青藏高原高寒草甸外生菌根真菌——黄绿卷毛菌小尺度空间遗传结构及其基株分布动态研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31600409
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0305.群落生态学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Ectomycorrhizal fungi (ECM fungi) plays a key role in the ecosystem. Currently, the population genetic structure study of ECM focuses on the number of genotypes and their spatial distribution. The underlying mechanisms that lead to the generation and maintenance of these genotypes remain unclear. The ECM fungal life cycle is generally composed of two processes: sexual reproduction and vegetative mycelial extension. The balance between those two processes is one of the most important factor that influence the distribution pattern of ECM. The most effective way to dissect the secret of ECM reproduction is to examine the genets. In this proposed grant, we will develop new SSR markers for Floccularia luteo-virens, a wildly distributed ECM fungi on the meadow of Qinghai-Tibet plateau to reveals the distribution pattern and the relative between above- and blow-ground genets, the reproductive characteristic, genets dynamics and gene flow of this species. This research will shed light on the ecological function, reproductive strategy and conservation. Furthermore, the knowledge gained from this study can be useful for understanding the function and diversity of the ECMs under the grassland ecosystem.
外生菌根真菌(ECM)是草地生态系统的重要组成部分。目前对于ECM种群遗传结构的研究,多集中于研究其基因型的数量及空间分布。然而,对这一结构的形成机制缺乏了解。ECM的生殖方式包括有性生殖与菌丝体的营养生长,这两种生殖方式的动态平衡是影响ECM种群空间分布模式的重要因素之一。当前,研究ECM基株(genet)的分布模式(基株尺寸、密度及持续性)是研究其生殖方式的最有效的手段。本项目拟利用全新开发的适用于测序分析的SSR引物研究青藏高原高寒草甸上广泛分布的ECM黄绿卷毛菌(Floccularia luteo-virens)的基株分布模式、地上、地下基株相关性,并探究其生殖特点、种群动态及基因流。预期研究结果将对了解黄绿卷毛菌生态学作用、生殖状态以及子实体资源的保护提供有力的支持,也为今后草地生态系统其他ECM的相关研究提供理论支持。

结项摘要

外生菌根真菌(ECM)在陆地生态系统中起着至关重要的作用,他们在吸收宿主光合作用产物的同时能够扩大宿主根系的吸收面积从而提高宿主的抗逆能力,同时外生菌根真菌的子实体,是人类重要的食物来源之一。目前,对于菌根真菌遗传结构的研究,多集中于研究单个或多个物种的单倍型的分布,而对于造成特定物种单倍型分布原因的研究非常有限。ECM种群空间分布模式主要是受其生殖方式的影响,研究ECM基株(genet)的分布模式(基株尺寸、密度及持续性)是研究其生殖方式的最有效的手段。本研究以分布在青藏高原高寒草甸上的黄绿卷毛菇(Floccularia luteovirens)为研究对象,连续三年(2015-2017)采集3块样地、5个蘑菇圈所有地上子实体(235个)及2017地下土壤样本(95份),系统研究了该物种基株的分布模式、种群动态、地上地下基株相关性、生殖特性及孢子散布能力。结果表明:1.各样地各个蘑菇圈均由多种基株组成,这可能由于蘑菇圈在扩张的过程中与其他的蘑菇圈产生了融合。2.各样地各个蘑菇圈基株尤其是子实体较多的优势基株每年的分布位置、数量是比较稳定的,而一些数量相对较少的基株有很多只是短暂的出现。产生这一现象的主要因素是priority effects(先入者效应)的产生,即在特定空间内首先侵染宿主根尖的基株具有压倒性的优势,它们会不断扩张、繁殖,而新的基株往往无法与它们竞争。3.地下基株与地上基株无论在分部范围还是基株类型上都呈现一一对应的关系。4.从各个样地基株的大小及密度来看,子实体数量多、直径大的基株在各蘑菇圈中占有一定的优势,黄绿卷毛菇在青藏高原高寒草甸上更倾向于无性生殖的方式对外扩张。5.结合Spatial structure analysis分析综合分析,青藏高原高寒草甸上黄绿卷毛菇在短距离上倾向于相同基株的聚集,也预示其孢子具有较短的传播距离。本研究成果为今后类似研究在采样策略方面提供了支持,也为进一步研究外生菌根真菌小尺度遗传结构提供了理论支持。在本项目资助下,已发表SCI研究论文4篇,CSCD论文2篇、申请发明专利一项并协助培养博士研究生2名。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Microbial communities inhabiting the fairy ring of Floccularia luteovirens and isolation of potential mycorrhiza helper bacteria
居住在黄绿絮球仙女环中的微生物群落以及潜在菌根辅助细菌的分离
  • DOI:
    10.1002/jobm.201700579
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of Basic Microbiology
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Xing Rui;Yan Hui ying;Gao Qing bo;Zhang Fa qi;Wang Jiu li;Chen Shi long
  • 通讯作者:
    Chen Shi long
Large-scale distribution of bacterial communities in the Qaidam Basin of the Qinghai-Tibet Plateau
青藏高原柴达木盆地细菌群落的大规模分布
  • DOI:
    10.1002/mbo3.909
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    MicrobiologyOpen
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Xing Rui;Gao Qing-bo;Zhang Fa-qi;Wang Jiu-li;Chen Shi-long
  • 通讯作者:
    Chen Shi-long
基于核基因的黄绿卷毛菇系统发育与谱系地理学分析
  • DOI:
    10.13417/j.gab.038.003057
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    基因组学与应用生物学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邢睿;徐明行;王久利;陈世龙
  • 通讯作者:
    陈世龙
基于RAD测序技术的黄绿卷毛菇(Floccularia luteovirens)微卫星引物的开发
  • DOI:
    10.13417/j.gab.038.001103
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    基因组学与应用生物学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邢睿;王久利;闫慧颖;陈世龙
  • 通讯作者:
    陈世龙
Bacterial community in cold and alkaline environments of Hoh Xil basin in Qinghai-Tibet Plateau and isolation of potential sources of microbiota
青藏高原可可西里盆地冷碱环境下细菌群落及潜在微生物来源分离
  • DOI:
    10.1007/s13213-019-01447-w
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Annals of Microbiology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Xing Rui;Gao Qing bo;Zhang Fa qi;Wang Jiu li;Chen Shi long
  • 通讯作者:
    Chen Shi long

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南川绣线菊和细枝绣线菊分子水平研究
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  • 作者:
    张发起;高庆波;李印虎;付鹏程;邢睿;陈世龙
  • 通讯作者:
    陈世龙
“在哪里”和“有多少”? 中国雪豹调查与空缺
  • DOI:
    10.17520/biods.2019027
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    2019-09-25
  • 期刊:
    Biodiversity Science
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  • 作者:
    刘沿江;李雪阳;梁旭昶;刘炎林;程琛;李娟;汤飘飘;齐惠元;卞晓星;何兵;邢睿;李晟;施小刚;杨创明;薛亚东
  • 通讯作者:
    薛亚东

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
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          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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