全氟化合物通过组蛋白乙酰化酶抑制干扰雌激素受体介导信号通路的理论研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21277164
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    85.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0601.理论环境化学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Disruption of intracellular estrogen receptor-mediated signaling via non receptor binding mechanism such as histone deacetylase inhibition play an important role for perfluorinated chemicals. In the present project, both theoretical simulation methods and necessary bioassays are adopted to explore disruption mechanism of estrogen receptor activity through histone deacetylase inhibition by perfluorinated chemicals. Specifically, homology modeling and function analysis of selected histone deacetylase will be performed to obtain the 3D-structure of the enzyme proteins, while quantum mechanics will be coupled with optimized molecular dynamics strategy to evaluate possible modes of action and reveal the inhibition mechanism involving the continuous open-close motion regulation of the acetyl-releasing channel door. Subsequently, molecular basis of histone deacetylase inhibition selectivity will be elucidated for typical perfluorinated chemicals. Furthermore, causality between estrogenic effect of pollutants and perturbation of estrogen receptor-mediated signaling induced by pathway components such as histone deacetylase and its substrate was explored to find the key toxicity pathway on the basis of estrogen receptor progressive activation. Finally, disruption mechanism of estrogen receptor activity through histone deacetylase inhibition by perfluorinated chemicals will be established and revised using both theoretical simulation results and experimental information. The exploration in the present project may provide theoretical foundation and methodology support to both health risk assessment and ecological risk assessment of chemical contaminants.
组蛋白乙酰化为表观遗传学修饰的一种重要形式,全氟化合物可通过组蛋白去乙酰化酶抑制等非配体依赖受体激活作用干扰雌激素受体介导信号通路。本项目拟采用理论模拟与实验验证相结合的研究方法,重点开展污染物引发的蛋白乙酰化水平变化对雌激素受体活化作用影响的生物化学机制研究。通过同源模建构建典型组蛋白去乙酰化酶结构,基于量子力学与分子动力学相结合的方法寻找污染物与酶可能的结合模式,模拟分析疏水活性作用通道对酶活性的调控过程,揭示全氟化合物的酶选择性抑制分子基础。将全氟化合物蛋白乙酰化水平干扰活性与其对雌激素受体信号作用通路的扰动相互关联,基于不同靶点间程序调控模式进行数学建模,诠释污染物雌激素效应的关键毒性作用路径。以计算结果指导实验研究,阐明污染物引发的蛋白乙酰化水平变化对雌激素受体活化作用影响的生物化学机制,为科学评价污染物的环境危害与健康风险提供理论依据与方法贮备。

结项摘要

组蛋白乙酰化为表观遗传学修饰的一种重要形式。项目基于组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制等非配体依赖受体激活作用干扰雌激素受体介导信号通路的理论模拟和实验研究,解析了全氟化合物(PFCs)引发的组蛋白乙酰化水平变化对雌激素受体(ER)活化作用影响的生物化学机制。项目采用晶体结构搜索优化和多模板同源模建构建了典型组蛋白去乙酰化酶较完整的三维结构,量化计算显示保守的酶催化位点中组氨酸质子化状态的改变会导致依赖于锌离子的HDAC酶催化位点HIS-ASP电荷传递系统效率等发生变化而改变其基元反应历程。项目以典型HDAC抑制剂为探针揭示了抑制剂结合所致酶结构适应性变化的分子机制,研究指出HDAC具有显著的配体诱导契合能力,其抑制剂主要通过作用于底物结合通道、乙酰基离去通道/内部口袋、与低口袋结合或者作用于D-型1,4,5,6-四磷酸肌醇等表面位点影响蛋白招募其他转录控件等多种方式而干扰酶催化反应的进行。相应地,长链PFCs可通过与典型HDAC的底物结合通道等作用导致酶部分失活,而短链则可能通过作用于乙酰基释放通道而抑制酶催化反应产物的离开抑制酶活性,PFCs直/支链异构影响其对于HDAC活性的干扰,而PFCs极高蛋白亲和力使得其会作用于HDAC蛋白表面从而导致表观酶活抑制能力下降。项目进一步采用雌激素受体信号作用路径的离体毒性测试、相关基因表达与环境计算毒理相结合的方法,证实PFCs可通过直接ER结合、HDAC抑制等多种分子起始反应对ER活化作用产生影响,从而将PFCs的雌激素效应与微观水平其对雌激素受体信号作用通路关键节点功能让的干扰相互关联。此外,由于很多HDAC的细胞功能仍未清晰,研究表明抑制剂-HDAC复合物稳定性及其动力学特征虽与特定蛋白乙酰化水平有关,但其与ER活化并不一定具有显著的相关关系,这主要是由于一种HDAC可调控不止一类细胞功能。项目已经在SCI源刊发表标注资助研究论文8篇;2项计算机软件著作权完成登记。相关研究成果参加4次国际国内学术会议大会报告交流,培养了2名博士生。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(3)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Understanding the microscopic binding mechanism of hydroxylated and sulfated polybrominated diphenyl ethers with transthyretin by molecular docking, molecular dynamics simulations and binding free energy calculations
通过分子对接、分子动力学模拟和结合自由能计算了解羟基化和硫酸化多溴二苯醚与甲状腺素运载蛋白的微观结合机制
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Molecular BioSystems
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang Ling;Zhao Chunyan;Fu Jianjie;Zhang Aiqian
  • 通讯作者:
    Zhang Aiqian
Interaction of perfluoroalkyl acids with human liver fatty acid-bindingprotein
全氟烷基酸与人肝脂肪酸结合蛋白的相互作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Archives of Toxicology
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Li Juan;Li Hui;Zhang Aiqian;Dai Jiayin
  • 通讯作者:
    Dai Jiayin
Occurrence, temporal trends, and half-lives of perfluoroalkyl acids (PFAAs) in occupational workers in China
中国职业工人中全氟烷基酸(PFAA)的出现情况、时间趋势和半衰期
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Scientific Report
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yuan Bo;Wang Yawei;Zhang Aiqian;Jiang Guibin
  • 通讯作者:
    Jiang Guibin
In silico approach to investigating the adsorption mechanisms of short chain perfluorinated sulfonic acids and perfluorooctane sulfonic acid on hydrated hematite surface
计算机模拟研究短链全氟磺酸和全氟辛烷磺酸在水合赤铁矿表面的吸附机理
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Water Research
  • 影响因子:
    12.8
  • 作者:
    Cao Huiming;Fu Jianjie;Gao Ke;Zhang Aiqian
  • 通讯作者:
    Zhang Aiqian
An exploration of the estrogen receptor transcription activity of Capsaicin analogues via an integrated approach based on in silico prediction and in vitro assays
通过基于计算机预测和体外测定的综合方法探索辣椒素类似物的雌激素受体转录活性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Toxicological Letters
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ma Duo;Lin Yuan;Fu Jianjie;Zhang Aiqian
  • 通讯作者:
    Zhang Aiqian

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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