (Cladocera, Daphniidae).
中国水蚤(枝角类,水蚤科)完整线粒体基因组
  • DOI:
    10.3897/zookeys.615.8581
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Geng X;Cheng R;Xiang T;Deng B;Wang Y;Deng D;Zhang H
  • 通讯作者:
    Zhang H
Genetic Diversity of Daphnia pulex in the Middle and Lower Reaches of the Yangtze River.
长江中下游水蚤遗传多样性
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0152436
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Wang W;Zhang K;Deng D;Zhang YN;Peng S;Xu X
  • 通讯作者:
    Xu X
Effects of colonial Microcystis aeruginosa and interspecific competition on the population dynamics and resting egg formation of two cladocerans
铜绿微囊藻群落和种间竞争对两种枝角动物种群动态和休眠卵形成的影响
  • DOI:
    10.1080/02705060.2013.873882
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Journal of Freshwater Ecology
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Shao Yuanqi;Deng Daogui;Meng Meiru;Zhang Xiaoli;Li Fang
  • 通讯作者:
    Li Fang
Reproductive switching analysis of Daphnia similoides between sexual female and parthenogenetic female by transcriptome comparison.
通过转录组比较分析拟水蚤有性雌性和孤雌性雌性之间的生殖转换
  • DOI:
    10.1038/srep34241
  • 发表时间:
    2016-09-27
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Zhang YN;Zhu XY;Wang WP;Wang Y;Wang L;Xu XX;Zhang K;Deng DG
  • 通讯作者:
    Deng DG
Combined effects of four Microcystis aeruginosa strains and Scenedesmus obliquus concentrations on population dynamics and resting egg formation of two Daphnia species
四种铜绿微囊藻菌株和斜生栅藻浓度对两种水蚤种群动态和休眠卵形成的综合影响
  • DOI:
    10.1007/s10201-014-0433-4
  • 发表时间:
    2014-08-01
  • 期刊:
    LIMNOLOGY
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Li, Fang;Deng, Daogui;Huang, Qingfei
  • 通讯作者:
    Huang, Qingfei

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其他文献

温度对发头裸腹溞(Moina irrasa)种群动态和两性生殖的影响
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  • 发表时间:
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  • 发表时间:
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  • 发表时间:
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  • 发表时间:
    2014
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    查岭生

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邓道贵的其他基金

富营养湖泊中溞属种类表型可塑性的生态适应及其分子进化机制
  • 批准号:
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富营养化水体中蓝藻对枝角类休眠卵形成和萌发影响的生态学机理
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  • 项目类别:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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