高特异高通量糖蛋白质类肿瘤标志物检测与识别新方法

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21335002
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    300.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Glycosylation is one of the most universal and important protein post-translational modifications (PTMs), which has vital significance in disease, especially in the tumorigenesis progression and metastasis. The degree of glycosylation and changes of glycan has been identified as cancer biomarkers. However, study on such an important post-translational modifications in proteome has not been widely developed due to lack of effective methods for large scale research. Aiming at key techniques in glycoproteome field, this program will develop corresponding new analytical methods, including highly selective separation and enrichment technique for glycoprotein by novel composite-functional nanomaterials, highly effective glycoprotein digestion and deglycosylation technique by immobilized enzyme reactor, technique for enhancing ionization efficiency of glycopeptides and glycan by chemical derivation, glycoprotein relative quantification technique by isotope labeling relative quantification and MRM absolute quantification technique, and highly sensitive and fast detection method for targeted glycoprotein by intermolecular relaxation. All of these techniques contribute to the high-sensitive and high-accurate identification and high-precision quantification of glycoprotein and provide effective methods and plenty data for seeking glycoprotein biomarker in diseases such as colorectal cancer.
蛋白质糖基化是最为普遍和最为重要的翻译后修饰种类之一,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中具有极其重要的意义,蛋白质糖基化程度及糖链结构的异常变化常常是癌症及其他疾病发生的标志,从蛋白质糖基化入手寻找生物标志物将更加特意和更加灵敏。然而,糖基化这样一个重要的翻译后修饰蛋白质组之所以尚未被广泛开展并不是因为意义不够重大,而是因为缺乏有效的大规模研究方法以及高灵敏的目标糖蛋白质检测方法。本项目针对糖蛋白质组研究中的几大关键技术问题发展相应的分析新方法,包括1)新型复合功能纳米材料高选择性分离富集糖蛋白质,2)微纳固定酶反应器高效糖蛋白质酶解和去糖链,3)化学衍生提高糖肽和糖链的离子化效率,4)同位素标记糖蛋白质的相对定量技术和MRM绝对定量技术,和5) 分子弛豫技术高灵敏、快速检测目标糖蛋白质,为挖掘重大疾病如大肠癌等的糖蛋白质生物标志物提供有效的技术方法和翔实的数据。

结项摘要

蛋白质糖基化是最为重要的翻译后修饰之一,在疾病发生、发展和转移中具有极其重要意义。蛋白质糖基化程度及糖链结构的异常通常是肿瘤发生的标志,因此从蛋白质糖基化入手寻找肿瘤标志物将更特异和更灵敏。然而,目前尚缺乏高特异的大规模研究方法及高灵敏的目标糖蛋白质检测方法。为了突破该技术瓶颈,本项目发展了系列糖蛋白质组高特异质谱分析新方法和目标糖蛋白质高灵敏甄别方法,主要包括:1)建立了多种糖蛋白质富集新方法,包括新型滤膜辅助肼化学法、非还原胺化法、肟点击化学法、协同富集,使糖蛋白质的富集时间缩短近6倍,选择性耐受两个数量级非糖肽干扰,质谱分析灵敏度达fmol水平,回收率高于90%;2)发展了含氟试剂等多种糖链衍生试剂、新基质和固相富集方法,大大简化了糖链质谱分析步骤,可实现10倍肽段干扰时糖链的直接质谱分析,糖链检测限降低至amol水平,并有助于解析糖链同分异构体;3)发展了多种糖链质谱定量新方法,包括同位素氨基酸、同位素含氟试剂、稀土金属、糖链双端标记策略,实现了酸性糖链与中性糖链同时高可靠(R2>0.99)、高重现(CV<25%)、多通道(4标)的精准定量;4)发展了多重新型核酸等温扩增LAMP方法(Bst全长DNA聚合酶,金纳米颗粒),实现了核酸等温扩增介导的高灵敏的糖蛋白质检测。结合ELISA-PLA平台,实现了AKT、c-Fos、CREB和STAT3的O-GlcNAc的糖基化修饰水平的定量检测;5)发展了多种新型基于纳米功能材料的分子探针用于糖蛋白质的检测,开发了便携式生物发光检测仪,使得目标糖蛋白甲胎蛋白AFP的检测限达到0.016 ng/ml;6)发展了基于糖蛋白特异性作用的肿瘤细胞和外泌体的高灵敏检测方法。基于糖蛋白迁移抑制因子(MIF)的SERS免疫法可以区分胰腺癌患者与健康人和肿瘤转移程度。上述发展的方法已成功应用于肠癌,胰腺癌等临床样品的研究,应邀在Chem. Soc. Rev.等期刊撰写糖蛋白质研究综述多篇。基于LAMP法开发的多通道分子诊断仪器已经商业化生产, 可用于包括糖蛋白质等生物分子的高灵敏度快速的检测和甄别。

