MiR-143/145宿主基因CARMN低表达参与宫颈癌遗传易感及其机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81872684
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

LncRNA CARMN is a host gene for miR-143/145, the most studied tumor suppressor miRNAs, which is low in most tumors, including cervical cancer (CC). The molecular mechanism underlying the underexpression of CARMN is instructive for elucidating the important biological role of miR-143/145. The literature reports that CARMN may be decreased expressed at the transcriptional and post-transcriptional levels. In the previous study, we identified the functional SNP rs12517403 in the promoter region of CARMN, which can influence gene transcription by affecting the binding of transcription factor; RNA pull-down combined with LS-MS/MS identified a batch of RNA-binding proteins, such as DDX3X, RBM8A, which are binding to CARMN and predicted to affect RNA stability of CARMN. Evidence shows that miR-143/145 inhibit and promote proliferation and apoptosis of CC cells, respectively. However, the exact signaling pathways involved have not yet been elucidated. The project intends to further explore the molecular mechanisms of rs12517403 regulating CARMN transcription; identify RBPs that can affect the stability of CARMN transcripts and elucidate their regulatory mechanisms; explore the pathways through which CARMN and its producing miR-143/145 regulate proliferation and apoptosis of CC cell; screen functional SNPs of CARMN, RBPs, and key molecules of signaling pathways, explore their association with susceptibility of CC and underlying molecular mechanisms, and determine their potential as biomarkers for CC susceptibility.
LncRNA CARMN是抑癌miRNAs miR-143/145的宿主基因,在大多数肿瘤包括宫颈癌中低表达。研究提示CARMN可在转录和转录后水平低表达。课题组前期研究筛选出CARMN启动子区可影响基因转录SNP rs12517403;RNA pull-down联合LS-MS/MS筛选出可能影响CARMN转录本稳定性的RNA结合蛋白(RBPs)如DDX3X、RBM8A。研究证实miR-143/145抑制宫颈癌细胞增殖、促进凋亡,但通过何种信号通路尚未阐明。本课题拟继续深入探讨rs12517403调控CARMN转录的分子机制;鉴定可影响CARMN转录本稳定性的RBPs并阐明其调控机制;探讨CARMN、miR-143/145通过何种信号通路调控细胞增殖和凋亡;寻找CARMN、RBPs、信号通路关键分子的功能SNPs,探讨其作为宫颈癌遗传易感的生物标志的可能性。

结项摘要

LncRNA CARMN在宫颈癌中显著下调,但其下调机制以及在宫颈癌中的生物功能尚不明确。本研究通过收集宫颈癌人群和健康对照人群宫颈组织进行全转录组测序分析发现CARMN是宫颈癌变过程中的关键基因,其在宫颈癌变过程中逐步下调。本研究中CARMN在宫颈癌中下调的机制通过转录水平和转录后水平分别探讨。在转录层面,与野生型T等位基因相比,SNP rs12517403 C等位基因可降低转录因子SP1与CARMN启动子区结合亲和力,并抑制CARMN转录活性。在转录后水平上,YBX1的减少可降低CARMN的稳定性,DHX9在此过程中充当了连接的支架。此外,DHX9的dsRBD I/II结构域和解旋酶核心结构域增强了与CARMN 561-754nt序列的结合亲和力。随后我们探究了CARMN在宫颈癌中的作用机制,结果发现,CARMN可显著增强胞浆中Keap1/Nrf2的相互作用,从而加速了泛素介导的Nrf2降解,减少了Nrf2的核异位,进而减少了抗氧化相关基因的表达,并最终引起宫颈癌细胞内活性氧(ROS)水平的升高。此外,升高的ROS可抑制Akt/mTOR信号通路,通过自噬通量阻断导致宫颈癌细胞自噬停滞并引起细胞周期停滞和细胞凋亡,最终降低宫颈癌细胞增殖和集落形成能力。CARMN还可通过与转录因子TFAP2α直接结合,抑制MAPK13的转录激活,进而抑制MAPK级联,最终也可发挥抗肿瘤作用。该研究的发现对于宫颈癌的临床诊治和预防具有一定的指导意义。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Comprehensive analysis of prognosis-related alternative splicing events in ovarian cancer
卵巢癌预后相关选择性剪接事件的综合分析
  • DOI:
    10.1080/17449057.2014.942063
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Taylor & Francis
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Shizhi Wang;Shiyuan Wang;Xing Zhang;Dan Meng;Qianqian Xia;Shuqian Xie;Siyuan Shen;Bingjia Yu;Jing Hu;Haohan Liu;Wenjing Yan
  • 通讯作者:
    Wenjing Yan
Prognosis prediction signature of seven immune genes based on HPV status in cervical cancer
基于HPV状态的七个免疫基因的预后预测特征在宫颈癌中的应用
  • DOI:
    10.1016/j.intimp.2020.106935
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    International Immunopharmacology
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Qianqian Xia;Hua Jin;Xing Zhang;Wenjing Yan;Dan Meng;Bo Ding;Jian Cao;Dake Li;Shizhi Wang
  • 通讯作者:
    Shizhi Wang
Development and Validation of a Tumor Mutation Burden-Related Immune Prognostic Signature for Ovarian Cancers
卵巢癌肿瘤突变负担相关免疫预后特征的开发和验证
  • DOI:
    10.3389/fgene.2021.688207
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in Genetics
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Cui M;Xia Q;Zhang X;Yan W;Meng D;Xie S;Shen S;Jin H;Wang S
  • 通讯作者:
    Wang S
Construction of hypoxia-immune-related prognostic model and targeted therapeutic strategies for cervical cancer
宫颈癌缺氧免疫相关预后模型的构建及靶向治疗策略
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    International Immunology
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Shuqian Xie;Bo Ding;Shiyuan Wang;Wenjing Yan;Qianqian Xia;Dan Meng;Xing Zhang;Siyuan Shen;Bingjia Yu;Haohan Liu;Jing Hu;Shizhi Wang
  • 通讯作者:
    Shizhi Wang
Fanconi Anemia Pathway Genes Advance Cervical Cancer via Immune Regulation and Cell Adhesion
范可尼贫血途径基因通过免疫调节和细胞粘附促进宫颈癌
  • DOI:
    10.3389/fcell.2021.734794
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in Cell and Developmental Biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Wang S;Ding B;Cui M;Yan W;Xia Q;Meng D;Shen S;Xie S;Jin H;Zhang X
  • 通讯作者:
    Zhang X

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王适之的其他基金

miR-143基因启动子区遗传变异影响基因转录调控机制及与宫颈癌发生危险性的研究
  • 批准号:
    81302502
  • 批准年份:
    2013
  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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