结核分枝杆菌基因Rv0621抗表面活性剂分子机理的深入研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81071316
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    33.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2201.病原细菌与感染
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

本项目拟解决的科学问题是结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,以下简称结核菌)抗表面活性剂的分子机理。主要切入点是深入研究我们前期工作发现的结核菌功能未知基因Rv0621的分子功能和相关的分子机理。该基因赋予大肠杆菌抗表面活性剂(surfactant)性能。重点是验证我们关于Rv0621基因的酶学功能假设以及在结核菌感染过程中的表达规律。相关假设主要依据我们先前发现的含有Rv0621的重组大肠杆菌的细胞膜脂肪酸组分改变和生物信息学分析的结果。这将有助于明确Rv0621的功能以及在结核菌感染过程中的作用,并可能为结核病防治新措施提供启发。

结项摘要

结核病仍然是严重威胁全球人类健康的重大传染病。结核病的致病菌-结核分枝杆菌的胁迫抵抗能力、耐药性、持留能力,日益增多的HIV感染者、唯一疫苗卡介苗效果的不稳定性、人群日益老龄化和免疫抑制剂使用增加等都与结核病控制的严峻形势密不可分。表面活性剂被认为是感染肺部的结核菌必需应对的胁迫之一。因此,揭示表面活性剂抗性的分子机理有助于发现新药物靶标。我们利用十二烷基硫酸钠作为表面活性剂模型,从酶切结核菌全基因组片段,在大肠杆菌中构建结核菌的基因组文库中筛选获得赋予抗性的基因Rv0621。.Rv0621是结核菌特有的基因。通过对研究测定全基因组序列的20多个分枝杆菌进行序列比对,只在结核菌中发现Rv0621,在其他分枝杆菌和微生物中未见同源分子。根据Rv0621的氨基酸序列,生物信息学分析发现其为多次跨膜蛋白。Rv0621可以在大肠杆菌中表达,尽管western检测发现Rv0621成功表达在细胞膜组分中,但是很难获得超量表达。这可能与该分子的高GC含量和细胞膜定位有关。鉴于其分子量较大,不适合溶液中核磁共振进行结构分析。获得大量蛋白进行晶体结构和酶活测定方面也需要探索。Rv0621具有抗原性。根据美国Rutgers大学新泽西医学院公共卫生研究所genario的报道,在2000多份采集自全球的结核病患者的血清中,有一例患者能够与芯片上的Rv0621反应。但是,在我们的16例结核病患者血清实验中,利用重组细胞破碎提取物进行ELISA,未检测到阳性信号。我们在耻垢分枝杆菌中重组表达了Rv0621。表达Rv0621重组耻垢分枝杆菌对利福平的耐受增加,而对其他药物异烟肼、链霉素、卷曲霉素的耐受能力与对照无异。利福平为高效广谱抗生素,抑制或杀灭繁殖期和静止期的结核菌利福平能选择性抑制细菌依赖DNA的RNA聚合酶,阻断mRNA合成。同时,Rv0621影响了结核菌的脂肪酸组成。重组菌的饱和脂肪酸16:0和18:0含量均降低,不饱和脂肪酸16:1 w9c和18:1 w9c含量均增加。与空载相比,重组菌还有许多低含量的峰出现。RT-PCR发现重组菌中两个去饱和酶编码基因MSMEG2938和MSMEG5248的转录上调。但是,Rv0621过表达与利福平耐受、脂肪酸组成改变和脂肪酸去饱和酶之间的关系尚待研究。未发现Rv0621对持留有显著影响。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Comparative Genomic Insights Into the Biosynthesis and Regulation of Mycobacterial Siderophores
分枝杆菌铁载体生物合成和调控的比较基因组见解
  • DOI:
    10.1159/000343343
  • 发表时间:
    2013-01-01
  • 期刊:
    CELLULAR PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li, Wu;He, Junli;Xie, Jianping
  • 通讯作者:
    Xie, Jianping
Prokaryotic Ne-lysine acetylomes and implications for new antibiotics
原核赖氨酸乙酰组及其对新抗生素的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Journal of Cellular Biochemistry
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Xie, Longxiang;Xie, Longxiang;Li, Wu;Li, Wu;Xie, Jianping;Xie, Jianping
  • 通讯作者:
    Xie, Jianping
The Structure, Function, and Regulation of Mycobacterium FtsZ
分枝杆菌 FtsZ 的结构、功能和调控
  • DOI:
    10.1007/s12013-012-9415-5
  • 发表时间:
    2013-03-01
  • 期刊:
    CELL BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Hong, Weiling;Deng, Wanyan;Xie, Jianping
  • 通讯作者:
    Xie, Jianping
Structure and function of mycobacterium glycopeptidolipids from comparative genomics perspective
从比较基因组学角度分析分枝杆菌糖肽脂的结构和功能
  • DOI:
    10.1002/jcb.24515
  • 发表时间:
    2013-08-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Pang, Lei;Tian, Xuelian;Xie, Jianping
  • 通讯作者:
    Xie, Jianping
Mycobacterium tuberculosis PE_PGRS17 Promotes the Death of Host Cell and Cytokines Secretion via Erk Kinase Accompanying with Enhanced Survival of Recombinant Mycobacterium smegmatis
结核分枝杆菌PE_PGRS17通过Erk激酶促进宿主细胞死亡和细胞因子分泌并增强重组耻垢分枝杆菌的存活率
  • DOI:
    10.1089/jir.2012.0083
  • 发表时间:
    2013-08-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF INTERFERON AND CYTOKINE RESEARCH
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Chen, Tian;Zhao, Quanju;Xie, Jianping
  • 通讯作者:
    Xie, Jianping

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    谢建平

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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