项目成果

期刊论文数量(74)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Visual and Highly Sensitive Detection of Cancer Cells by a Colorimetric Aptasensor Based on Cell-Triggered Cyclic Enzymatic Signal Amplification
基于细胞触发循环酶信号放大的比色适体传感器对癌细胞进行视觉和高灵敏检测
  • DOI:
    10.1021/ac501068k
  • 发表时间:
    2014-06-03
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zhang, Xianxia;Xiao, Kunyi;Kong, Jilie
  • 通讯作者:
    Kong, Jilie
Hydrazide Functionalized Core-Shell Magnetic Nanocomposites for Highly Specific Enrichment of N-Glycopeptides
用于高度特异性富集 N-糖肽的酰肼功能化核壳磁性纳米复合材料
  • DOI:
    10.1021/am501110e
  • 发表时间:
    2014-05-28
  • 期刊:
    ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    Liu, Liting;Yu, Meng;Lu, Haojie
  • 通讯作者:
    Lu, Haojie
Mass spectrometry-based N-glycoproteomics for cancer biomarker discovery.
基于质谱的 N-糖蛋白组学用于癌症生物标志物发现。
  • DOI:
    10.1186/1559-0275-11-18
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Clinical proteomics
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Zhang Y;Jiao J;Yang P;Lu H
  • 通讯作者:
    Lu H
Protein-inorganic hybrid nanoflowers as ultrasensitive electrochemical cytosensing Interfaces for evaluation of cell surface sialic acid
蛋白质-无机杂化纳米花作为超灵敏电化学细胞传感界面,用于评估细胞表面唾液酸
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2015.01.003
  • 发表时间:
    2015-06-15
  • 期刊:
    BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Cao, Hongmei;Yang, Da-Peng;Kong, Jilie
  • 通讯作者:
    Kong, Jilie
Gold nanoparticle-mediated nucleic acid isothermal amplification with enhanced specificity
金纳米颗粒介导的核酸等温扩增具有增强的特异性
  • DOI:
    10.1016/j.aca.2018.09.016
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Analytica Chimica Acta
  • 影响因子:
    6.2
  • 作者:
    Xin Ye;Xueen Fang;Xinxin Li;Jilie Kong
  • 通讯作者:
    Jilie Kong

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其他文献

基于多级质谱的蛋白质组定量新方法新技术进展
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  • 通讯作者:
    陆豪杰
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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
    陆豪杰
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    郭寅龙
蛋白质棕榈酰化修饰的分析方法进展
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
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  • 作者:
    方彩云;张晓勤;陆豪杰
  • 通讯作者:
    陆豪杰
聚甲基丙烯酸甲酯固定化碳纳米管作为MALDI基质的研究
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    陆豪杰;蔡瑞芳;贾韦韬;杨芃原;吴慧霞
  • 通讯作者:
    吴慧霞

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基于稳定同位素标记的唾液酸连接方式高精准质谱解析新方法
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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