非绝热动力学的相空间理论新模型和算法

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21573007
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

It is crucial to develop practical theoretical methods/models for studying quantum effects of both nuclear and electronics degrees of freedom in nonadiabatic dynamics of real (complex) molecular systems. A theoretical method/model for faithfully describing nonadiabatic dynamics in complex systems in thermal equilibrium should preserve thermodynamic properties of both nuclear and electronic degrees of freedom during evolution, and in the adiabatic limit should conserve the quantum Boltzmann distribution of the nuclear degrees of freedom. Most practical theoretical methods/models that can be combined with first principle electronic structure methods are not able to meet both requirements from quantum dynamics and statistics. We have recently presented a new theoretical framework in phase space formulations of quantum mechanics which leads to exact correlation functions in the classical, high-temperature, and harmonic limits and time-invariance of the quantum Boltzmann distribution of the nuclear degrees of freedom. The present proposal aims to extend our theoretical framework to nonadiabatic dynamics where two- or multi-electronic states are involved, which will initiate novel models and methodologies based on quantum phase space formulations and then provide efficient computational tools for experiment on nonadiabatic dynamics behaviors of real (complex) molecular systems.
发展用于研究实际复杂分子体系的非绝热动力学过程中量子效应的理论和实用计算方法有着极其重要的意义。准确描述复杂体系非绝热动力学的理论方法应当同时保证热平衡体系任何包括原子核和电子自由度的热力学物理量随时间的不变性,而且在绝热极限下原子核自由度的量子波尔兹曼分布函数随时间的不变性。已有的适用于和真实分子体系第一性原理电子结构方法直接结合的理论模型不能同时满足这两个基于非绝热动力学方程和量子统计力学的重要要求。申请人近期提出和完成基于量子相空间表象复杂分子体系的动力学理论和实用算法满足各种时间关联函数的量子谐振子极限和平衡体系的量子波尔兹曼分布不随时间变化,可以对真实分子体系原子核自由度的动力学和统计力学的量子效应进行合理定量描述。本项目拟将该相空间量子动力学理论进一步推广到两个或多个电子态的非绝热动力学,进而发展新的相空间理论模型和高效算法,为解释和预测实验现象和结果提供新的实用理论计算工具。

结项摘要

我们建立了一套新的多电子态哈密顿量映射模型的统一框架,可以很自然推导多种等价相空间映射模型。我们在这框架下发展出一种新的非绝热动力学方法,应用到自旋-玻色子模型体系的结果显示这个新绝热动力学方法可以在从有限温度到零温、从绝热到非绝热、从弱耦合到强耦合的大部分区域都表现良好,有望为凝聚态非绝热分子体系提供一个实用计算手段。.我们还发展了一种基于路径积分分子动力学的新多电子态量子统计力学方法,可以超越玻恩-奥本海默近似、康登近似、和谐振子热库近似。这个方法中所用到的“居中”热库方案也适用于经典力学框架下的等温系统。我们在这个基础上发展了一套适用于受约束条件或多时间尺度模拟的分子动力学高效算法。相关算法已经在分子模拟软件AMBER中实现。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A unified thermostat scheme for efficient configurational sampling for classical/quantum canonical ensembles via molecular dynamics
通过分子动力学对经典/量子正则系综进行有效构型采样的统一恒温器方案
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Chemical Physics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zhijun Zhang;Xinzijian Liu;Zifei Chen;Haifeng Zheng;Kangyu Yan;Jian Liu
  • 通讯作者:
    Jian Liu
Path integral Liouville dynamics: Applications to Infrared spectra of OH, water, ammonia, and methane
路径积分刘维尔动力学:在 OH、水、氨和甲烷的红外光谱中的应用
  • DOI:
    10.1063/1.4939953
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Chemical Physics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Liu Jian;Zhang Zhijun
  • 通讯作者:
    Zhang Zhijun
A simple and accurate algorithm for path integral molecular dynamics with the Langevin thermostat
使用 Langevin 恒温器进行路径积分分子动力学的简单而准确的算法
  • DOI:
    10.1063/1.4954990
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Chemical Physics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Liu Jian;Li Dezhang;Liu Xinzijian
  • 通讯作者:
    Liu Xinzijian
Path Integral Molecular Dynamics for Exact Quantum Statistics of Multi-Electronic-State Systems
多电子态系统精确量子统计的路径积分分子动力学
  • DOI:
    10.1063/1.5005059
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Chemical Physics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Xinzijian Liu;Jian Liu
  • 通讯作者:
    Jian Liu
A semiclassical initial‐value representation for quantum propagator and Boltzmann operator
量子传播器和玻尔兹曼算子的半经典初值表示
  • DOI:
    10.1002/jcc.25751
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of Computational Chemistry
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Yunan Yan;Jian Liu;Jiushu Shao
  • 通讯作者:
    Jiushu Shao

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  • 作者:
    刘剑;苏璞睿;杨珉;和亮;张源;朱雪阳;林惠民
  • 通讯作者:
    林惠民

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刘剑的其他基金

化学新前沿学术研讨会
  • 批准号:
    21981260443
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    国际(地区)合作与交流项目
凝聚态体系的新路径积分和半经典理论方法
  • 批准号:
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  • 资助金额:
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  • 项目类别:
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  • 批准号:
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  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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