基于DNAzyme的多种金属离子同时分离分析新方法研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21305153
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0401.分离与分析
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Metal ions play beneficial or deleterious roles in biological and environmental system, so it is very significant to determine the metal ions with high sensitivity and high specificity. In recent years, sensing metal ions based on DNAzyme (or Deoxyriboenzyme) has attracted more attention. DNAzyme is a single-stranded catalytic DNA isolated through in vitro selection, which shows the structure-specific recognition capability and catalytic activity. Most DNAzymes require metal ions for their activities, and even show metal specificity. Therefore, DNAzyme can be used for metal ions sensing. Here, we use metal ions-dependent DNAzymes as the sensitive biological element to develop a high sensitive and specific method for detection of metal ions, which use highly efficient and sensitive capillary electrophoresis-laser induced fluorescence polarization (CE-LIFP) as the means of detection. The single fluorophore labeled DNA substrate and its catalytic product is well separated under the sieving medium, which can be detected by CE-LTFP. Furthermore, we anticipate it can be extended to simultaneously detect multiple metal ions and be applied in real samples.
金属离子在生物体和环境中扮演着重要角色,因此对金属离子进行高灵敏和特异性检测具有重要意义。近年来,基于脱氧核酶(DNAzyme或Deoxyribozyme)的金属离子传感分析受到人们关注。 DNAzyme是通过体外筛选获得的一种具有催化功能的单链DNA片段,具有高效的结构识别能力和催化活性。大多数DNAzyme具有金属离子依赖性,只有在特定金属离子存在时才表现出催化活性,因此DNAzyme可被用来特异性检测金属离子。本项目拟以金属离子作为辅助因子的DNAzyme作为生物敏感元件,利用筛分介质介导毛细管电泳对单荧光标记的DNA底物和产物进行有效分离,通过灵敏的毛细管电泳-激光诱导荧光偏振技术进行检测,建立特异性好和灵敏度高的金属离子分离分析新方法。在此基础上,进一步探索多种金属离子同时分离分析新方法,并希望将该方法能够应用于实际样品检测中。

结项摘要

金属离子在生物体和环境中扮演着重要角色,因此对金属离子进行高灵敏和特异性检测具有重要意义。近年来,基于脱氧核酶(DNAzyme或Deoxyribozyme)的金属离子传感分析受到人们关注。 DNAzyme是通过体外筛选获得的一种具有催化功能的单链DNA片段,具有高效的结构识别能力和催化活性。大多数DNAzyme具有金属离子依赖性,只有在特定金属离子存在时才表现出催化活性,因此DNAzyme可被用来特异性检测金属离子。基于DNAzyme的特性并围绕研究目标开展以下主要研究工作:(1)选取Pb2+-依赖RNA核苷切割型DNAzyme GR-5为模型,由于切割后产物链的长度与荧光标记的底物链长度相比变短,利用本实验室先前建立的金属离子介导毛细管电泳方法可将产物、底物及底物与DNAzyme形成的复合物分离,建立一种基于DNAzyme金属离子介导毛细管电泳-激光诱导荧光检测Pb2+的分析方法;(2)存在Pb2+时GR-5 DNAzyme能有效切割其含RNA核苷切割位点的底物链,切割后荧光标记的产物与荧光标记的底物及复合物相比,分子量发生了明显的降低,结合荧光偏振的原理,并利用荧光基团与DNA中鸟嘌呤G间的光诱导电子转移作用对荧光偏振的影响,发展了一种非纳米粒子、鸟嘌呤增强荧光偏振信号放大检测RNA核苷-切割型DNAzyme活性的分析方法;(3)一种富含G的核酸适配体与小分子Pb2+具有强亲和作用,当Pb2+诱导其形成G-四链体时,标记的荧光基团TMR与周围的G之间的光诱导电子转移作用减弱/消除,引起荧光寿命增大导致荧光偏振响应降低,因此发展了一种基于可诱导的G-四链体核酸适配体降低型荧光偏振响应灵敏检测Pb2+的分析方法。已发表学术论文3篇,按计划完成,达到预期目标。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Detection of of 1,N-2-propano-2 '-deoxyguanosine adducts in genomic DNA by ultrahigh performance liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry in combination with stable isotope dilution
超高效液相色谱-电喷雾电离-串联质谱联用稳定同位素稀释法检测基因组DNA中的1,N-2-丙-2'-脱氧鸟苷加合物
  • DOI:
    10.1016/j.chroma.2016.04.067
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Zhang Ning;Song Yuanyuan;Wu Danni;Xu Tian;Lu Meiling;Zhang Weibing;Wang Hailin
  • 通讯作者:
    Wang Hailin
Nanoparticles-Free Fluorescence Anisotropy Amplification Assay for Detection of RNA Nucleotide-Cleaving DNAzyme Activity
用于检测 RNA 核苷酸切割 DNAzyme 活性的无纳米颗粒荧光各向异性扩增测定
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.5b00479
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zhang Dapeng;Fu Rong;Zhao Qiang;Rong Haiqin;Wang Hailin
  • 通讯作者:
    Wang Hailin

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  • 发表时间:
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  • 作者:
    余方志;章大鹏;袁征;赵强;汪海林
  • 通讯作者:
    汪海林

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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