基因组印记作为宿主抗疟疾感染关键防御作用的机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81772214
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    56.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2203.寄生虫与感染
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Malaria is a disease that kills more than 1 million children annually. In endemic areas, some people die from malaria while others survive the infection. Obviously effort must be made to cut the economic and personal cost of this disease. However It has been realized that eradication of the parasite P. falciparum is an impossible task. Additionally, recent data on a phase III clinical trial for the malaria vaccine RTSS showed only 30% of protection on infants. To enhance the efficacy of the control of this deleterious disease, it will require an intimate knowledge of the host and the parasite biology. While much has been learnt about the parasite and some effort been spent on trying to understand the biology of the host response to malaria, we still only understand a small percentage of the interaction between the host and the parasite..Using a rodent model for malaria infection, we have discovered that the first generation progeny mice resulting from a cross between two inbred strains of mice (SJL/J and C3H/He) are differentially susceptible to the malaria parasite, depending on their parent of origin and regardless of their genders. Further investigations on these progeny have revealed a differential destruction of infected red blood cells in the spleen at an early stage in the course of the infection, although these mice are strictly genetically identical. Together, this suggests that the epigenetic mechanism of genomic imprinting could play a major role in determining the outcome of the malaria infection and could also impact on the efficacy of the preventive strategy in endemic areas. This proposal aims to uncover the molecular and functional mechanisms under the imprinted genes responsible for host protection to the malaria parasite.
疟疾的流行每年造成超过百万儿童的死亡,在流行地区对经济发展和个人生命财产安全带来严重影响。最近RTSS疟疾疫苗III期临床结果发现只有约百分之三十的婴幼儿受到保护,再次显示短期内根除疟原虫的流行非常困难。若想更有效地控制疟疾,需要更多地了解宿主和寄生虫的生物学特性。虽然关于寄生虫和宿主间相互作用的研究有很多,但对宿主和寄生虫间关键的相互作用知之甚少。通过小鼠疟疾模型发现,由两个近交系小鼠(SJL/J和C3H/He)杂交产生的第一代小鼠对疟疾有不同的易感性。此现象和小鼠性别无关,而由父母的品系所决定的。进一步研究发现,尽管这些小鼠在遗传背景上是相同的,它们脾脏中被感染的红细胞在疟疾感染早期却有不同的破坏程度。上述结果表明基因组印记的表观遗传机制在决定疟疾感染的临床表现中有重要作用,并可能影响流行地区所采用预防策略的效果。本研究的目的是揭示赋予宿主抗疟疾感染印记基因中的分子与功能机制。

结项摘要

疟疾每年导致超过100万儿童死亡。在疾病流行地区,一些人死于疟疾,而另一些人则在感染后幸存下来。因而消灭恶性疟原虫是一项极为艰巨的任务,必须努力降低疾病对经济和个人健康的影响。此外,疟疾疫苗RTSS的III期临床试验的最新数据显示其保护率非常有限。为了提高对这种疾病的控制效果,需要对宿主和寄生虫生物学相互作用有深入的了解。 .使用小鼠感染模型,我们发现由两种近交品系杂交产生的第一代小鼠对疟疾寄生虫的易感性不同,这主要取决于他们的亲本而与他们的性别无关。对这些子代的进一步研究表明,尽管这些小鼠的基因是相同的,但在感染过程的早期阶段,脾脏中的红细胞在感染后所受到的破坏程度不同。我们确定了100多个调控宿主控制疟疾感染的亲本特异性来源的表观遗传位点。生物信息学分析进一步聚焦到几个关键候选位点。在这些基因座中,CD44是正在研究的首选候选基因座之一。这些位点的功能表征研究结果表明:宿主通过免疫识别和溶血清除感染的红细胞抵抗疟疾感染。总之,这些现象表明在疟疾感染后,基因组印记的表观遗传机制可能在确定疾病程度方面发挥重要作用,也可能影响流行地区预防策略的有效性。该项目旨在揭示负责宿主对疟原虫感染进行保护的印记基因的分子和功能机制。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Anticipating and Identifying Collateral Damage in Genome Editing.
预测和识别基因组编辑中的附带损害
  • DOI:
    10.1016/j.tig.2020.09.011
  • 发表时间:
    2020-12
  • 期刊:
    Trends in genetics : TIG
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Burgio G;Teboul L
  • 通讯作者:
    Teboul L
Cas9 Cuts and Consequences; Detecting, Predicting, and Mitigating CRISPR/Cas9 On‐ and Off‐Target Damage
Cas9 削减和后果;
  • DOI:
    10.1002/bies.202000047
  • 发表时间:
    2020-07
  • 期刊:
    BioEssays
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Anthony Newman;Lora Starrs;Gaetan Burgio
  • 通讯作者:
    Gaetan Burgio
Gene conversion following CRISPR/Cas9 DNA cleavage: an overlooked effect
CRISPR/Cas9 DNA 切割后的基因转换:一个被忽视的效应
  • DOI:
    10.1038/s41434-020-0154-8
  • 发表时间:
    2020-04-27
  • 期刊:
    GENE THERAPY
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Burgio, Gaetan
  • 通讯作者:
    Burgio, Gaetan
Harnessing CRISPR-Cas system diversity for gene editing technologies.
利用 CRISPR-Cas 系统多样性进行基因编辑技术
  • DOI:
    10.7555/jbr.35.20200184
  • 发表时间:
    2021-03-26
  • 期刊:
    Journal of biomedical research
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Mckay A;Burgio G
  • 通讯作者:
    Burgio G
Dual RNA Sequencing Meta-analysis in Plasmodium Infection Identifies Host-Parasite Interactions.
疟原虫感染中的双 RNA 测序荟萃分析确定宿主-寄生虫相互作用
  • DOI:
    10.1128/msystems.00182-21
  • 发表时间:
    2021-04-20
  • 期刊:
    mSystems
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Mukherjee P;Burgio G;Heitlinger E
  • 通讯作者:
    Heitlinger E

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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