Pri-miRNA加工机器的筛选及功能机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31701109
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

MiRNAs (microRNAs) are a class of non-coding RNA molecules in ~22 nucleotide length. Primary microRNAs are first processed into ~70nt pre-miRNAs by Drosha/DGCR8 complex. The resulting precursor hairpins are further cleavaged by Dicer/TRBP/AGO complex in cytoplasm. Currently, the detailed composition and dynamic regulation of miRNA processing machinery in cytoplasm have been well documented. However, the architecture of Dorsha/DGCR8 processing machinery and the regulatory cascades is still unclear. In this application, we proposed to conduct an unbiased screening with CRISPR-Cas9 genome-wide knockout libraries in three pri-miRNA processing reporter cell lines, in which pri-miRNAs were inserted into the 3’UTR of green fluorescence proteins. We hope to identify new genes involed in pri-miRNA processing and further to uncover the whole architecture of miRNA processing machinery in nucleus. This proposal will decipher the regulatory cascade of miRNA processing and the pathological mechanism of abonormal miRNAs processing in cancer cells. This study may also provide a novel strategy for the diagnosis and treatment of cancer.
MiRNAs(microRNAs)是一类长度~22nt的非编码RNA,在细胞分化、个体发育和癌症发生中发挥重要作用。Pri-miRNA(primary microRNA)在细胞核内经Dorsha/DGCR8复合体加工而形成~70nt的pre-miRNA(precursor microRNA),进而在细胞质中被Dicer/TRBP/AGO复合物切割成熟。细胞质内加工机器的组成及动态调控研究比较清楚,但是细胞核内Dorsha/DGCR8加工机器的具体组份及协同调控机制尚不明了。本项目计划利用三个pri-miRNA加工的GFP报告细胞系,借助CRISPR-Cas9敲除技术在全基因组水平上筛选调控pri-miRNA加工的新基因,阐明其调控pri-miRNA加工的新机理。本项目有望解析pri-miRNA加工的精细级联调节网络,揭示癌细胞中miRNA加工异常的病理机制,为癌症的诊断和治疗提供新策略。

结项摘要

微小RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA,它们共同调节哺乳动物细胞中一半以上的蛋白质编码基因。Drosha及其辅因子DGCR8形成微处理器复合体,该复合体通过切割活性切割初级miRNA转录本(pri-miRNA)启动miRNA生物发生。这种过程的失调在癌症发展中起重要作用。尽管其重要性,但对微处理器活性的体内调节了解甚少。本项目利用pri-miR-1-2 和 pri-miR-125b-1两种GFP报告系统,通过CRISPR-Cas9全基因组筛选手段,筛选出一些miRNA加工重要的调控因子。其中,我们利用功能基因组学方法解析AQR在miRNA加工过程中的作用和功能。并且我们还发现AQR通过该机制能够抑制肾癌细胞的增殖。揭示了AQR在肾癌发生发展过程中扮演着重要的作用,从而为肾癌患者的治疗提供了新的思路和靶点。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Assessment of myoblast circular RNA dynamics and its correlation with miRNA during myogenic differentiation
成肌分化过程中成肌细胞环状RNA动力学及其与miRNA的相关性评估
  • DOI:
    10.1016/j.biocel.2018.04.016
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    International Journal of Biochemistry & Cell Biology
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Zhang Pengpeng;Xu Haixia;Li Rui;Wu Wei;Li Cencen;Wang Lei;Xu Yongjie;Chao Zhe;Xia Wei;Yang Jinzeng;Xu YJ
  • 通讯作者:
    Xu YJ
Circular RNA Regulation of Myogenesis
环状RNA对肌发生的调节
  • DOI:
    10.3390/cells8080885
  • 发表时间:
    2019-08-01
  • 期刊:
    CELLS
  • 影响因子:
    6
  • 作者:
    Zhang, Pengpeng;Chao, Zhe;Xu, Yongjie
  • 通讯作者:
    Xu, Yongjie

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
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          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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